More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1532 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1532  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 271 aa  526  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  33.59 
 
 		 324 aa  94.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1039  AraC family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 320 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00683379  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1055  AraC family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 320 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.300458 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1065  AraC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 306 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261016  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  32.53 
 
 		 325 aa  86.7  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  48.96 
 
 		 322 aa  85.1  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  29.89 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  31.56 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  26.57 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 312 aa  82.4  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1540  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 319 aa  82.4  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000047582  hitchhiker  0.00155056 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1911  AraC family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2272  AraC family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.821113  normal  0.340779 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  33.96 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2093  helix-turn-helix domain-containing protein  30.63 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  32.74 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  29.07 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 335 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 312 aa  79  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0608  transcriptional regulator, AraC family protein  30.7 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9089  AraC family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 327 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  34.34 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3116  helix-turn-helix domain-containing protein  30.77 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1711  transcriptional regulator, AraC family  42.55 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0664  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  32.48 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  28.91 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  36.9 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  35.66 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0729  transcriptional regulator, AraC family protein  31.3 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0674  AraC family transcriptional regulator  42 
 
 		 284 aa  75.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5377  AraC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 349 aa  75.9  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.579005  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0614  AraC family transcriptional regulator  42 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.45205 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5170  AraC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.268842 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3616  GGDEF  39.25 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.142982 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  45.45 
 
 		 349 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3640  AraC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 348 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00261  predicted DNA-binding transcriptional regulator  42.55 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3300  transcriptional regulator, AraC family  42.55 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0320  AraC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3317  AraC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00265  hypothetical protein  42.55 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0358  AraC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.443979  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0337  AraC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  26.37 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5242  helix-turn-helix domain-containing protein  41.18 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  47.42 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  27.87 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  31 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5532  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5151  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  42 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1013  helix-turn-helix domain-containing protein  28.87 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209714 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3957  AraC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0264307 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0357  transcriptional regulator, AraC family  41.49 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.698953 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  26.6 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2186  AraC family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0548516  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  41 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3848  AraC family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0846255  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2858  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  43.27 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.113519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  39.39 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0667  putative transcriptional regulator  29.29 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3951  AraC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.254801 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5736  transcriptional regulator, AraC family  41.58 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.756773 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1134  transcriptional regulator, AraC family  42.11 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.330045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 322 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  31.8 
 
 		 359 aa  68.9  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1249  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 318 aa  68.9  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3311  AraC family transcriptional regulator  22.71 
 
 		 297 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9341  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  42.71 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5827  AraC family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 356 aa  68.9  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  38.74 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  26.41 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  35.66 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0555  AraC family DNA-binding response regulator  28.28 
 
 		 529 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3961  AraC family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 349 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0991  transcriptional regulator, AraC family  37.25 
 
 		 315 aa  67  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0397421  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>