224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4466 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4466  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 179 aa  343  7e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.120137  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  37.8 
 
 		 152 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  26 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  26 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 152 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  25.33 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  25.33 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1224  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 151 aa  51.2  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414695  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0777  MarR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 194 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 165 aa  50.8  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0781  MarR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 194 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0796  MarR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 194 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 		 173 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  26.35 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 163 aa  49.3  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 163 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  29.85 
 
 		 159 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 162 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 158 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 162 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0246  transcriptional regulator, MarR family  26.87 
 
 		 144 aa  48.5  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 141 aa  48.1  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 162 aa  48.1  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26700  transcriptional regulator  36.78 
 
 		 166 aa  48.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347504  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 172 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 158 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 167 aa  47.8  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  29.77 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 154 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  37.08 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0684  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 169 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232465 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 		 177 aa  47  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  27.89 
 
 		 177 aa  47  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 160 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 151 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  34.25 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 168 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0109  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 141 aa  46.6  0.0002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.701478  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  36.67 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 171 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  29.63 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  25.44 
 
 		 153 aa  45.8  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3385  transcriptional regulator, MarR family  32.87 
 
 		 147 aa  45.8  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.824794  hitchhiker  0.00000813466 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  32.41 
 
 		 191 aa  45.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1105  transcriptional regulator, MarR family  41.11 
 
 		 147 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00926589  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 172 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 139 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  29.01 
 
 		 140 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  41.11 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 147 aa  45.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 164 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 155 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 139 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  29 
 
 		 156 aa  45.4  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 141 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  34.12 
 
 		 154 aa  45.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 139 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 159 aa  45.8  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 151 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 181 aa  45.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5709  MarR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 176 aa  45.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 170 aa  45.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1188  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 167 aa  45.1  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  45.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 150 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  28.05 
 
 		 154 aa  44.7  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>