More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3775 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 224 aa  448  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2904  transcriptional regulator, TetR family  41.15 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.349703 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  39.81 
 
 		 211 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 200 aa  134  8e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 228 aa  125  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1152  transcriptional regulator, TetR family  45.77 
 
 		 203 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2703  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 228 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 218 aa  92  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 242 aa  89  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751749 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3447  regulatory protein TetR  26.83 
 
 		 199 aa  71.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2788  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000644753  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2762  transcriptional regulator, TetR family  24.37 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000444516 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2568  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21232  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2560  TetR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.282393  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2754  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.864254  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2525  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  hitchhiker  0.00170542 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2524  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000581245  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0954  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2489  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 203 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.371609  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 210 aa  62  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0304  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 210 aa  62  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 211 aa  62  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2809  transcriptional regulator, TetR family  23.35 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167328  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2032  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44645  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2767  transcriptional regulator, TetR family  22.84 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.430405  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  27.2 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.12 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  32.12 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.12 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.12 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2910  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.12 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.12 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4314  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4587  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0406  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 202 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  26.37 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  28.33 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  33.73 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10277  transcriptional regulator  46.88 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.133301 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 193 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 247 aa  53.5  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 184 aa  54.3  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1587  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568163  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2689  putative transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 325 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.559134 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1557  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873387  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1611  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 247 aa  53.5  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1684  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.828148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>