More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3122 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  90.68 
 
 		 356 aa  685    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  85.88 
 
 		 358 aa  662    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  90.68 
 
 		 356 aa  689    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 354 aa  743    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  85.88 
 
 		 358 aa  662    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  88.14 
 
 		 357 aa  672    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  82.49 
 
 		 358 aa  632  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  67.53 
 
 		 366 aa  531  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  47.28 
 
 		 349 aa  360  2e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  47.52 
 
 		 346 aa  352  5e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  45.66 
 
 		 358 aa  338  7e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  45.38 
 
 		 377 aa  335  7.999999999999999e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  43.59 
 
 		 363 aa  324  2e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  43.6 
 
 		 359 aa  324  2e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  43.48 
 
 		 405 aa  318  9e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  40.62 
 
 		 414 aa  311  1e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  42.07 
 
 		 561 aa  311  2e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  40.64 
 
 		 397 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  39.77 
 
 		 399 aa  301  8.000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  42.9 
 
 		 769 aa  296  3e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  37.75 
 
 		 413 aa  282  6.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  38.97 
 
 		 349 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  39.64 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  41.18 
 
 		 330 aa  258  9e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  40.24 
 
 		 330 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  39.61 
 
 		 375 aa  253  4.0000000000000004e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  38.94 
 
 		 327 aa  248  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  36.09 
 
 		 334 aa  243  3e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  36.74 
 
 		 372 aa  243  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  37.4 
 
 		 381 aa  243  5e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  39.41 
 
 		 332 aa  238  8e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  38.29 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  37.28 
 
 		 335 aa  236  4e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  34.63 
 
 		 381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  38.64 
 
 		 325 aa  233  3e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  37.54 
 
 		 372 aa  233  6e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  36.84 
 
 		 356 aa  231  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  35.26 
 
 		 377 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  36.66 
 
 		 333 aa  231  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  34.71 
 
 		 378 aa  228  9e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  34.71 
 
 		 377 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  34.71 
 
 		 377 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  35.88 
 
 		 380 aa  224  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  36.02 
 
 		 353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0047  Radical SAM domain protein  33.97 
 
 		 386 aa  218  1e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.834961  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  34.38 
 
 		 347 aa  218  2e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  36.08 
 
 		 390 aa  215  9e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0999  Radical SAM domain protein  32.07 
 
 		 399 aa  211  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  35.31 
 
 		 479 aa  209  6e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  36.23 
 
 		 364 aa  207  3e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  32.47 
 
 		 382 aa  205  9e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  32.96 
 
 		 496 aa  205  1e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4255  radical SAM domain-containing protein  32.34 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.13913 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  34.1 
 
 		 399 aa  203  3e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  33.71 
 
 		 391 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  31.97 
 
 		 389 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  32.01 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2907  radical SAM domain-containing protein  34.42 
 
 		 389 aa  200  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.386551  normal  0.342339 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  32.04 
 
 		 350 aa  199  5e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 394 aa  196  6e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  33.24 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  34.38 
 
 		 367 aa  194  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  32.58 
 
 		 397 aa  193  5e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  31.71 
 
 		 393 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  32.56 
 
 		 382 aa  192  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  32.41 
 
 		 369 aa  191  2e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  30.92 
 
 		 378 aa  188  1e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  33.04 
 
 		 418 aa  188  1e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  31.61 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  32 
 
 		 480 aa  185  9e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1583  radical SAM domain-containing protein  30.92 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3125  Radical SAM domain protein  30.37 
 
 		 376 aa  184  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  32.58 
 
 		 398 aa  182  6e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  33.05 
 
 		 390 aa  182  7e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.44 
 
 		 394 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  31.96 
 
 		 391 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2740  radical SAM domain-containing protein  31.3 
 
 		 392 aa  181  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  30.4 
 
 		 393 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0941  radical SAM domain-containing protein  29.77 
 
 		 367 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  30.81 
 
 		 399 aa  180  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  31.07 
 
 		 399 aa  180  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  31.93 
 
 		 342 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  30.47 
 
 		 368 aa  178  1e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  31.41 
 
 		 355 aa  178  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  32.49 
 
 		 397 aa  178  1e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  31.91 
 
 		 393 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  30.41 
 
 		 394 aa  177  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  32.28 
 
 		 396 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 		 501 aa  176  7e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  30.81 
 
 		 422 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  29.94 
 
 		 379 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  31.99 
 
 		 359 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.97 
 
 		 399 aa  171  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  29.25 
 
 		 370 aa  170  3e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  31.23 
 
 		 378 aa  169  9e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  28.41 
 
 		 395 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  30.37 
 
 		 405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  28.36 
 
 		 380 aa  156  4e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  28.85 
 
 		 404 aa  156  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>