129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4180 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  100 
 
 
297 aa  604  9.999999999999999e-173  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  40.62 
 
 
304 aa  204  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  41.35 
 
 
295 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  41.02 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2837  3-oxoadipate CoA-transferase  39.76 
 
 
271 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351609  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4309  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit A  35.79 
 
 
285 aa  168  9e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7928  3-oxoadipate CoA-transferase  37.69 
 
 
273 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.327959 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4013  glutaconate CoA-transferase  35.42 
 
 
285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  35.32 
 
 
285 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  39.53 
 
 
276 aa  163  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  35.48 
 
 
283 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  35.48 
 
 
283 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  36.16 
 
 
289 aa  161  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  33.77 
 
 
332 aa  159  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3046  coenzyme A transferase  33.7 
 
 
271 aa  158  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.94721  normal  0.612276 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0299  coenzyme A transferase  33.94 
 
 
273 aa  155  6e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  38.72 
 
 
265 aa  152  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1584  glutaconate CoA-transferase  36.86 
 
 
286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.803865  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2823  coenzyme A transferase  35.46 
 
 
285 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  31.99 
 
 
305 aa  138  8.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  33.11 
 
 
326 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  37.87 
 
 
313 aa  135  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  29.41 
 
 
322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  29.93 
 
 
325 aa  132  9e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  31.65 
 
 
305 aa  129  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  32.18 
 
 
325 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  32.35 
 
 
317 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  32 
 
 
329 aa  119  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  32.42 
 
 
269 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1709  coenzyme A transferase  32.04 
 
 
321 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2825  coenzyme A transferase  32.88 
 
 
320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  33.05 
 
 
268 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1387  coenzyme A transferase  32.19 
 
 
320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  33.21 
 
 
281 aa  112  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3035  glutaconate CoA-transferase  32.06 
 
 
321 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  28.91 
 
 
268 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1221  coenzyme A transferase  32.7 
 
 
272 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  28.46 
 
 
599 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1076  coenzyme A transferase  32.23 
 
 
272 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1203  putative CoA transferase, subunit A  31.72 
 
 
272 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.917021 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  34.03 
 
 
276 aa  95.9  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  27.43 
 
 
299 aa  95.1  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  30.15 
 
 
296 aa  94  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  31.47 
 
 
251 aa  93.2  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  27.92 
 
 
291 aa  93.2  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  29.06 
 
 
276 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  28.63 
 
 
272 aa  89.7  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  28.74 
 
 
280 aa  89.4  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  30.71 
 
 
298 aa  89.4  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  28.74 
 
 
280 aa  89.4  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  31.25 
 
 
302 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  28.04 
 
 
286 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  28.47 
 
 
289 aa  85.9  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  31.09 
 
 
293 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  31.47 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  29.86 
 
 
295 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  29.86 
 
 
295 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2561  coenzyme A transferase  28.12 
 
 
331 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  29.8 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  26.28 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  29.17 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  30.88 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  25.82 
 
 
300 aa  79.3  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  26.89 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  26.79 
 
 
297 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  30.3 
 
 
293 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  27.37 
 
 
292 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  29.39 
 
 
590 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  28.11 
 
 
297 aa  64.7  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  29.23 
 
 
463 aa  56.2  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7914  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.87 
 
 
240 aa  53.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4164  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.41 
 
 
235 aa  53.1  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01941  putative succinyl-CoA transferase, alpha subunit  27.69 
 
 
235 aa  52.4  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.546528  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.82 
 
 
235 aa  52  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0572  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  29.11 
 
 
235 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0035741  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.76 
 
 
272 aa  50.8  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2803  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.12 
 
 
244 aa  50.8  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.460445  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0351  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.57 
 
 
236 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.901849  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2504  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  25.69 
 
 
263 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.361118  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1477  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.29 
 
 
234 aa  48.5  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0128919  normal  0.171339 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2060  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.15 
 
 
236 aa  48.5  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0491  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.37 
 
 
246 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2575  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.41 
 
 
233 aa  48.1  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2919  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.89 
 
 
245 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03175  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A  28.21 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.840369  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3145  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.89 
 
 
245 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1598  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, alpha subunit  27.39 
 
 
239 aa  47.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.844563  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  24.87 
 
 
237 aa  47.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2732  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.38 
 
 
234 aa  47  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2257  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.39 
 
 
233 aa  46.6  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1453  3-oxoacid CoA-transferase  25.41 
 
 
237 aa  47  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00126643  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3043  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.38 
 
 
255 aa  47  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1406  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.19 
 
 
255 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000850531 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0590  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.74 
 
 
232 aa  46.6  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4356  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.87 
 
 
229 aa  46.2  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3591  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  24.23 
 
 
276 aa  46.2  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  24.37 
 
 
237 aa  45.8  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1472  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  25.24 
 
 
220 aa  45.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.146026  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38660  putative CoA transferase, subunit A  27.27 
 
 
232 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0518  3-oxoacid CoA-transferase  24.76 
 
 
253 aa  45.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.368438 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>