More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2592 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 192 aa  387  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 212 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 215 aa  67.8  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 212 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 212 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2656  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 212 aa  67  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  41.1 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 261 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 220 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 234 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 234 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1821  transcriptional regulator, TetR family  39.64 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  23.33 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  23.33 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1177  TetR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1159  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 225 aa  62  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 197 aa  62  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  23.95 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  33.96 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  22.87 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  26.03 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  26.03 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0228  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.728602  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  24.48 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  26.03 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  23.16 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  20.71 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 211 aa  57.8  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  32.98 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 497 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>