More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2304 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2304  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 		 550 aa  1101    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1942  protein-export membrane protein SecD  59.92 
 
 		 538 aa  558  1e-157  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0269026  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12607  preprotein translocase subunit SecD  56.64 
 
 		 573 aa  545  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.455392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15100  protein-export membrane protein SecD  56.1 
 
 		 603 aa  432  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2583  preprotein translocase subunit SecD  63.61 
 
 		 599 aa  419  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321622  normal  0.917688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3816  preprotein translocase subunit SecD  63.41 
 
 		 617 aa  412  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258625  normal  0.421333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2315  preprotein translocase subunit SecD  63.81 
 
 		 598 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534551  normal  0.509852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2276  preprotein translocase subunit SecD  63.81 
 
 		 598 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2323  preprotein translocase subunit SecD  63.81 
 
 		 598 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388488  normal  0.491542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1695  protein-export membrane protein SecD  52.22 
 
 		 632 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6109  Preprotein translocase subunit SecD-like protein  39.71 
 
 		 581 aa  349  8e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3391  protein-export membrane protein SecD  57.01 
 
 		 649 aa  335  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000226578  hitchhiker  0.0000733205 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2113  protein-export membrane protein SecD  41.92 
 
 		 584 aa  333  6e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110466  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1798  protein-export membrane protein SecD  37.94 
 
 		 606 aa  318  1e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.427171  normal  0.154883 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1366  protein-export membrane protein SecD  37.87 
 
 		 620 aa  313  2.9999999999999996e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2389  preprotein translocase subunit SecD  38.53 
 
 		 564 aa  309  8e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1996  protein-export membrane protein SecD  35.61 
 
 		 670 aa  308  2.0000000000000002e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.391205  normal  0.0633632 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1670  protein-export membrane protein SecD  37.45 
 
 		 635 aa  307  3e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2299  preprotein translocase subunit SecD  37.29 
 
 		 585 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1341  preprotein translocase subunit SecD  53.15 
 
 		 605 aa  304  3.0000000000000004e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.022847  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5142  preprotein translocase subunit SecD  48.97 
 
 		 680 aa  303  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.75892  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1373  preprotein translocase subunit SecD  48.35 
 
 		 607 aa  302  8.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12860  protein-export membrane protein SecD  39.88 
 
 		 620 aa  300  5e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.258671  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17550  protein-export membrane protein SecD  36.05 
 
 		 714 aa  294  2e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.122587 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13980  protein-export membrane protein SecD  36.19 
 
 		 661 aa  294  3e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2061  protein-export membrane protein SecD  40.86 
 
 		 547 aa  290  6e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.789489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2029  preprotein translocase subunit SecD  37.48 
 
 		 585 aa  287  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000877869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3824  protein-export membrane protein SecD  50.17 
 
 		 656 aa  286  5.999999999999999e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1812  protein-export membrane protein SecD  47.25 
 
 		 666 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2356  protein-export membrane protein SecD  46.62 
 
 		 674 aa  281  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1802  protein-export membrane protein SecD  46.05 
 
 		 653 aa  278  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.414477  decreased coverage  0.00000714928 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3051  protein-export membrane protein SecD  45.63 
 
 		 684 aa  267  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15310  protein-export membrane protein SecD  42.9 
 
 		 640 aa  244  3e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.540675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0945  protein-export membrane protein SecD  36.9 
 
 		 496 aa  242  1e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  30.48 
 
 		 533 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  30.13 
 
 		 533 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  31.47 
 
 		 474 aa  183  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  30.15 
 
 		 534 aa  183  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  29.38 
 
 		 533 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  32.09 
 
 		 532 aa  182  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  31.16 
 
 		 464 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  31.96 
 
 		 533 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  30 
 
 		 487 aa  182  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  31.94 
 
 		 533 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0079  protein-export membrane protein SecD  31.03 
 
 		 515 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  31.15 
 
 		 900 aa  180  7e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  31.5 
 
 		 470 aa  179  9e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  30.61 
 
 		 461 aa  178  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  32.7 
 
 		 470 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  32.7 
 
 		 470 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.91 
 
 		 853 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  33.04 
 
 		 740 aa  173  7.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  29.91 
 
 		 977 aa  172  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  31.76 
 
 		 556 aa  172  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4072  protein-export membrane protein SecD  29.32 
 
 		 885 aa  171  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  32.31 
 
 		 457 aa  171  3e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  30.43 
 
 		 532 aa  171  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  29.88 
 
 		 533 aa  169  9e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  29.43 
 
 		 855 aa  169  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09311  preprotein translocase subunit SecD  30.56 
 
 		 489 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483137  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  31.83 
 
 		 554 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  32.44 
 
 		 759 aa  167  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  38.31 
 
 		 530 aa  167  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0870  preprotein translocase subunit SecD  30.24 
 
 		 489 aa  167  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  30.85 
 
 		 530 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  34.58 
 
 		 406 aa  166  9e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07161  preprotein translocase subunit SecD  28.51 
 
 		 489 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.145798 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0536  protein-export membrane protein SecD  34.18 
 
 		 441 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000245038  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  34.21 
 
 		 535 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  35.46 
 
 		 403 aa  165  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16221  preprotein translocase subunit SecD  28.69 
 
 		 495 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  29.47 
 
 		 493 aa  164  3e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2197  preprotein translocase subunit SecD  32.08 
 
 		 419 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1908  preprotein translocase subunit SecD  32.08 
 
 		 419 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154062  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3104  protein-export membrane protein SecD  29.35 
 
 		 538 aa  164  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000111638  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  29.45 
 
 		 532 aa  163  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09291  preprotein translocase subunit SecD  29.38 
 
 		 487 aa  163  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  32.49 
 
 		 535 aa  162  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  30.13 
 
 		 495 aa  162  1e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10121  preprotein translocase subunit SecD  28.28 
 
 		 486 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0904  protein-export membrane protein SecD  35.17 
 
 		 445 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000019832  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  36.01 
 
 		 533 aa  161  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  30.61 
 
 		 531 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.41 
 
 		 911 aa  162  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  29.65 
 
 		 471 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1455  protein-export membrane protein SecD  30.73 
 
 		 622 aa  160  6e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.202191  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.53 
 
 		 848 aa  160  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5128  preprotein translocase subunit SecD  30.8 
 
 		 464 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.473691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.93 
 
 		 849 aa  159  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  34.62 
 
 		 534 aa  159  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.33 
 
 		 995 aa  157  4e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3326  protein-export membrane protein SecD  28.02 
 
 		 474 aa  157  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.96 
 
 		 856 aa  157  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.06 
 
 		 856 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  37.5 
 
 		 989 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0504  protein-export membrane protein SecD  30.41 
 
 		 462 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000522922  hitchhiker  0.000170526 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  28.71 
 
 		 554 aa  155  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  31.67 
 
 		 410 aa  156  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3982  protein-export membrane protein SecD  27.52 
 
 		 468 aa  156  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  34.3 
 
 		 1029 aa  154  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>