85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1285 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1285  hypothetical protein  100 
 
 		 415 aa  829    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193911  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3455  putative lipoprotein  69.29 
 
 		 418 aa  535  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.235747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5560  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  24.43 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6648  Extracellular ligand-binding receptor  25.87 
 
 		 382 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0122953  normal  0.152 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4487  putative high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.24 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3597  extracellular ligand-binding receptor  22.28 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5695  Extracellular ligand-binding receptor  28.71 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0211011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4140  extracellular ligand-binding receptor  26.94 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.544868 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4127  extracellular ligand-binding receptor  25.31 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.515914  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2697  putative branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.23 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0487  extracellular ligand-binding receptor  23.46 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4563  putative lipoprotein  37.29 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1976  Extracellular ligand-binding receptor  27.82 
 
 		 412 aa  57  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.448031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3225  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  28.05 
 
 		 416 aa  57  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2954  hypothetical protein  28.92 
 
 		 415 aa  57  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0700  urea ABC transporter, urea binding protein  24.69 
 
 		 463 aa  55.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0172324  hitchhiker  0.0000000649369 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1267  Extracellular ligand-binding receptor  29.51 
 
 		 471 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1298  Extracellular ligand-binding receptor  29.51 
 
 		 471 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5667  putative Leu/Ile/Val/Thr-binding protein precursor; putative signal peptide  23.94 
 
 		 447 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3860  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  25 
 
 		 391 aa  53.9  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3798  extracellular ligand-binding receptor  24.89 
 
 		 402 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0893  extracellular ligand-binding receptor  28.05 
 
 		 396 aa  52.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2596  extracellular ligand-binding receptor  25.22 
 
 		 402 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3030  Extracellular ligand-binding receptor  26.14 
 
 		 374 aa  53.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394704  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3029  Extracellular ligand-binding receptor  22.93 
 
 		 370 aa  52.8  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3749  extracellular ligand-binding receptor  26.14 
 
 		 374 aa  52.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.314564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2260  urea ABC transporter, urea binding protein  22.98 
 
 		 440 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.411735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3748  extracellular ligand-binding receptor  22.56 
 
 		 370 aa  51.6  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4342  extracellular ligand-binding receptor  24.24 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688129 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0851  extracellular ligand-binding receptor  27.11 
 
 		 396 aa  51.2  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.532444  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3221  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  28.73 
 
 		 413 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1842  extracellular ligand-binding receptor  24.37 
 
 		 394 aa  50.4  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.843132  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3216  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  28.33 
 
 		 403 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.844613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2330  extracellular ligand-binding receptor  24.1 
 
 		 421 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26288  normal  0.0264278 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2338  extracellular ligand-binding receptor  23.58 
 
 		 421 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.267805 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2291  extracellular ligand-binding receptor  23.58 
 
 		 421 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553297  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5291  putative branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  40.74 
 
 		 418 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2270  extracellular ligand-binding receptor  24.79 
 
 		 391 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.733577  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3230  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  28.33 
 
 		 403 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4361  extracellular ligand-binding receptor  22.44 
 
 		 438 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000367621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  22.36 
 
 		 382 aa  48.9  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0852  hypothetical protein  25 
 
 		 451 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.344076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0549  extracellular ligand-binding receptor  22.81 
 
 		 384 aa  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0380  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  30.83 
 
 		 442 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  37.68 
 
 		 379 aa  47.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1306  Extracellular ligand-binding receptor  28.77 
 
 		 471 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0130  extracellular ligand-binding receptor  21.14 
 
 		 423 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0243473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  23.81 
 
 		 394 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3815  extracellular ligand-binding receptor  28.72 
 
 		 368 aa  47.4  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  23.6 
 
 		 390 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3654  extracellular ligand-binding receptor  30.1 
 
 		 399 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2248  Extracellular ligand-binding receptor  22.45 
 
 		 410 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3219  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  25.84 
 
 		 410 aa  47  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.304143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3317  Extracellular ligand-binding receptor  24.84 
 
 		 401 aa  47  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2907  putative branched-chain amino acid transport system  27.31 
 
 		 433 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.787747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3009  extracellular ligand-binding receptor  25.4 
 
 		 415 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000545529  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  24.83 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1050  extracellular ligand-binding receptor  25.22 
 
 		 381 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.464924 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0645  extracellular ligand-binding receptor  23.62 
 
 		 386 aa  46.6  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29741  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  22.35 
 
 		 431 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1687  extracellular ligand-binding receptor  26.4 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1889  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.808445  normal  0.559234 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2862  urea ABC transporter, urea binding protein  22.22 
 
 		 443 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  22.46 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4935  Extracellular ligand-binding receptor  23.08 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  26.51 
 
 		 381 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  34.78 
 
 		 380 aa  44.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22980  amino acid-binding protein  24.24 
 
 		 434 aa  44.3  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0512293  normal  0.104714 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4167  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  26.01 
 
 		 410 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3575  extracellular ligand-binding receptor  25.7 
 
 		 385 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.807298  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1429  Extracellular ligand-binding receptor  25.37 
 
 		 386 aa  43.9  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0505624  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1469  extracellular ligand-binding receptor  26.82 
 
 		 396 aa  43.9  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  34.78 
 
 		 379 aa  43.9  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000518039 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  27.73 
 
 		 376 aa  43.9  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  29.1 
 
 		 376 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2131  Extracellular ligand-binding receptor  28.08 
 
 		 813 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.651568 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4528  extracellular ligand-binding receptor  29.86 
 
 		 413 aa  43.5  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1152  UreA/short-chain amide ABC transporter  22.54 
 
 		 415 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.471291  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1328  Extracellular ligand-binding receptor  34.78 
 
 		 397 aa  43.5  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.125298  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0049  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  32.65 
 
 		 419 aa  43.5  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1823  extracellular ligand-binding receptor  26.34 
 
 		 380 aa  43.5  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1321  Extracellular ligand-binding receptor  29.06 
 
 		 444 aa  43.5  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1991  Extracellular ligand-binding receptor  25.7 
 
 		 385 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179885  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  32.39 
 
 		 379 aa  43.1  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1211  Extracellular ligand-binding receptor  24.35 
 
 		 390 aa  42.7  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.391251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>