65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5545 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5545  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 443 aa  884    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  96.16 
 
 		 443 aa  832    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1022  XRE family transcriptional regulator  92.78 
 
 		 441 aa  801    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.936661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1397  hypothetical protein  38.3 
 
 		 443 aa  258  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3226  hypothetical protein  37.18 
 
 		 443 aa  247  3e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.407522 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1136  XRE family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 282 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5332  XRE family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 392 aa  126  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  31.02 
 
 		 565 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0340  tetratricopeptide domain-containing protein  30.15 
 
 		 418 aa  95.5  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0702  hypothetical protein  31.15 
 
 		 405 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0275  hypothetical protein  31.21 
 
 		 348 aa  88.2  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.484738  normal  0.794868 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  26.68 
 
 		 478 aa  86.3  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0037  transcriptional regulator, XRE family  24.32 
 
 		 460 aa  80.9  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1662  hypothetical protein  30.59 
 
 		 403 aa  79  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.387756  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0163  hypothetical protein  36.3 
 
 		 505 aa  77.8  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4668  hypothetical protein  34.59 
 
 		 425 aa  74.7  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9241  hypothetical protein  26.03 
 
 		 428 aa  73.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5210  transcriptional regulator, XRE family  24.43 
 
 		 530 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.035838  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5282  hypothetical protein  36.36 
 
 		 470 aa  68.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4409  hypothetical protein  28.23 
 
 		 473 aa  67.4  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2821  helix-turn-helix domain protein  38.95 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803112  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3931  hypothetical protein  27.35 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00536629  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2079  hypothetical protein  44.16 
 
 		 161 aa  65.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0491227  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0166  hypothetical protein  26.19 
 
 		 450 aa  63.2  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00671267  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7352  hypothetical protein  28.37 
 
 		 518 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00560  Helix-turn-helix protein  25.48 
 
 		 456 aa  62.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1813  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.91 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1107  hypothetical protein  29.36 
 
 		 468 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551011  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1270  hypothetical protein  38.27 
 
 		 497 aa  61.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404033  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2547  hypothetical protein  30.11 
 
 		 545 aa  60.1  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.441995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7276  hypothetical protein  29.05 
 
 		 475 aa  60.1  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209812  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1336  hypothetical protein  26.27 
 
 		 556 aa  59.3  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0410246  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1224  regulator  29.18 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483288  normal  0.967223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0334  hypothetical protein  24.5 
 
 		 475 aa  58.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.663709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6244  hypothetical protein  32.5 
 
 		 418 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.699378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5071  hypothetical protein  29.24 
 
 		 403 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.105918  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2099  tetratricopeptide TPR_4  31.71 
 
 		 470 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1281  transcriptional regulator, XRE family  31.91 
 
 		 419 aa  53.9  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.525264  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1749  hypothetical protein  35 
 
 		 107 aa  52.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.558396  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3392  twin-arginine translocation pathway signal  25.77 
 
 		 479 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4418  tetratricopeptide TPR_4  27.21 
 
 		 439 aa  50.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1130  hypothetical protein  34.15 
 
 		 443 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.823409  normal  0.981294 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4891  hypothetical protein  26.41 
 
 		 444 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4090  twin-arginine translocation pathway signal  23.73 
 
 		 503 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2005  transcriptional regulator, XRE family  24.61 
 
 		 388 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.445906  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14230  hypothetical protein  25.09 
 
 		 433 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3948  hypothetical protein  22.8 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4484  hypothetical protein  27.96 
 
 		 447 aa  49.3  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0895  putative DNA-binding protein  27.3 
 
 		 503 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6356  transcriptional regulator, XRE family  26.09 
 
 		 406 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4244  formylmethionine deformylase  33.77 
 
 		 549 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.928565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1987  helix-turn-helix domain-containing protein  35.06 
 
 		 415 aa  47.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00401079  normal  0.325189 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07960  Helix-turn-helix protein  33.87 
 
 		 444 aa  47.4  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0523  XRE family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 331 aa  47  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6759  putative HTH-type transcriptional regulator  27.6 
 
 		 427 aa  46.6  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5529  XRE family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 327 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0952  hypothetical protein  24.11 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  21.13 
 
 		 828 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6107  XRE family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0526222 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2311  helix-turn-helix domain-containing protein  27.98 
 
 		 424 aa  43.9  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.4937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8777  transcriptional regulator  31.5 
 
 		 469 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.756748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3968  hypothetical protein  30.46 
 
 		 457 aa  43.5  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0256959  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9064  hypothetical protein  24.09 
 
 		 431 aa  43.5  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5660  XRE family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 490 aa  43.5  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176576  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2422  hypothetical protein  33.33 
 
 		 510 aa  43.5  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0414042  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>