More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0230 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0230  twitching motility protein PilT  100 
 
 		 356 aa  726    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.571301  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0260  pilus retraction protein PilT  93.82 
 
 		 356 aa  694    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0840945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2966  twitching motility protein  82.25 
 
 		 357 aa  622  1e-177  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2031  twitching motility protein  76.27 
 
 		 356 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.517106  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0174  twitching motility protein  71.27 
 
 		 356 aa  545  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000536243 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0192  twitching motility protein  70.99 
 
 		 356 aa  544  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6344  twitching motility protein  51.25 
 
 		 361 aa  357  1.9999999999999998e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2705  twitching motility protein  47.01 
 
 		 370 aa  322  7e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.48227  normal  0.974837 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2714  twitching motility protein  46.44 
 
 		 370 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206929  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2899  twitching motility protein  46.44 
 
 		 370 aa  315  6e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.703969  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2806  twitching motility protein  46.44 
 
 		 370 aa  315  6e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.151465  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  46.43 
 
 		 427 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  47.63 
 
 		 383 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  46.53 
 
 		 437 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  46.13 
 
 		 427 aa  302  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  46.13 
 
 		 427 aa  302  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  47.34 
 
 		 383 aa  301  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  46.9 
 
 		 368 aa  295  6e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  46.75 
 
 		 383 aa  295  7e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1448  twitching motility protein  46.08 
 
 		 358 aa  295  8e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.991053  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  47.04 
 
 		 387 aa  294  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  46.13 
 
 		 386 aa  293  5e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  45.03 
 
 		 347 aa  292  5e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  46.9 
 
 		 370 aa  292  7e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  43.57 
 
 		 347 aa  291  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  44.76 
 
 		 387 aa  291  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  44.19 
 
 		 388 aa  290  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0704  twitching motility protein  47.02 
 
 		 383 aa  290  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0361  twitching motility protein  47.34 
 
 		 372 aa  289  6e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000675189  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  44.28 
 
 		 344 aa  288  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  45.43 
 
 		 360 aa  286  4e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  44.78 
 
 		 347 aa  285  8e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  47.02 
 
 		 352 aa  285  9e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  43.27 
 
 		 347 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  43.58 
 
 		 347 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0669  twitching motility protein  45.24 
 
 		 358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.278448 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  42.7 
 
 		 360 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  43.88 
 
 		 347 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  44.81 
 
 		 350 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  44.44 
 
 		 347 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3256  twitching motility protein  45.11 
 
 		 360 aa  282  6.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  44.32 
 
 		 351 aa  281  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  43.52 
 
 		 366 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  45.03 
 
 		 388 aa  280  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  46.6 
 
 		 351 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  43.52 
 
 		 366 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  42.98 
 
 		 349 aa  280  3e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  44.51 
 
 		 350 aa  280  3e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  45.4 
 
 		 372 aa  280  3e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  42.69 
 
 		 347 aa  279  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  42.69 
 
 		 347 aa  279  5e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  43.23 
 
 		 366 aa  279  6e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  43.31 
 
 		 363 aa  278  1e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  43.88 
 
 		 347 aa  278  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  43.27 
 
 		 347 aa  278  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  44.32 
 
 		 351 aa  278  1e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1068  twitching motility protein  44.18 
 
 		 347 aa  278  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.365161 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  44.14 
 
 		 360 aa  278  2e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  43.32 
 
 		 360 aa  277  2e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0637  twitching motility protein  43.58 
 
 		 347 aa  277  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  45.35 
 
 		 347 aa  276  3e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  43.75 
 
 		 344 aa  276  4e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  42.4 
 
 		 347 aa  276  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  43.15 
 
 		 345 aa  275  7e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  43.58 
 
 		 347 aa  275  8e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  43.23 
 
 		 365 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  43.37 
 
 		 365 aa  273  2.0000000000000002e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  43.64 
 
 		 365 aa  273  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  43.45 
 
 		 344 aa  273  3e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  45.71 
 
 		 339 aa  273  3e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  42.99 
 
 		 347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  42.99 
 
 		 347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3760  Pili biogenesis ATPase  43.58 
 
 		 347 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112866  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1253  twitching motility protein  43.07 
 
 		 344 aa  272  6e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1221  twitching motility protein  43.07 
 
 		 344 aa  272  6e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.475571  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  43.07 
 
 		 345 aa  271  9e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  43.92 
 
 		 344 aa  271  1e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  43.82 
 
 		 345 aa  271  1e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1035  twitching motility protein  44.74 
 
 		 360 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1631  twitching motility protein  42.48 
 
 		 347 aa  271  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0179805 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  42.77 
 
 		 362 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0871  putative protein transport, PilT-like  42.49 
 
 		 378 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0256  twitching motility protein  42.46 
 
 		 359 aa  270  2.9999999999999997e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1066  twitching motility protein  42.49 
 
 		 358 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  41.52 
 
 		 347 aa  269  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  43.27 
 
 		 344 aa  268  8.999999999999999e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0409  twitching motility protein  42.17 
 
 		 370 aa  268  1e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407749  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  43.28 
 
 		 348 aa  268  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  43.75 
 
 		 365 aa  267  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1211  twitching motility protein  46.27 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  43.32 
 
 		 368 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  41.16 
 
 		 356 aa  266  4e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  42.98 
 
 		 403 aa  266  4e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  44.31 
 
 		 397 aa  266  5e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1305  twitching mobility protein  43.42 
 
 		 402 aa  265  8e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1584  twitching motility protein  44.17 
 
 		 373 aa  265  1e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  43.84 
 
 		 382 aa  265  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  44.74 
 
 		 344 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  44.21 
 
 		 366 aa  265  1e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0603  twitching motility protein  42.7 
 
 		 357 aa  263  2e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>