More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3002 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3002  response regulator receiver protein  100 
 
 		 144 aa  291  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24335  normal  0.317219 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4971  response regulator receiver and unknown domain protein  35.77 
 
 		 137 aa  88.6  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148199  normal  0.258771 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2432  response regulator, CheY-like  36.03 
 
 		 132 aa  80.1  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3547  response regulator receiver protein  41.73 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5225  response regulator receiver protein  38.24 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3681  response regulator receiver  35.71 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1993  response regulator receiver protein  36.5 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156439  hitchhiker  0.00339677 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0136  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00549799  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6178  response regulator receiver protein  36.03 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2534  response regulator receiver protein  32.84 
 
 		 141 aa  67  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3028  two-component response regulator  31.67 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0938905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0463  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 1314 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332875  normal  0.985136 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2523  hypothetical protein  31.75 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0829  response regulator receiver protein  36.92 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00313002  normal  0.336166 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0054  response regulator of ato, ornithine decarboxylase antizyme (sensor ATOS)  33.61 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225376 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1955  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0043  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.304768 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4937  response regulator receiver protein  26.52 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0903  response regulator receiver protein  37.38 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.24539  decreased coverage  0.00652104 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5595  response regulator receiver protein  33.6 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000316112  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2376  hypothetical protein  30.16 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 		 1199 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0283  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  38.21 
 
 		 531 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3821  response regulator receiver protein  40.95 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3765  response regulator receiver protein  40.95 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3947  response regulator receiver protein  40.95 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  34.07 
 
 		 1983 aa  63.5  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2787  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00139288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0104  two-component response regulator  31.01 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0412586  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2287  response regulator  31.39 
 
 		 136 aa  62  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  33.06 
 
 		 582 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5565  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3216  two-component response regulator, CheY-like  31.93 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233496  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1908  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.88 
 
 		 991 aa  62.4  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  26.06 
 
 		 1574 aa  62  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0503  response regulator receiver protein  40 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1627  response regulator receiver  27.48 
 
 		 320 aa  62  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.307982 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 1629 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0544  response regulator receiver protein  40.2 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5434  response regulator receiver protein  32 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.455605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  32.86 
 
 		 2026 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 2026 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2393  response regulator receiver protein  35.2 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2164  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  34.4 
 
 		 2284 aa  60.1  0.000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1942  metal dependent phosphohydrolase  35.2 
 
 		 363 aa  60.1  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.284574  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3486  response regulator receiver protein  39.22 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 		 977 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  31.54 
 
 		 631 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0722  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  32.31 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.84817e-16 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  33.6 
 
 		 2301 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3047  two-component response regulator  30.83 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0882292  normal  0.419073 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0314  histidine kinase  36.59 
 
 		 531 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3301  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  34.75 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0147948 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3504  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  35.59 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2699  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.81 
 
 		 328 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  34.11 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3239  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  34.75 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3329  response regulator receiver protein  38.24 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 2164 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3250  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  34.75 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  33.05 
 
 		 1987 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  33.05 
 
 		 1992 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 		 816 aa  58.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 		 876 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0710  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  31.11 
 
 		 240 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  29.77 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0543  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0261  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.15 
 
 		 948 aa  57.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0129  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.51 
 
 		 752 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3480  response regulator receiver protein  47.69 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.185259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 		 1266 aa  57.4  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1356  two component response regulator  26.67 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.189913  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1314  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 		 1177 aa  57.4  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  26.4 
 
 		 1351 aa  57.4  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  31.58 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3463  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 		 1333 aa  57.4  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.245922 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  31.54 
 
 		 1060 aa  57  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  29.01 
 
 		 151 aa  57  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2775  CheA signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 1125 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.74774  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2695  response regulator receiver protein  35.11 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 1646 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 1646 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.08 
 
 		 833 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5197  response regulator receiver protein  29.55 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 1647 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 2022 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3120  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  27.12 
 
 		 1653 aa  56.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 		 1042 aa  56.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4954  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.69 
 
 		 1016 aa  56.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0561599 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1090  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 846 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874134  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1639  histidine kinase  27.69 
 
 		 676 aa  55.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.576569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.05 
 
 		 1971 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>