More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1003 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1003  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
251 aa  490  1e-137  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2688  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  67.21 
 
 
301 aa  324  7e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  70.18 
 
 
258 aa  318  5e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0226  TPR repeat-containing protein  64.68 
 
 
294 aa  307  1.0000000000000001e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1826  TPR repeat-containing protein  65.82 
 
 
289 aa  301  6.000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  35.15 
 
 
927 aa  85.5  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.28 
 
 
1276 aa  85.1  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 
452 aa  81.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  29.67 
 
 
745 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  35.71 
 
 
1694 aa  79  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 
543 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  31.87 
 
 
573 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  33.82 
 
 
523 aa  77.4  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  31.7 
 
 
3035 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 
602 aa  76.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 
344 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 
244 aa  74.7  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  31.71 
 
 
1979 aa  73.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  29.73 
 
 
743 aa  73.9  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 
1297 aa  72.4  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 
366 aa  70.9  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.97 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 
465 aa  69.7  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.28 
 
 
397 aa  69.7  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  38 
 
 
1007 aa  69.7  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
878 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 
699 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 
280 aa  69.3  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.44 
 
 
818 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  33.78 
 
 
667 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  33.96 
 
 
417 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 
363 aa  67.8  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.58 
 
 
1056 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.15 
 
 
810 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
3560 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.15 
 
 
784 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 
301 aa  67  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  29.56 
 
 
560 aa  66.6  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  31.45 
 
 
4079 aa  66.2  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.88 
 
 
632 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.46 
 
 
784 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  37.39 
 
 
503 aa  65.5  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.67 
 
 
730 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  36.04 
 
 
639 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 
761 aa  65.1  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 
250 aa  65.1  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 
1192 aa  65.1  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  34.51 
 
 
162 aa  63.9  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  36.04 
 
 
612 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
1827 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 
279 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 
213 aa  64.3  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 
591 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.99 
 
 
1022 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
512 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 
471 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0990  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.43 
 
 
410 aa  63.5  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113297  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.06 
 
 
836 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.3 
 
 
707 aa  62.8  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  33.91 
 
 
314 aa  62.8  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  24 
 
 
329 aa  62.4  0.000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  31.15 
 
 
1138 aa  62.4  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  30.08 
 
 
581 aa  62.4  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  32.06 
 
 
1067 aa  62.4  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 
636 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0908  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 
388 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2742  tetratricopeptide TPR_2  25.85 
 
 
390 aa  62.4  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.890739  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  31.93 
 
 
623 aa  62  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 
388 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 
716 aa  62  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 
711 aa  62  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02750  cytoplasm protein, putative  25.77 
 
 
338 aa  61.6  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 
562 aa  61.6  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 
617 aa  61.2  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  41.86 
 
 
340 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  32.77 
 
 
462 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.26 
 
 
292 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  31.13 
 
 
622 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 
688 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.2 
 
 
406 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.2 
 
 
406 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1509  tetratricopeptide TPR_2  30.53 
 
 
341 aa  60.5  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  27.32 
 
 
576 aa  60.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2934  tetratricopeptide TPR_2  30 
 
 
135 aa  61.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000970662  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0216  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 
296 aa  60.8  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  34.23 
 
 
611 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  34.23 
 
 
635 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  34.23 
 
 
635 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
3145 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 
486 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  35.51 
 
 
550 aa  60.1  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 
352 aa  60.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  26.44 
 
 
252 aa  60.1  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 
1486 aa  60.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  28.57 
 
 
708 aa  59.7  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 
4489 aa  60.1  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0017  tetratricopeptide TPR_3  30.16 
 
 
407 aa  59.7  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>