More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_26900 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  100 
 
 
160 aa  325  1.0000000000000001e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  62.07 
 
 
174 aa  174  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  56 
 
 
182 aa  173  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  58.04 
 
 
166 aa  172  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  59.31 
 
 
158 aa  170  9e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  58.04 
 
 
205 aa  161  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  57.55 
 
 
203 aa  159  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  58.27 
 
 
206 aa  158  4e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  55.7 
 
 
182 aa  155  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  51.39 
 
 
430 aa  152  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  55.78 
 
 
219 aa  147  5e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  49.31 
 
 
258 aa  143  8.000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  53.15 
 
 
272 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  53.96 
 
 
174 aa  137  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  49.65 
 
 
270 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  49.65 
 
 
270 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  49.65 
 
 
270 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  50 
 
 
169 aa  128  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  48.25 
 
 
282 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  53.24 
 
 
151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  50 
 
 
248 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  51.82 
 
 
158 aa  124  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  47.89 
 
 
268 aa  123  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  45.14 
 
 
302 aa  117  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  49.24 
 
 
141 aa  107  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  43.36 
 
 
164 aa  89  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 
150 aa  88.2  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  33.81 
 
 
142 aa  87.8  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 
149 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 
147 aa  84  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1029  NUDIX hydrolase  40.94 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  34.45 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2468  NUDIX hydrolase  32.47 
 
 
172 aa  67.8  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0192019  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  35 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  39 
 
 
302 aa  64.3  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  33.99 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  36.51 
 
 
308 aa  63.2  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 
299 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 
310 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
129 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  33.83 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.12 
 
 
583 aa  61.6  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 
144 aa  61.6  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2333  NUDIX hydrolase  32.87 
 
 
143 aa  61.6  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  33.57 
 
 
317 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0812  NUDIX hydrolase  26.81 
 
 
140 aa  61.2  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00112519  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.35 
 
 
315 aa  60.1  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
141 aa  59.7  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
536 aa  59.7  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 
146 aa  58.9  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  34.75 
 
 
301 aa  58.2  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0179  NUDIX hydrolase  25.36 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0431401  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1993  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
142 aa  57  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3705  mutT/nudix family protein  27.2 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 
140 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 
311 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 
315 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  33.81 
 
 
303 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 
311 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 
311 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3688  mutT/nudix family protein  27.35 
 
 
137 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.237209 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3460  mutT/nudix family protein  27.35 
 
 
137 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284792  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3377  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  27.35 
 
 
137 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3732  mutT/nudix family protein  27.35 
 
 
137 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 
139 aa  55.5  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
289 aa  55.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 
208 aa  55.1  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 
159 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_002620  TC0152  mutT/Nudix family protein  36.54 
 
 
150 aa  54.7  0.0000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  35.78 
 
 
336 aa  54.7  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  32.59 
 
 
140 aa  54.7  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  35.24 
 
 
154 aa  54.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  32.39 
 
 
325 aa  54.3  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2635  hypothetical protein  37.21 
 
 
313 aa  54.3  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  33.68 
 
 
149 aa  53.9  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2406  NUDIX hydrolase  25.55 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  33.64 
 
 
141 aa  53.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1108  mutT/nudix family protein  33.68 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.979518  normal  0.39926 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
140 aa  53.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3357  NUDIX hydrolase  26.5 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.387948  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 
132 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  31.39 
 
 
140 aa  53.1  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  33.68 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1264  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.879303 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 
136 aa  53.1  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  31.08 
 
 
424 aa  52.4  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3933  mutT/nudix family protein  28.33 
 
 
161 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3781  MutT/Nudix family protein  28.33 
 
 
161 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  28.47 
 
 
133 aa  52  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05631  hypothetical protein  26.09 
 
 
150 aa  52.4  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4044  mutT/nudix family protein  28.33 
 
 
149 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>