169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2328 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 338 aa  664    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  33.63 
 
 		 334 aa  179  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  31.18 
 
 		 337 aa  164  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  31.65 
 
 		 331 aa  156  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  34.16 
 
 		 329 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  34.16 
 
 		 329 aa  152  8e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  30.79 
 
 		 330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  29.61 
 
 		 350 aa  139  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  30.91 
 
 		 332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  27.04 
 
 		 344 aa  123  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  27.18 
 
 		 336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  28.48 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  23.78 
 
 		 378 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  33.7 
 
 		 354 aa  113  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  27.3 
 
 		 339 aa  112  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  26.26 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  25.08 
 
 		 344 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  23.08 
 
 		 338 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  28.82 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  24.52 
 
 		 336 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  24.52 
 
 		 336 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  24.52 
 
 		 336 aa  106  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  24.52 
 
 		 336 aa  106  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  24.52 
 
 		 336 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  24.52 
 
 		 336 aa  105  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  24.52 
 
 		 336 aa  105  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  24.52 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  24.83 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  24.19 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  24.52 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  26.65 
 
 		 348 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  28.12 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  26.81 
 
 		 334 aa  103  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  22.9 
 
 		 332 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  23.21 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  23.55 
 
 		 336 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  30.2 
 
 		 334 aa  100  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  22.88 
 
 		 339 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  25.81 
 
 		 330 aa  100  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  28.67 
 
 		 315 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11278  hypothetical protein  25.77 
 
 		 336 aa  98.6  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  25.82 
 
 		 374 aa  97.1  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  20.54 
 
 		 325 aa  97.1  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  23.37 
 
 		 334 aa  96.7  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  26.52 
 
 		 331 aa  96.7  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1447  hypothetical protein  23.99 
 
 		 341 aa  94.4  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  25.85 
 
 		 346 aa  92.8  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  29.96 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  25.72 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  20.2 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  21.34 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  24.09 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  28.62 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0260  DNA polymerase III, delta subunit  25.43 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  28.62 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  28.62 
 
 		 351 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  28.4 
 
 		 345 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  22.01 
 
 		 324 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  22.01 
 
 		 324 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3422  DNA polymerase III, delta subunit  28.24 
 
 		 343 aa  75.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_002950  PG0949  hypothetical protein  24.88 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.148514 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  28.06 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  18.21 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  28.62 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  26.82 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  24.07 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  27.39 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2201  DNA polymerase III, delta subunit  20.31 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.638698 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07750  DNA polymerase III, delta subunit  27.05 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.648586 
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  23.46 
 
 		 399 aa  69.3  0.00000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2278  DNA polymerase III delta subunit-like protein  28.19 
 
 		 327 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00793945  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2243  DNA polymerase III, delta subunit  28.69 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143868  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  24.22 
 
 		 342 aa  68.9  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  27.27 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1259  DNA polymerase III, delta subunit  29.55 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.098932 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  23.64 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1451  DNA polymerase III subunit delta  25.77 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0184698  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3788  DNA polymerase III subunit delta  28.03 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.350473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2577  DNA polymerase III, delta subunit  23.88 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  24.92 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  25 
 
 		 324 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1560  DNA polymerase III, delta subunit  27.51 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  19.76 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08980  DNA polymerase III subunit delta  27.96 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0881789  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2663  DNA polymerase III, delta subunit  25.82 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193878  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1980  DNA polymerase III, delta subunit  27.39 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000479491 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1144  DNA polymerase III subunit delta  26.16 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1920  DNA polymerase III, delta subunit  19.16 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  19.76 
 
 		 348 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  29.49 
 
 		 345 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3467  DNA polymerase III, delta subunit  27.3 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.83441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1508  DNA polymerase III, delta subunit  23.94 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0182978  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0671  DNA polymerase III, delta subunit  23.94 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00374825  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17400  DNA polymerase III, delta subunit  26.23 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.919832  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17390  DNA polymerase III, delta subunit  27.18 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0161852 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  27.42 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1965  DNA polymerase III, delta subunit  20.62 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0224  DNA polymerase III, delta subunit  23.15 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2917  DNA polymerase III, delta subunit  24.6 
 
 		 342 aa  59.3  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1119  DNA polymerase III subunit delta  29.15 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>