198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0221 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0221  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like  100 
 
 		 537 aa  1088    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.43 
 
 		 430 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  27.2 
 
 		 437 aa  66.2  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  27.2 
 
 		 440 aa  65.9  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  34.87 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  26.21 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  24.71 
 
 		 451 aa  64.7  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  26.1 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  26.29 
 
 		 429 aa  63.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  27.94 
 
 		 298 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  31.58 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  31.58 
 
 		 1028 aa  60.1  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  31.21 
 
 		 450 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  27.13 
 
 		 427 aa  60.1  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  25.19 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  24.19 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5716  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27 
 
 		 642 aa  58.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  24.68 
 
 		 442 aa  58.2  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  23.28 
 
 		 442 aa  58.2  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0536  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.46 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00175631  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2731  translocation protein TolB  25.21 
 
 		 442 aa  57  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00144802  decreased coverage  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  25.78 
 
 		 432 aa  56.6  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1529  TolB protein  26.47 
 
 		 419 aa  55.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1454  TolB protein  26.47 
 
 		 419 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  24.29 
 
 		 434 aa  55.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1730  WD40 domain protein beta Propeller  24.29 
 
 		 982 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.16258  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  31.25 
 
 		 572 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  27.98 
 
 		 1082 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0782  translocation protein TolB  22.63 
 
 		 425 aa  55.1  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  31.45 
 
 		 440 aa  55.5  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  24.26 
 
 		 426 aa  55.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0750  WD40 domain protein beta Propeller  35.45 
 
 		 441 aa  55.5  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257042  normal  0.0548288 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  23.6 
 
 		 451 aa  55.1  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  25.7 
 
 		 432 aa  55.5  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  30.08 
 
 		 441 aa  54.7  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.89 
 
 		 407 aa  54.7  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  23.39 
 
 		 441 aa  54.7  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  26.37 
 
 		 421 aa  54.7  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  26.85 
 
 		 567 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0612  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  31.21 
 
 		 590 aa  54.3  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2397  WD40 domain-containing protein  30.4 
 
 		 352 aa  54.3  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000884296 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3061  transcriptional regulator domain-containing protein  26.44 
 
 		 716 aa  54.3  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0196528  hitchhiker  0.000417149 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  22.98 
 
 		 443 aa  54.3  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  28.17 
 
 		 434 aa  54.3  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  25.36 
 
 		 362 aa  53.9  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  25.88 
 
 		 445 aa  53.9  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5100  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.63 
 
 		 635 aa  53.5  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0811  translocation protein TolB  27.68 
 
 		 431 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188067  normal  0.784941 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0844  translocation protein TolB  27.68 
 
 		 431 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0211285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0907  translocation protein TolB  27.68 
 
 		 431 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.077859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  22.98 
 
 		 440 aa  52.8  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0875  translocation protein TolB  27.68 
 
 		 431 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0139765  normal  0.325318 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0262  translocation protein TolB  34.78 
 
 		 434 aa  53.1  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000248265  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  24.31 
 
 		 442 aa  53.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  23.42 
 
 		 429 aa  53.5  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0784  translocation protein TolB  27.68 
 
 		 431 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303788  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2129  hypothetical protein  28.69 
 
 		 487 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  29.75 
 
 		 432 aa  52.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  27.46 
 
 		 434 aa  52.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  24.03 
 
 		 427 aa  52.4  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  25.19 
 
 		 642 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  32.17 
 
 		 428 aa  52.8  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  23.76 
 
 		 450 aa  52.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.95 
 
 		 407 aa  52  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  27.46 
 
 		 431 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  26.97 
 
 		 435 aa  51.6  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  28.07 
 
 		 421 aa  52  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  31.53 
 
 		 439 aa  51.6  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00700  translocation protein TolB precursor  32.46 
 
 		 430 aa  51.6  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000197077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2895  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.46 
 
 		 430 aa  51.6  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000023315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2915  translocation protein TolB  32.46 
 
 		 430 aa  51.6  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000243248  normal  0.51862 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00689  hypothetical protein  32.46 
 
 		 430 aa  51.6  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000219845  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0012  WD40 domain-containing protein  27.64 
 
 		 620 aa  51.6  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0662  translocation protein TolB  32.46 
 
 		 430 aa  51.6  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000673794  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  25 
 
 		 292 aa  51.6  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0769  translocation protein TolB  32.46 
 
 		 430 aa  51.6  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000591343  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  23.08 
 
 		 441 aa  51.6  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0763  translocation protein TolB  32.46 
 
 		 431 aa  51.6  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000112892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0843  translocation protein TolB  32.46 
 
 		 430 aa  51.6  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000968933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  26.76 
 
 		 431 aa  50.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  25.82 
 
 		 433 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  25.82 
 
 		 433 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  26.32 
 
 		 432 aa  50.8  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  25.18 
 
 		 415 aa  50.8  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  29.46 
 
 		 439 aa  50.8  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  26.76 
 
 		 431 aa  50.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  24.02 
 
 		 422 aa  50.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  24.02 
 
 		 422 aa  50.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.55 
 
 		 428 aa  50.8  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1857  translocation protein TolB  24.58 
 
 		 442 aa  50.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00113428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  28.69 
 
 		 430 aa  50.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  22.98 
 
 		 425 aa  50.4  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  28.69 
 
 		 430 aa  50.4  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  24.35 
 
 		 717 aa  50.1  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  26.76 
 
 		 431 aa  50.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0727  TolB domain-containing protein  28.45 
 
 		 437 aa  50.4  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  26.76 
 
 		 431 aa  50.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2405  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  29.36 
 
 		 1078 aa  50.4  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.666802  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1156  translocation protein TolB  26.56 
 
 		 428 aa  50.4  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  23.08 
 
 		 442 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>