More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0645 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0645  integrase family protein  100 
 
 		 328 aa  669    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000112195  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0012  Phage integrase  42.14 
 
 		 320 aa  241  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0026  Phage integrase  42.38 
 
 		 309 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5582  integrase family protein  40.89 
 
 		 313 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4591  integrase family protein  41.03 
 
 		 316 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000000427706  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0180  phage integrase  44.22 
 
 		 336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0996549 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4618  integrase family protein  42.14 
 
 		 311 aa  212  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0027  integrase/recombinase  42.14 
 
 		 325 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000824478  normal  0.490771 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4462  integrase family protein  41.81 
 
 		 311 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2389  integrase family protein  41.52 
 
 		 345 aa  201  9e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000168042  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2840  integrase family protein  38.96 
 
 		 322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0238888  normal  0.278729 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1730  integrase family protein  44.34 
 
 		 317 aa  199  5e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4229  phage integrase family protein  39.93 
 
 		 329 aa  196  5.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4067  integrase/recombinase  40.76 
 
 		 324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.130649  normal  0.280594 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3221  integrase family protein  39.3 
 
 		 337 aa  165  9e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  hitchhiker  0.000000474252 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2751  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  34.19 
 
 		 321 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.74292  normal  0.0246266 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2966  site-specific recombinase, phage integrase family  34.19 
 
 		 321 aa  159  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121059  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2794  integrase family protein  35.53 
 
 		 304 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.160655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2848  phage integrase family protein  36.43 
 
 		 304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2840  Phage integrase  36.21 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2939  integrase family protein  36.08 
 
 		 304 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00295  site-specific recombinase, phage integrase family protein  32.09 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2841  phage integrase family site specific recombinase  36.33 
 
 		 292 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.424466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4243  phage integrase  31.94 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000426285 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0730  phage integrase  31.27 
 
 		 305 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3218  phage integrase family protein  30.23 
 
 		 310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000104017 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3884  phage integrase family site specific recombinase  30.36 
 
 		 310 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3558  phage integrase family protein  30.49 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1900  phage integrase family protein  29.11 
 
 		 331 aa  109  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125862  hitchhiker  0.00365877 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5631  integrase/recombinase  35.64 
 
 		 192 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000106041 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  28.24 
 
 		 310 aa  95.9  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.81 
 
 		 313 aa  95.5  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0872  integrase family protein  31.8 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  35.09 
 
 		 297 aa  90.1  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  31.4 
 
 		 332 aa  90.1  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0264  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.08 
 
 		 315 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5291  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.11 
 
 		 299 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47730  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.79 
 
 		 299 aa  89.4  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435757  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5139  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.23 
 
 		 299 aa  89  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.03 
 
 		 311 aa  88.2  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69710  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.05 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.737312  normal  0.478185 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5230  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.82 
 
 		 299 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0242  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.37 
 
 		 299 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322874  normal  0.826572 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  25.54 
 
 		 296 aa  85.9  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6023  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.44 
 
 		 303 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.14 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.35 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.49 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5501  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.23 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0582  integrase family protein  34.19 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.132855 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.8 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.14 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1163  phage integrase family protein  36.67 
 
 		 472 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.562087  normal  0.524123 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.52 
 
 		 299 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.28 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  33.05 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  29.5 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  30 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0052  phage integrase  35.03 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  29.7 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0128  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.4 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.34 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  31.51 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  30 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.07 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.07 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.86 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.07 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  30.67 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  31.53 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.07 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  30.84 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.07 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.77 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.07 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  29.55 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.34 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  33.74 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  32.34 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.77 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  28.72 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.07 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  28.84 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0139  tyrosine recombinase XerD  29.39 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.77 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1209  phage integrase family site specific recombinase  28.11 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.764611  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  32.34 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  27.61 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  30.2 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  36.48 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.18 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0057  tyrosine recombinase XerD  34.46 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  26.12 
 
 		 302 aa  79  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  27.14 
 
 		 299 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  29.14 
 
 		 338 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  33.52 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  26.12 
 
 		 302 aa  79  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0251  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.54 
 
 		 355 aa  78.2  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00631913  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.95 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  28.96 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>