83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2534 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2534  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 152 aa  311  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4103  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 177 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4071  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137556  normal  0.92805 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 188 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  22 
 
 		 170 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  25.21 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1184  MarR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 168 aa  50.4  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.535813 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  23.13 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  22.58 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  25.21 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0910  MarR family transcriptional regulator  24 
 
 		 189 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.371157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 143 aa  47.4  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  28.41 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  25.71 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  23.19 
 
 		 154 aa  45.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 204 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8732  hypothetical protein  23.15 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  25.29 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  32.91 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  22.88 
 
 		 153 aa  44.3  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  20 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2462  MarR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0843644  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  22.31 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  20.75 
 
 		 157 aa  44.3  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2094  regulatory protein MarR  28.69 
 
 		 219 aa  44.3  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0118468 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3858  hypothetical protein  22.94 
 
 		 142 aa  44.3  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0253457  normal  0.0317444 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  22.12 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 168 aa  43.9  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  20 
 
 		 173 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  21.54 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5172  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  20.61 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1639  transcriptional regulator, MarR family  26.21 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0832  MarR family regulatory protein  27.71 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  22.99 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2527  transcriptional regulator, MarR family  27.63 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000236646  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0174  MarR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.63734  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2182  MarR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242743  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2221  MarR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014883  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1849  putative transcription regulator protein  24.03 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0705598  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  29.33 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2385  MarR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  20.59 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0670  MarR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2305  MarR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.885566  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2774  MarR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0654  MarR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.536381  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  26.09 
 
 		 164 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  27.72 
 
 		 145 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  21.93 
 
 		 164 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  21.26 
 
 		 157 aa  41.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0542  MarR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 144 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  24.56 
 
 		 162 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  23.08 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  21.13 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0099  SarA family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 250 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0236333  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0103  accessory regulator A-like protein  26.67 
 
 		 250 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.286911  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  22.45 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5228  transcriptional regulator, MarR family  26.96 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5035  transcriptional regulator, MarR family  23.81 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  31.03 
 
 		 287 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4810  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  27.85 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0095  MarR family transcriptional regulator  19.4 
 
 		 142 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0283  transcriptional regulator, MarR family  24.27 
 
 		 157 aa  40.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.34751  hitchhiker  0.000254243 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 147 aa  40  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0464  MarR family transcriptional regulator  21.57 
 
 		 153 aa  40  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 144 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>