More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0609 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0609  zeta-phytoene desaturase  100 
 
 		 495 aa  1013    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2535  zeta-phytoene desaturase  54.7 
 
 		 491 aa  484  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00482984  unclonable  0.000000000435247 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2983  phytoene desaturase  54.76 
 
 		 495 aa  478  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00166806  normal  0.0111696 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1811  phytoene dehydrogenase-related protein  53.21 
 
 		 502 aa  473  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000642179  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1289  FAD dependent oxidoreductase  37.76 
 
 		 516 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.571457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3436  phytoene desaturase  34.99 
 
 		 512 aa  289  8e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3745  phytoene desaturase  34.79 
 
 		 512 aa  288  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5031  phytoene desaturase  35.05 
 
 		 509 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3632  phytoene desaturase  34.72 
 
 		 512 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109765  normal  0.0371662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3156  phytoene desaturase  34.48 
 
 		 509 aa  279  8e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205158  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  34.06 
 
 		 505 aa  278  1e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3225  Zeta-phytoene desaturase  38.4 
 
 		 475 aa  276  5e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  hitchhiker  0.00724213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3833  hydroxyneurosporene dehydrogenase  37.07 
 
 		 471 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0251377 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3760  FAD dependent oxidoreductase  37.58 
 
 		 524 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569391 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  32.92 
 
 		 511 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  32.64 
 
 		 492 aa  268  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0796  phytoene desaturase  35.48 
 
 		 475 aa  268  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  33.33 
 
 		 511 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0845  amine oxidase  37.16 
 
 		 492 aa  267  4e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2740  phytoene desaturase  33.69 
 
 		 518 aa  266  5e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4005  FAD dependent oxidoreductase  36.75 
 
 		 516 aa  266  8e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665607  hitchhiker  0.00234507 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  33.4 
 
 		 511 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  31.67 
 
 		 537 aa  261  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  33.33 
 
 		 511 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2640  zeta-phytoene desaturase  31.15 
 
 		 497 aa  260  4e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2586  zeta-phytoene desaturase  31.15 
 
 		 497 aa  260  4e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3693  phytoene desaturase  35.5 
 
 		 499 aa  259  6e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357896 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6441  hydroxyneurosporene and rhodopin dehydrogenase  35.09 
 
 		 509 aa  259  8e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  34.52 
 
 		 507 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2546  phytoene desaturase  38.77 
 
 		 496 aa  257  4e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.343335  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  30.94 
 
 		 504 aa  252  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  33.54 
 
 		 508 aa  249  8e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1706  phytoene desaturase  35.67 
 
 		 519 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  31.87 
 
 		 512 aa  247  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2029  phytoene desaturase  33.33 
 
 		 496 aa  247  4e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  34.03 
 
 		 508 aa  247  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2742  phytoene desaturase  31.64 
 
 		 553 aa  246  4.9999999999999997e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2726  phytoene desaturase  34.42 
 
 		 499 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2268  phytoene desaturase  32.31 
 
 		 497 aa  244  1.9999999999999999e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  29.71 
 
 		 502 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  29.71 
 
 		 502 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2984  CrtD protein  34.71 
 
 		 503 aa  242  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2953  phytoene desaturase  34.42 
 
 		 499 aa  242  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294845 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1614  phytoene dehydrogenase-related protein  36.2 
 
 		 520 aa  241  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1108  phytoene desaturase  35.81 
 
 		 500 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556955  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  30.5 
 
 		 493 aa  240  4e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  32.39 
 
 		 525 aa  238  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2048  phytoene desaturase  35.83 
 
 		 515 aa  237  4e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51701 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1387  amine oxidase  32.3 
 
 		 503 aa  237  4e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  hitchhiker  0.00651843 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  32.3 
 
 		 507 aa  236  6e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  33.27 
 
 		 506 aa  236  6e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1619  phytoene dehydrogenase-related protein  31.46 
 
 		 508 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  31.83 
 
 		 492 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1585  zeta-phytoene desaturase  32.55 
 
 		 492 aa  234  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0943  phytoene dehydrogenase-related protein  31.97 
 
 		 495 aa  231  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988075 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3248  phytoene dehydrogenase-related protein  35.6 
 
 		 495 aa  231  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.242639  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  28.11 
 
 		 494 aa  230  4e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2822  phytoene desaturase  35.41 
 
 		 511 aa  230  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.429882  normal  0.241296 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2045  phytoene desaturase  31.32 
 
 		 490 aa  229  7e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5038  phytoene desaturase  30.8 
 
 		 529 aa  229  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.710499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  31.29 
 
 		 504 aa  228  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3637  phytoene desaturase  30.42 
 
 		 530 aa  227  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.197726  normal  0.0326307 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3750  phytoene desaturase  30.89 
 
 		 530 aa  227  4e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  30.08 
 
 		 497 aa  227  5.0000000000000005e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3075  putative phytoene desaturase  31.67 
 
 		 506 aa  226  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  30.52 
 
 		 509 aa  226  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  30.43 
 
 		 504 aa  224  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2848  phytoene desaturase  33.12 
 
 		 512 aa  223  7e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.984953  normal  0.88934 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  30.02 
 
 		 519 aa  223  8e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3441  phytoene desaturase  30.5 
 
 		 530 aa  222  9e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.0554878 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3011  phytoene desaturase  32.15 
 
 		 508 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.194152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1392  FAD dependent oxidoreductase  37.26 
 
 		 495 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000446309 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1816  amine oxidase  29.64 
 
 		 492 aa  222  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1360  phytoene desaturase  30.86 
 
 		 500 aa  221  3e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.259348 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3236  phytoene desaturase  31.94 
 
 		 508 aa  219  6e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.689878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  29.94 
 
 		 498 aa  219  8.999999999999998e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  30.14 
 
 		 498 aa  218  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  30.77 
 
 		 531 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1897  phytoene desaturase  30.3 
 
 		 499 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.29228 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3475  zeta-phytoene desaturase  34.29 
 
 		 495 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.419175  normal  0.0366285 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  29.1 
 
 		 519 aa  213  7e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5124  zeta-phytoene desaturase  35.49 
 
 		 452 aa  213  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229738  normal  0.0794369 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  29.66 
 
 		 518 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2155  phytoene dehydrogenase-related protein  29.5 
 
 		 553 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.774687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  28.6 
 
 		 549 aa  211  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  29.19 
 
 		 546 aa  211  3e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4439  phytoene dehydrogenase-related protein  29.83 
 
 		 492 aa  211  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1399  phytoene desaturase  32.26 
 
 		 502 aa  211  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2545  phytoene desaturase  31.16 
 
 		 536 aa  210  4e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139145  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3508  phytoene dehydrogenase  29.8 
 
 		 524 aa  207  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.691648  normal  0.885719 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  29.51 
 
 		 491 aa  208  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  31.03 
 
 		 512 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  31.03 
 
 		 512 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4929  zeta-phytoene desaturase  29.61 
 
 		 492 aa  206  6e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258823  normal  0.799895 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3488  zeta-phytoene desaturase  28.25 
 
 		 552 aa  206  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0271  phytoene dehydrogenase  30.04 
 
 		 518 aa  205  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5454  phytoene dehydrogenase-related protein  30.83 
 
 		 512 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1914  phytoene dehydrogenase-related protein  30.04 
 
 		 518 aa  205  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0183  amine oxidase  32.27 
 
 		 523 aa  202  9e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3309  phytoene desaturase  30.02 
 
 		 494 aa  202  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>