117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0511 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0511  transcriptional regulator  100 
 
 		 143 aa  291  1e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1573  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0165267  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0017  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11880  transcriptional regulator  25.58 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4708  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.155133  decreased coverage  0.00302291 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4923  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3631  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3846  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  29.25 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0194  transcriptional regulator, MarR family  25.6 
 
 		 155 aa  47.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 166 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  29.21 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  25.35 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1082  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 141 aa  45.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000105511  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  25.93 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  29.29 
 
 		 168 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  24.6 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 168 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6224  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3747  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 181 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0512718  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3367  transcriptional regulator, MarR family  25.25 
 
 		 154 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 166 aa  43.9  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 158 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4279  transcriptional regulator, MarR family  25.69 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0560787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 205 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  28.35 
 
 		 324 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  20.18 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 177 aa  42  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  25.47 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  24.14 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3041  MarR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 140 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0382  MarR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0392  regulatory protein MarR  24.73 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 152 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 165 aa  41.6  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 143 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0801  transcriptional regulator, MarR family  28.42 
 
 		 167 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0995483  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  23.62 
 
 		 155 aa  42  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0037  transcriptional regulator, MarR family  37.68 
 
 		 144 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  23.17 
 
 		 173 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  22.88 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 162 aa  41.2  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2635  transcriptional regulator, MarR family  23.6 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  25.47 
 
 		 150 aa  41.2  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  25.47 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  22.14 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  23.91 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4486  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.021686  normal  0.0998703 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4809  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 198 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.752918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 169 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2746  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  26.39 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0805  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 167 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0754  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 167 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.853985  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 160 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.43 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.43 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.43 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.43 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.43 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1954  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 154 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>