More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2338 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2338  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 263 aa  518  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317534  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1479  transcriptional regulator, AraC family  56.2 
 
 		 263 aa  248  7e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0283  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 		 246 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31220  transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  44.98 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13867  AraC family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.549724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3142  transcriptional regulator, AraC-family  49.1 
 
 		 278 aa  182  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  43.83 
 
 		 241 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2853  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  45.25 
 
 		 259 aa  176  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4553  AraC family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 333 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  41.1 
 
 		 299 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  37.82 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 257 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1502  transcriptional regulator, AraC family  36.97 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0346176  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3003  AraC family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  40.44 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 278 aa  149  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2857  helix-turn-helix domain-containing protein  37.39 
 
 		 295 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.611855  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  40.99 
 
 		 248 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 273 aa  149  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 263 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 257 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1375  AraC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 294 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000191451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 278 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  42.98 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 293 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 293 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 293 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 293 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 293 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 256 aa  145  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 311 aa  145  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 287 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 287 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 287 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 287 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 287 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 287 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 297 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4458  AraC family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  39.04 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  39.04 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1308  AraC family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.998927 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 450 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 288 aa  142  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0235  AraC family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 263 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1849  transcriptional regulator, AraC family  36.67 
 
 		 280 aa  142  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  39.3 
 
 		 296 aa  142  8e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  41.08 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  41.08 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37350  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  40.48 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  45.05 
 
 		 270 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  39.65 
 
 		 260 aa  138  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 272 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  40.53 
 
 		 260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3097  AraC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 272 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2825  AraC family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 267 aa  135  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.254637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5572  transcriptional regulator, AraC family  41.85 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  38.1 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0628  AraC family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458217  hitchhiker  0.000431435 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0583  AraC family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2070  AraC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.527007 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0622  helix-turn-helix domain-containing protein  39.73 
 
 		 259 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3673  helix-turn-helix domain-containing protein  36.04 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  39.13 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4366  AraC family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 262 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 247 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 268 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 283 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3997  AraC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.415557 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3275  AraC/XylS family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 260 aa  132  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504601 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  37.66 
 
 		 265 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  37.66 
 
 		 265 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  35.93 
 
 		 281 aa  132  7.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4581  AraC family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0126281 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5531  transcriptional regulator, AraC family  44.44 
 
 		 249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.25231 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0054  transcriptional regulator, AraC family  36.82 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1128  AraC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 266 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01153  transcriptional regulator  39.75 
 
 		 283 aa  129  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  37 
 
 		 265 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4026  AraC family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 267 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1291  transcriptional regulator, AraC family  40.69 
 
 		 268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2750  putative transcriptional regulator  39.46 
 
 		 254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0254  transcriptional regulator, AraC family  38.01 
 
 		 264 aa  129  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>