More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2947 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2947  2-alkenal reductase  100 
 
 		 374 aa  723    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3040  2-alkenal reductase  53.87 
 
 		 375 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0397571 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3736  2-alkenal reductase  53.15 
 
 		 399 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2249  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.22 
 
 		 388 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1127  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.7 
 
 		 366 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0664983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3217  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.15 
 
 		 387 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.557937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0793  2-alkenal reductase  50.43 
 
 		 376 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.323454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4575  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  53.43 
 
 		 375 aa  299  4e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  47.59 
 
 		 469 aa  290  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  44.79 
 
 		 368 aa  283  4.0000000000000003e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4798  2-alkenal reductase  51.31 
 
 		 381 aa  281  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  45.07 
 
 		 375 aa  280  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5265  2-alkenal reductase  51.31 
 
 		 381 aa  281  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5341  2-alkenal reductase  49.72 
 
 		 381 aa  280  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0382  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.82 
 
 		 377 aa  279  5e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34875  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1725  serine protease, putative  47.35 
 
 		 374 aa  276  5e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  47.93 
 
 		 383 aa  273  3e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2308  2-alkenal reductase  47.93 
 
 		 383 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46320  serine peptidase  47.66 
 
 		 365 aa  273  5.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.497554  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0614  2-alkenal reductase  48.22 
 
 		 383 aa  272  6e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1158  DegP2 peptidase  47.63 
 
 		 384 aa  271  9e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3387  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.22 
 
 		 384 aa  271  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848439  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  46.76 
 
 		 374 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2015  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.78 
 
 		 383 aa  266  4e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.96 
 
 		 372 aa  259  7e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  42.78 
 
 		 396 aa  253  5.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1540  protease  50.47 
 
 		 344 aa  241  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107774  normal  0.168358 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2130  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.5 
 
 		 368 aa  236  6e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0935  hypothetical protein  41.03 
 
 		 363 aa  234  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0965  hypothetical protein  40.73 
 
 		 363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.35 
 
 		 399 aa  227  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46875  predicted protein  40.69 
 
 		 466 aa  216  4e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_3562  predicted protein  38.69 
 
 		 329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  39.25 
 
 		 389 aa  211  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1750  2-alkenal reductase  41.39 
 
 		 418 aa  207  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137948  normal  0.435495 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0594  2-alkenal reductase  37.2 
 
 		 379 aa  204  2e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.87 
 
 		 366 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2119  2-alkenal reductase  40.42 
 
 		 418 aa  204  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1966  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  38.84 
 
 		 425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000431561  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31732  predicted protein  38.21 
 
 		 368 aa  194  1e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2857  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.21 
 
 		 394 aa  195  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1146  2-alkenal reductase  37.77 
 
 		 374 aa  194  1e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0676  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.16 
 
 		 426 aa  190  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.146995  normal  0.128944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.97 
 
 		 423 aa  188  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  42.36 
 
 		 483 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  42.36 
 
 		 483 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1673  2-alkenal reductase  33.53 
 
 		 381 aa  187  4e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0935  2-alkenal reductase  38.14 
 
 		 400 aa  186  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000784268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3226  2-alkenal reductase  37.21 
 
 		 403 aa  186  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.65 
 
 		 387 aa  183  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  39.34 
 
 		 467 aa  182  7e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21640  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  37.7 
 
 		 417 aa  181  2.9999999999999997e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00345268  normal  0.0571371 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  39.79 
 
 		 511 aa  179  8e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0552  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.4 
 
 		 423 aa  179  9e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2179  protease Do  40.5 
 
 		 494 aa  178  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  38.81 
 
 		 392 aa  177  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  43.26 
 
 		 404 aa  176  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  43.26 
 
 		 404 aa  176  8e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  38.51 
 
 		 483 aa  176  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2497  protease Do  39.45 
 
 		 488 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  37.92 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2221  protease Do  39.45 
 
 		 488 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.370789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.66 
 
 		 386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  33.69 
 
 		 369 aa  173  5e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0470  protease Do  39.87 
 
 		 471 aa  173  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102018  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  39.72 
 
 		 508 aa  173  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0459  2-alkenal reductase  36.99 
 
 		 584 aa  172  5.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  36.76 
 
 		 393 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4435  trypsin domain protein  40.86 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  42.49 
 
 		 398 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  39.35 
 
 		 453 aa  171  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  38.52 
 
 		 453 aa  170  4e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1943  2-alkenal reductase  35.71 
 
 		 418 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.768183 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1064  protease DO  34.03 
 
 		 467 aa  170  4e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0185007  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  40.29 
 
 		 383 aa  170  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0324  HtrA2 peptidase  32.68 
 
 		 413 aa  170  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  38.63 
 
 		 473 aa  169  6e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3659  2-alkenal reductase  39.41 
 
 		 341 aa  169  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149627  normal  0.297116 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0885  PDZ/DHR/GLGF  36.47 
 
 		 375 aa  169  8e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  39.58 
 
 		 403 aa  169  9e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  43.09 
 
 		 385 aa  169  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  38.41 
 
 		 476 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1344  trypsin  35.69 
 
 		 594 aa  168  1e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0379667 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.04 
 
 		 381 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4130  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  39.78 
 
 		 386 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  41.7 
 
 		 464 aa  168  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  38.65 
 
 		 496 aa  167  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  40.29 
 
 		 511 aa  168  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  35.78 
 
 		 456 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  34.28 
 
 		 472 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  40.43 
 
 		 396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.4 
 
 		 388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  38.2 
 
 		 452 aa  166  4e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.96 
 
 		 545 aa  167  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331753  normal  0.316507 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  36.3 
 
 		 504 aa  166  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  35.74 
 
 		 497 aa  166  5e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1718  protease Do  37.21 
 
 		 471 aa  166  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  40.07 
 
 		 492 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.86 
 
 		 384 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>