265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3282 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  100 
 
 
451 aa  877    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5634  amine oxidase, flavin-containing  43.84 
 
 
407 aa  270  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  40.66 
 
 
448 aa  248  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  41.75 
 
 
418 aa  244  3e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  40.53 
 
 
423 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3364  amine oxidase  44.01 
 
 
414 aa  222  9e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.154637  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  41.65 
 
 
415 aa  220  3e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  34.02 
 
 
468 aa  216  9e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  40.86 
 
 
394 aa  208  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5169  amine oxidase  37.74 
 
 
433 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  33.18 
 
 
426 aa  188  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  37.38 
 
 
433 aa  186  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1724  amine oxidase  31.73 
 
 
470 aa  181  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  32.86 
 
 
438 aa  179  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  35.16 
 
 
420 aa  171  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3418  amine oxidase  37.59 
 
 
413 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3795  amine oxidase  35.01 
 
 
413 aa  160  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1312  amine oxidase  34.81 
 
 
446 aa  160  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1137  amine oxidase  34.88 
 
 
436 aa  159  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.858264  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  32.88 
 
 
437 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  34.21 
 
 
410 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4664  amine oxidase  38.25 
 
 
418 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.636911  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  31.79 
 
 
455 aa  139  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2885  amine oxidase  33.49 
 
 
418 aa  134  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.748132  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  29.45 
 
 
425 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2442  amine oxidase  33.96 
 
 
427 aa  131  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  31.36 
 
 
431 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  30.05 
 
 
428 aa  121  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23220  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  32.4 
 
 
464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  42.48 
 
 
444 aa  60.1  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  29.89 
 
 
445 aa  59.7  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  30.37 
 
 
456 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  33.56 
 
 
344 aa  58.2  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  35.2 
 
 
469 aa  57.4  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0581  amine oxidase  29.81 
 
 
413 aa  57  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  47.37 
 
 
359 aa  56.6  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  44.44 
 
 
354 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  43.42 
 
 
447 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  34.62 
 
 
346 aa  55.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 
523 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  45.45 
 
 
421 aa  55.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  41.03 
 
 
419 aa  54.7  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  50.85 
 
 
463 aa  55.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  25.18 
 
 
485 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  42.65 
 
 
645 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  40.86 
 
 
313 aa  53.9  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  45.68 
 
 
509 aa  53.9  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  34.95 
 
 
647 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  34.95 
 
 
647 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1781  amine oxidase  31.58 
 
 
367 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524453  normal  0.068532 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  34.69 
 
 
647 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  36.61 
 
 
450 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  41.18 
 
 
319 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  36.61 
 
 
450 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  35 
 
 
456 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  42.19 
 
 
492 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  36.13 
 
 
407 aa  52.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  26.34 
 
 
487 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  43.75 
 
 
496 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3760  FAD dependent oxidoreductase  58 
 
 
524 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00569391 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  27.16 
 
 
472 aa  51.2  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  41.79 
 
 
470 aa  51.6  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  32.1 
 
 
599 aa  51.6  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  35.37 
 
 
624 aa  51.6  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  54 
 
 
498 aa  51.2  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  38.71 
 
 
548 aa  50.8  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  41.43 
 
 
381 aa  50.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  49.12 
 
 
462 aa  50.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0117  amine oxidase  28.8 
 
 
410 aa  50.8  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8119  L-amino-acid oxidase  47.46 
 
 
520 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.922273  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4005  FAD dependent oxidoreductase  56 
 
 
516 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665607  hitchhiker  0.00234507 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  41.07 
 
 
361 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  38.36 
 
 
469 aa  50.4  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  25.08 
 
 
419 aa  50.4  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1331  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 
531 aa  50.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  36.27 
 
 
438 aa  50.1  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  45.1 
 
 
436 aa  50.1  0.00009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  30.16 
 
 
476 aa  50.1  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  38.55 
 
 
547 aa  50.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  43.55 
 
 
460 aa  50.1  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  41.07 
 
 
434 aa  50.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  25.48 
 
 
485 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  38.84 
 
 
459 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  46.3 
 
 
519 aa  49.3  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  49.02 
 
 
245 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  43.94 
 
 
342 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  38.46 
 
 
456 aa  49.3  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  43.94 
 
 
342 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  42.86 
 
 
492 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  47.46 
 
 
457 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3827  phytoene desaturase  48.39 
 
 
489 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  26.96 
 
 
490 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  43.94 
 
 
342 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  44.44 
 
 
506 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0882  flavin monoamine oxidase family protein  35.29 
 
 
387 aa  49.7  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1006  amine oxidase  35.29 
 
 
387 aa  49.7  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.74329  hitchhiker  0.00000000109904 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  25.48 
 
 
490 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1750  hypothetical protein  37.63 
 
 
313 aa  49.7  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  25.96 
 
 
487 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  25.48 
 
 
490 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>