More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2314 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2314  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 293 aa  574  1.0000000000000001e-163  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1244  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  59.04 
 
 		 330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3244  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  56.7 
 
 		 321 aa  288  6e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3890  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  56.78 
 
 		 317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.283543 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1064  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  56.4 
 
 		 321 aa  276  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.235615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4479  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  53.15 
 
 		 307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.4 
 
 		 366 aa  142  8e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.39 
 
 		 385 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  44.91 
 
 		 469 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0424  2-alkenal reductase  39.65 
 
 		 444 aa  135  9e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943038  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  48.19 
 
 		 513 aa  134  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  43.93 
 
 		 374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  43.09 
 
 		 459 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5142  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  45.45 
 
 		 614 aa  133  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309432  normal  0.441282 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0807  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36 
 
 		 398 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2667  exported serine protease  37.9 
 
 		 455 aa  132  5e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0124774  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  46.33 
 
 		 383 aa  132  6e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24150  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  44.77 
 
 		 515 aa  132  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.03 
 
 		 545 aa  132  9e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331753  normal  0.316507 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  42.21 
 
 		 398 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  36.43 
 
 		 407 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  37.4 
 
 		 392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  45.93 
 
 		 383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.44 
 
 		 398 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  36.58 
 
 		 407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.51 
 
 		 379 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.09 
 
 		 380 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1605  2-alkenal reductase  44.89 
 
 		 385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436797 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  47.09 
 
 		 379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  46.99 
 
 		 385 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  38.08 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  43.98 
 
 		 453 aa  131  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0580  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.36 
 
 		 361 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1158  DegP2 peptidase  45.03 
 
 		 384 aa  130  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1505  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.1 
 
 		 387 aa  130  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.98947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  44.69 
 
 		 475 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  47.09 
 
 		 389 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0935  2-alkenal reductase  44.25 
 
 		 400 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000784268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  41.99 
 
 		 442 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6224  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.75 
 
 		 283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.837533  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  38.08 
 
 		 404 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16121  trypsin-like serine protease  46.24 
 
 		 370 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.89 
 
 		 316 aa  129  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4062  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.38 
 
 		 524 aa  129  8.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  45.86 
 
 		 465 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  39.08 
 
 		 403 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  43.75 
 
 		 386 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1183  HtrA2 peptidase  43.93 
 
 		 386 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  40.5 
 
 		 396 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.7 
 
 		 372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  38.15 
 
 		 387 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0614  2-alkenal reductase  44.44 
 
 		 383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2308  2-alkenal reductase  44.44 
 
 		 383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0806  putative cryptic C4-dicarboxylate transporter DcuD  46.01 
 
 		 468 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00374438  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  43.17 
 
 		 423 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18911  trypsin-like serine protease  43.53 
 
 		 381 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.58243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1021  trypsin-like serine protease  43.53 
 
 		 381 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.75122  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  42.22 
 
 		 458 aa  127  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  44.77 
 
 		 403 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  37.1 
 
 		 388 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  37.75 
 
 		 402 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  44.44 
 
 		 383 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.37 
 
 		 674 aa  126  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  37.5 
 
 		 481 aa  126  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  37.1 
 
 		 402 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0123  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.84 
 
 		 390 aa  126  5e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  43.26 
 
 		 578 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3387  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.44 
 
 		 384 aa  126  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848439  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1725  serine protease, putative  44.91 
 
 		 374 aa  125  6e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  44.38 
 
 		 375 aa  125  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  39.23 
 
 		 453 aa  125  7e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0845  peptidase S1  43.71 
 
 		 471 aa  125  7e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2221  HtrA2 peptidase  44 
 
 		 372 aa  125  7e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0662653  normal  0.181981 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  37.1 
 
 		 388 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3776  PDZ/DHR/GLGF  44.71 
 
 		 483 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  37.1 
 
 		 402 aa  125  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  37.1 
 
 		 402 aa  125  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0112  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.36 
 
 		 450 aa  125  9e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542288  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  37.1 
 
 		 402 aa  125  9e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.37 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21640  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  43.98 
 
 		 417 aa  124  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00345268  normal  0.0571371 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.22 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.93 
 
 		 384 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.62 
 
 		 351 aa  125  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  37.92 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  43.79 
 
 		 456 aa  124  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0764  peptidase S1C, Do  42.33 
 
 		 471 aa  125  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000251476  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32730  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  43.53 
 
 		 443 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  43.75 
 
 		 588 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  44.97 
 
 		 455 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  45.73 
 
 		 483 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0073  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.98 
 
 		 474 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  45.73 
 
 		 483 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0073  2-alkenal reductase  45.18 
 
 		 459 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0754695 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07340  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  42.29 
 
 		 552 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.191801 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  36.29 
 
 		 401 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.29 
 
 		 401 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0016  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.21 
 
 		 401 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  42.69 
 
 		 463 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  36.29 
 
 		 401 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>