160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0163 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0163  hypothetical protein  100 
 
 		 1147 aa  2195    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.137975  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  23.6 
 
 		 1195 aa  332  2e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  25.28 
 
 		 1270 aa  226  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  22 
 
 		 1182 aa  179  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  25.26 
 
 		 1199 aa  156  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  30.97 
 
 		 1164 aa  155  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  38.58 
 
 		 1220 aa  145  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  38.35 
 
 		 1152 aa  144  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  31.01 
 
 		 1288 aa  142  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  33.16 
 
 		 1176 aa  140  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  39.76 
 
 		 1173 aa  139  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  31 
 
 		 1172 aa  139  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  27.13 
 
 		 1182 aa  139  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01945  hypothetical protein  30.25 
 
 		 1313 aa  138  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.206649 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  35.56 
 
 		 1102 aa  139  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  34.38 
 
 		 1209 aa  137  8e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3090  OmpA domain-containing protein  32.76 
 
 		 831 aa  137  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0393  ImcF domain-containing protein  29.96 
 
 		 1313 aa  137  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145892  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0420  type VI secretion protein IcmF  29.84 
 
 		 1313 aa  137  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.419198  normal  0.652814 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2907  type VI secretion protein IcmF  29.84 
 
 		 1315 aa  137  9e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0459  type VI secretion protein IcmF  30.35 
 
 		 1314 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3575  hypothetical protein  29.57 
 
 		 1315 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2954  ImcF-like family protein  30.35 
 
 		 1301 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.858657  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2620  ImcF-related  30.35 
 
 		 1314 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0485  ImcF domain-containing protein  30.35 
 
 		 1314 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752194  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2633  OmpA/MotB domain-containing protein  32.42 
 
 		 831 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2826  hypothetical protein  30.35 
 
 		 1297 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3632  hypothetical protein  30.35 
 
 		 1297 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20293  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0050  hypothetical protein  30.35 
 
 		 1297 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1717  hypothetical protein  30.35 
 
 		 1297 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624106  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  39.36 
 
 		 1173 aa  137  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3625  hypothetical protein  30.35 
 
 		 1297 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3650  hypothetical protein  30.35 
 
 		 1297 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3151  hypothetical protein  30.35 
 
 		 1297 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2499  OmpA/MotB domain-containing protein  32.56 
 
 		 831 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  32.08 
 
 		 1207 aa  136  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  31.4 
 
 		 1181 aa  135  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  34.62 
 
 		 1211 aa  134  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2775  OmpA/MotB domain-containing protein  32.42 
 
 		 831 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414663  normal  0.366632 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4964  OmpA/MotB  30.05 
 
 		 830 aa  132  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1485  type VI secretion protein IcmF  23.6 
 
 		 1275 aa  132  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1373  hypothetical protein  23.6 
 
 		 1275 aa  132  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  31.3 
 
 		 1171 aa  132  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  39.41 
 
 		 1205 aa  131  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  41.07 
 
 		 1212 aa  131  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  31.4 
 
 		 1176 aa  130  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  37.55 
 
 		 1192 aa  129  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2260  OmpA/MotB  26.51 
 
 		 830 aa  129  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  35.25 
 
 		 1208 aa  128  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  35.63 
 
 		 1209 aa  128  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  35.63 
 
 		 1209 aa  128  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  35.63 
 
 		 1209 aa  128  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  35.63 
 
 		 1209 aa  128  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  35.63 
 
 		 1209 aa  128  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  35.63 
 
 		 1209 aa  128  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  35.63 
 
 		 1209 aa  128  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  35.63 
 
 		 1209 aa  128  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  28.21 
 
 		 1230 aa  127  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  32.38 
 
 		 1218 aa  126  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  37.18 
 
 		 1179 aa  126  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  39.77 
 
 		 1157 aa  126  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  30.59 
 
 		 1179 aa  125  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6108  type VI secretion protein IcmF  23.84 
 
 		 1348 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  35.26 
 
 		 1181 aa  122  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1205  hypothetical protein  29.01 
 
 		 1134 aa  121  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  33.21 
 
 		 1302 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  33.21 
 
 		 1302 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  33.21 
 
 		 1302 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  31.6 
 
 		 1302 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  29.38 
 
 		 1302 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3045  hypothetical protein  27.64 
 
 		 1133 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1798  ImcF domain-containing protein  23.2 
 
 		 1067 aa  114  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2989  hypothetical protein  23.66 
 
 		 1140 aa  113  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000392845 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2591  ImcF domain-containing protein  23.66 
 
 		 1140 aa  113  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2495  hypothetical protein  23.66 
 
 		 1140 aa  112  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.963407  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  37.4 
 
 		 1175 aa  112  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0795  hypothetical protein  23.29 
 
 		 1140 aa  112  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  31.96 
 
 		 1204 aa  111  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  37.04 
 
 		 1206 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  34.08 
 
 		 1148 aa  110  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  36.51 
 
 		 1206 aa  109  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0274  hypothetical protein  27.97 
 
 		 1154 aa  109  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2911  ImcF domain-containing protein  26.09 
 
 		 1094 aa  109  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.951042  normal  0.253398 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2262  ImcF-related  31 
 
 		 1335 aa  108  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.295752  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42900  hypothetical protein  38.99 
 
 		 1175 aa  108  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.376126 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  32.46 
 
 		 1302 aa  107  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  37.77 
 
 		 1175 aa  107  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  32.73 
 
 		 1168 aa  107  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  29.63 
 
 		 1268 aa  107  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3166  hypothetical protein  32.95 
 
 		 1150 aa  104  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1937  type VI secretion protein IcmF  23.06 
 
 		 1150 aa  103  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.502152  normal  0.887242 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0016  hypothetical protein  30.32 
 
 		 1008 aa  104  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4071  hypothetical protein  35.98 
 
 		 1208 aa  103  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000209226 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3221  type VI secretion protein IcmF  35.45 
 
 		 1194 aa  102  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3247  ImcF domain-containing protein  23.94 
 
 		 1114 aa  101  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0306  SciS protein  36.72 
 
 		 1289 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.422511 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0311  type VI secretion protein IcmF  36.72 
 
 		 1289 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685526 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  36.72 
 
 		 1289 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4962  hypothetical protein  30.3 
 
 		 1310 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  36.72 
 
 		 1289 aa  100  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277614 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>