299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4198 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  55.35 
 
 		 600 aa  675    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 598 aa  1225    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  50.57 
 
 		 625 aa  652    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  51.73 
 
 		 597 aa  631  1e-179  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  50.5 
 
 		 607 aa  614  9.999999999999999e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  47.93 
 
 		 604 aa  588  1e-167  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0530  Beta-galactosidase  42.21 
 
 		 591 aa  437  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  39.38 
 
 		 568 aa  426  1e-118  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  37.44 
 
 		 587 aa  427  1e-118  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  38.43 
 
 		 603 aa  410  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  30.35 
 
 		 563 aa  226  1e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  29.93 
 
 		 564 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  29.3 
 
 		 803 aa  205  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  29.2 
 
 		 897 aa  204  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  28.54 
 
 		 558 aa  203  7e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  25.48 
 
 		 603 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.73903 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  25.48 
 
 		 603 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  25.32 
 
 		 603 aa  202  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  25.48 
 
 		 603 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  30.62 
 
 		 644 aa  202  1.9999999999999998e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1692  beta-D-glucuronidase  25.48 
 
 		 603 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1670  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.92 
 
 		 598 aa  200  6e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3313  beta-D-glucuronidase  26.27 
 
 		 603 aa  200  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  25.32 
 
 		 603 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01586  beta-D-glucuronidase  25.32 
 
 		 603 aa  199  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01576  hypothetical protein  25.32 
 
 		 603 aa  199  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  26.66 
 
 		 862 aa  192  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  26.5 
 
 		 824 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0698  beta-D-glucuronidase  27.08 
 
 		 599 aa  191  4e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  26.6 
 
 		 670 aa  189  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  28.09 
 
 		 601 aa  189  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  26.37 
 
 		 596 aa  189  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  26.8 
 
 		 577 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2086  Beta-glucuronidase  27.48 
 
 		 512 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000473091  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1310  Beta-glucuronidase  28.47 
 
 		 588 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  25.04 
 
 		 590 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  28.34 
 
 		 707 aa  174  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  27.07 
 
 		 848 aa  172  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  24.56 
 
 		 598 aa  162  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  28.93 
 
 		 894 aa  161  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  25.99 
 
 		 686 aa  161  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  24.54 
 
 		 888 aa  160  6e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  27.22 
 
 		 738 aa  159  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  29.77 
 
 		 972 aa  158  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2447  Beta-galactosidase  23.42 
 
 		 677 aa  154  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.18 
 
 		 892 aa  154  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  27.47 
 
 		 704 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  24.74 
 
 		 717 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4911  Beta-galactosidase  25 
 
 		 1003 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114803  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  26.76 
 
 		 750 aa  138  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  24.14 
 
 		 889 aa  137  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  25.93 
 
 		 1129 aa  137  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0951  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.33 
 
 		 741 aa  136  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.87628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3917  glycoside hydrolase family protein  26.09 
 
 		 1020 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.45 
 
 		 747 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.5 
 
 		 748 aa  132  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.41 
 
 		 923 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  24.19 
 
 		 1063 aa  130  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.8 
 
 		 858 aa  130  8.000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  25.39 
 
 		 1171 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3466  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.56 
 
 		 968 aa  130  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.52907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  25 
 
 		 743 aa  127  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2021  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.59 
 
 		 640 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.85 
 
 		 813 aa  127  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  30.36 
 
 		 804 aa  127  7e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  24.64 
 
 		 1084 aa  127  8.000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.08 
 
 		 1041 aa  126  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02463  beta-galactosidase (Eurofung)  25.94 
 
 		 1023 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.220978 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  25.99 
 
 		 804 aa  125  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  26.73 
 
 		 811 aa  125  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1366  beta-galactosidase  27.47 
 
 		 1026 aa  124  3e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1608  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.27 
 
 		 1093 aa  124  4e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  24.09 
 
 		 1084 aa  124  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  27.91 
 
 		 806 aa  124  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  29.44 
 
 		 785 aa  123  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  27.31 
 
 		 827 aa  123  9e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.36 
 
 		 787 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3719  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.27 
 
 		 1004 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  25.92 
 
 		 815 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  25.66 
 
 		 964 aa  120  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14320  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  26.27 
 
 		 992 aa  120  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  26.29 
 
 		 763 aa  120  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  26.75 
 
 		 859 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3379  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.14 
 
 		 992 aa  119  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  27.96 
 
 		 781 aa  118  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.96 
 
 		 781 aa  118  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.3 
 
 		 1018 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  25.06 
 
 		 1077 aa  117  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  26.68 
 
 		 1035 aa  117  7.999999999999999e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  25.67 
 
 		 919 aa  116  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  28.28 
 
 		 832 aa  115  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.45 
 
 		 884 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  24.33 
 
 		 754 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1433  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.16 
 
 		 1003 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.77 
 
 		 794 aa  114  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.56 
 
 		 805 aa  114  5e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.22 
 
 		 837 aa  114  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  27.29 
 
 		 922 aa  114  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  24.2 
 
 		 928 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  26.48 
 
 		 1046 aa  112  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>