167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3688 on replicon NC_010815
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010815  Glov_3688  HipA N-terminal domain protein  100 
 
 		 403 aa  827    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.649488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3810  HipA domain-containing protein  75.44 
 
 		 402 aa  629  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842886  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1275  hypothetical protein  43.46 
 
 		 425 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.370797  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0205  hypothetical protein  41.69 
 
 		 381 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1299  HipA domain protein  36.32 
 
 		 395 aa  238  1e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2046  HipA domain protein  49.36 
 
 		 251 aa  230  3e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5430  HipA N-terminal domain protein  37.37 
 
 		 439 aa  219  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.875392 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0672  HipA domain-containing protein  39.5 
 
 		 457 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0157438  decreased coverage  0.000108623 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5912  HipA domain protein  36.5 
 
 		 410 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4032  HipA domain-containing protein  35.32 
 
 		 444 aa  189  9e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.716492 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3103  HipA domain-containing protein  33.07 
 
 		 449 aa  187  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.891938  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1930  hypothetical protein  32.73 
 
 		 449 aa  183  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0687  HipA-like protein  31.19 
 
 		 413 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  28.61 
 
 		 408 aa  97.1  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  31.85 
 
 		 413 aa  96.7  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  31.15 
 
 		 413 aa  93.2  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  30.38 
 
 		 312 aa  91.3  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  27.27 
 
 		 418 aa  90.1  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2166  HipA domain protein  32.27 
 
 		 317 aa  89.7  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  30.39 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  31.86 
 
 		 434 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  30.91 
 
 		 434 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0063  hypothetical protein  27 
 
 		 435 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  31.91 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  27.27 
 
 		 418 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  30.35 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  27.94 
 
 		 437 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  29.53 
 
 		 318 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  27.13 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  30.28 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  30.28 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0482  hypothetical protein  26.43 
 
 		 524 aa  79  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  29.01 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  26.79 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  28.34 
 
 		 422 aa  77.4  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3381  HipA domain-containing protein  26.78 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.391293  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3351  HipA domain-containing protein  26.44 
 
 		 420 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3248  HipA domain-containing protein  26.78 
 
 		 420 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.980858  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  25.85 
 
 		 420 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  28.27 
 
 		 430 aa  74.7  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  25.85 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0494  hypothetical protein  30.26 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  28.26 
 
 		 409 aa  73.2  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3754  HipA N-terminal domain protein  28.9 
 
 		 418 aa  72.8  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3446  HipA domain-containing protein  26.97 
 
 		 617 aa  72.4  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  27.98 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  26.02 
 
 		 426 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  31.91 
 
 		 460 aa  69.3  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4056  HipA-like  29.41 
 
 		 613 aa  69.3  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.970389  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  26.35 
 
 		 382 aa  69.3  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0556  HipA domain-containing protein  34.51 
 
 		 620 aa  69.3  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0889579  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  27 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  26.02 
 
 		 454 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  29.64 
 
 		 450 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  26.9 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2649  HipA-like  32.31 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  29.69 
 
 		 419 aa  66.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  26.96 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  27.94 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  34.27 
 
 		 433 aa  65.1  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  25.74 
 
 		 437 aa  64.3  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  25.5 
 
 		 450 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  27.5 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1621  HipA N-terminal domain protein  29.36 
 
 		 437 aa  64.3  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  25.54 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2253  HipA domain-containing protein  29.36 
 
 		 437 aa  64.3  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00653025  normal  0.641538 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2955  HipA N-terminal domain protein  28.62 
 
 		 432 aa  63.2  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  24.93 
 
 		 390 aa  62.8  0.000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  28.17 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  29.84 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  26.1 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  25.36 
 
 		 440 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  25.36 
 
 		 440 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  26.71 
 
 		 443 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  23.96 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  25.36 
 
 		 440 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  22.78 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  25.36 
 
 		 440 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  25.36 
 
 		 440 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  23.96 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  28.2 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20530  hypothetical protein  53.06 
 
 		 84 aa  60.8  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  22.59 
 
 		 439 aa  59.7  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0939  HipA-like-like  23.85 
 
 		 527 aa  58.9  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.578298  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  29.44 
 
 		 409 aa  59.7  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  24.33 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2121  protein HipA  30.77 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218209 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  26.61 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.579198 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  28.93 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4901  putative regulator containing a HipA-like domain  26.86 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.460954  normal  0.048459 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  25.16 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5134  HipA domain-containing protein  24.65 
 
 		 450 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  0.708085 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5679  HipA domain-containing protein  27.99 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  25.93 
 
 		 419 aa  56.2  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5419  HipA-like  27.07 
 
 		 448 aa  56.2  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  23.1 
 
 		 380 aa  55.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  28.49 
 
 		 430 aa  54.7  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  26.47 
 
 		 420 aa  53.9  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  26.87 
 
 		 434 aa  53.9  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  27.41 
 
 		 442 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>