More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1414 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 387 aa  776    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  38.14 
 
 		 391 aa  239  5.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1921  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.39 
 
 		 394 aa  195  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.86 
 
 		 405 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0825  RND family efflux transporter MFP subunit  35.39 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2192  RND family efflux transporter MFP subunit  31.56 
 
 		 408 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1409  RND family efflux transporter MFP subunit  36.45 
 
 		 385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.13685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  34.3 
 
 		 386 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2285  RND family efflux transporter MFP subunit  30.79 
 
 		 428 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134622 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1622  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.53 
 
 		 415 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.1162  normal  0.0945961 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3329  secretion protein HlyD  37.24 
 
 		 386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2901  RND family efflux transporter MFP subunit  32.96 
 
 		 394 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4636  secretion protein HlyD  33.96 
 
 		 403 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.31 
 
 		 379 aa  171  1e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0158662  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  33.42 
 
 		 379 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  34.44 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1939  RND family efflux transporter MFP subunit  31.43 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0238209  hitchhiker  0.000755342 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2037  RND family efflux transporter MFP subunit  31.43 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.421969  normal  0.135437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1992  secretion protein HlyD family protein  32.23 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.125579  normal  0.0134883 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0285  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 386 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.884794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.84 
 
 		 383 aa  167  4e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000507809  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.51 
 
 		 396 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1701  secretion protein HlyD  32.97 
 
 		 412 aa  166  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.17328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3094  putative efflux transporter  33.24 
 
 		 393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000031387  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.83 
 
 		 396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1593  secretion protein HlyD  32.07 
 
 		 400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000034507  unclonable  0.000000261884 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.05 
 
 		 395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2644  RND family efflux transporter MFP subunit  33.23 
 
 		 385 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5495  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.12 
 
 		 384 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318515  normal  0.60957 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  34.12 
 
 		 395 aa  162  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  34.12 
 
 		 395 aa  162  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  34.12 
 
 		 388 aa  162  7e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3553  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  36.2 
 
 		 378 aa  162  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.16 
 
 		 422 aa  160  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3107  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.93 
 
 		 392 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.32243 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1117  secretion protein HlyD  34.1 
 
 		 367 aa  160  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  31.99 
 
 		 390 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1361  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  33.14 
 
 		 389 aa  158  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1990  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.29 
 
 		 392 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759025  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0828  RND family efflux transporter MFP subunit  32.33 
 
 		 396 aa  158  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0389  RND family efflux transporter MFP subunit  34.29 
 
 		 434 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2482  RND family efflux transporter MFP subunit  34.35 
 
 		 391 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3493  RND family efflux transporter MFP subunit  32.34 
 
 		 381 aa  158  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3015  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.69 
 
 		 384 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  32.14 
 
 		 405 aa  158  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0410  RND family efflux transporter MFP subunit  32.87 
 
 		 407 aa  158  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1280  secretion protein HlyD  32.36 
 
 		 385 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0347794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1596  RND family efflux transporter MFP subunit  32.97 
 
 		 398 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.566633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  32.43 
 
 		 406 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0932  precursor of drug resistance protein  32.51 
 
 		 396 aa  157  3e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1356  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  30.57 
 
 		 407 aa  157  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  33.79 
 
 		 426 aa  157  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  32.78 
 
 		 395 aa  156  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0035  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.52 
 
 		 404 aa  157  4e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  33.16 
 
 		 381 aa  156  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  31.81 
 
 		 386 aa  156  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1129  secretion protein HlyD  30.05 
 
 		 368 aa  156  7e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.827247  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  33.33 
 
 		 394 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0123  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.85 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3604  secretion protein HlyD  34.73 
 
 		 422 aa  155  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105186  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0581  RND family efflux transporter MFP subunit  31.56 
 
 		 417 aa  155  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4148  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30 
 
 		 560 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00182  acriflavine resistance protein a precursor  31.36 
 
 		 381 aa  154  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2639  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.71 
 
 		 436 aa  154  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3588  secretion protein HlyD  34.96 
 
 		 415 aa  155  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  33.43 
 
 		 381 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0152  RND family efflux transporter MFP subunit  32.88 
 
 		 385 aa  155  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2893  secretion protein HlyD  33.72 
 
 		 385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127871  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  33.77 
 
 		 392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1229  RND efflux system membrane fusion protein  32.45 
 
 		 428 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0847833 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1458  RND family efflux transporter MFP subunit  32.86 
 
 		 422 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.235103  hitchhiker  0.000537348 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3365  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.82 
 
 		 391 aa  154  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496799  normal  0.0176512 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0530  RND family efflux transporter MFP subunit  33.24 
 
 		 394 aa  153  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.727313  normal  0.0367065 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4053  RND family efflux transporter MFP subunit  32.94 
 
 		 414 aa  153  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  34.66 
 
 		 398 aa  153  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0142  RND family efflux transporter MFP subunit  33.64 
 
 		 389 aa  153  5e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1361  HlyD family secretion protein  32.34 
 
 		 387 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.70378  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2937  RND family efflux transporter MFP subunit  33.24 
 
 		 391 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0692  secretion protein HlyD  32.07 
 
 		 412 aa  152  7e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000417324  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1870  secretion protein HlyD  32.6 
 
 		 428 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0948  secretion protein HlyD  29.18 
 
 		 413 aa  152  7e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.297274  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0777  RND family efflux transporter MFP subunit  30.54 
 
 		 384 aa  152  8e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.05 
 
 		 386 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4503  RND family efflux transporter MFP subunit  34.4 
 
 		 384 aa  152  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3714  RND family efflux transporter MFP subunit  32.44 
 
 		 408 aa  152  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132208 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03361  multidrug resistance efflux transporter  30 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0200  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  30.29 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0204  multidrug efflux system protein MdtE  30 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0378135 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3816  multidrug efflux system protein MdtE  30 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0409403 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5230  RND family efflux transporter MFP subunit  32 
 
 		 405 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0639393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3715  multidrug efflux system protein MdtE  30 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00203932  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  33.24 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  33.15 
 
 		 381 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.15 
 
 		 381 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03314  hypothetical protein  30 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4699  RND family efflux transporter MFP subunit  32 
 
 		 405 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.56 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3999  multidrug efflux system protein MdtE  30 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  33.14 
 
 		 400 aa  150  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>