More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3342 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 461 aa  915    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  31.7 
 
 		 508 aa  206  8e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  31.73 
 
 		 471 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 454 aa  182  9.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  36.09 
 
 		 1762 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  28.95 
 
 		 776 aa  99.8  9e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  30.97 
 
 		 312 aa  91.3  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  24.65 
 
 		 1557 aa  89.4  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  28.03 
 
 		 344 aa  89.4  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  29.24 
 
 		 993 aa  89  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  26.61 
 
 		 341 aa  88.6  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  30.88 
 
 		 334 aa  85.9  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 1009 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  30 
 
 		 1009 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  30 
 
 		 1017 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  28.16 
 
 		 795 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  28.82 
 
 		 990 aa  84.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  26.98 
 
 		 445 aa  83.2  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1741  kelch repeat-containing protein  28.63 
 
 		 314 aa  82.8  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.571519  normal  0.867228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  29 
 
 		 1407 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  28.57 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  25 
 
 		 321 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2899  Kelch repeat-containing protein  24.91 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  26.32 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4361  kelch repeat-containing protein  25.28 
 
 		 717 aa  73.2  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.423968  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  24.91 
 
 		 725 aa  71.6  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  60.32 
 
 		 917 aa  71.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  56.45 
 
 		 1019 aa  70.9  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  28.63 
 
 		 812 aa  70.1  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  27.35 
 
 		 2942 aa  70.1  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1734  two component LuxR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 257 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159279  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  25 
 
 		 321 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.14 
 
 		 253 aa  69.7  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  55.56 
 
 		 213 aa  69.3  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  57.14 
 
 		 234 aa  69.3  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 237 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 229 aa  68.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 218 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.38 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.38 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  53.97 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.781509  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3634  transcriptional regulator, LuxR family  56.45 
 
 		 525 aa  67.4  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.567744  normal  0.0299379 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4854  putative two component LuxR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 211 aa  67  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  59.02 
 
 		 218 aa  67  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2359  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.78 
 
 		 247 aa  67  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0990205  decreased coverage  0.00133027 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1210  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.31 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.292938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1633  two component LuxR family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2873  two component LuxR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 216 aa  66.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.12 
 
 		 219 aa  66.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.23 
 
 		 222 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  58.06 
 
 		 967 aa  66.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 254 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245701 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 230 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 221 aa  65.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  48.53 
 
 		 242 aa  65.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3480  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.46 
 
 		 210 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147525 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2623  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.46 
 
 		 210 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  56.36 
 
 		 889 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.23 
 
 		 210 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.56 
 
 		 236 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3826  transcriptional regulator, LuxR family  54.1 
 
 		 519 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.553807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42834  predicted protein  24.06 
 
 		 639 aa  65.1  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5474  two component LuxR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 212 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344108  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  59.62 
 
 		 896 aa  65.1  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5070  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.79 
 
 		 210 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.744929 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 224 aa  65.5  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  27.88 
 
 		 1514 aa  65.1  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 226 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  52.86 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6539  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 198 aa  65.1  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370011  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4892  Kelch repeat-containing protein  27.4 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0109077  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  54.1 
 
 		 206 aa  65.1  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04700  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  47.54 
 
 		 198 aa  65.1  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.162406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  50.79 
 
 		 209 aa  65.1  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0568  kelch repeat-containing protein  24.74 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.558625  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1284  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0487  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.23 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4918  metal-dependent phosphohydrolase  50.79 
 
 		 516 aa  64.3  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.401687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  51.56 
 
 		 916 aa  64.7  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5428  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.23 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  56.25 
 
 		 877 aa  64.3  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1106  two component LuxR family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.584765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  53.12 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  49.3 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  49.18 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  49.18 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1936  response regulator receiver  46.03 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1902  two component LuxR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000041006  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4199  regulatory protein, LuxR  53.23 
 
 		 855 aa  63.5  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  53.03 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>