289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2082 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2632  HflK  55.22 
 
 
607 aa  697    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  100 
 
 
600 aa  1247    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  56.51 
 
 
598 aa  671    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  47.64 
 
 
597 aa  627  1e-178  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  47.81 
 
 
625 aa  616  1e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  47.68 
 
 
604 aa  609  1e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0530  Beta-galactosidase  41.14 
 
 
591 aa  436  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  38.53 
 
 
587 aa  431  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  37.54 
 
 
603 aa  404  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  36.77 
 
 
568 aa  396  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  30.83 
 
 
563 aa  219  1e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  29.47 
 
 
803 aa  215  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  30.84 
 
 
564 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  27.85 
 
 
558 aa  211  4e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  25.78 
 
 
824 aa  197  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  26.72 
 
 
644 aa  196  9e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  26.3 
 
 
577 aa  195  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  26.8 
 
 
670 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  26.87 
 
 
590 aa  190  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  27.1 
 
 
603 aa  189  9e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  27.1 
 
 
603 aa  189  9e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  27.1 
 
 
603 aa  188  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  26.93 
 
 
603 aa  188  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.73903 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1692  beta-D-glucuronidase  26.93 
 
 
603 aa  187  5e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3313  beta-D-glucuronidase  26.82 
 
 
603 aa  186  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01586  beta-D-glucuronidase  26.93 
 
 
603 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1670  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.22 
 
 
598 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01576  hypothetical protein  26.93 
 
 
603 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  26.76 
 
 
603 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1310  Beta-glucuronidase  25.96 
 
 
588 aa  183  6e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  27.13 
 
 
862 aa  182  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  25.67 
 
 
596 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0698  beta-D-glucuronidase  27.45 
 
 
599 aa  179  9e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  25.43 
 
 
601 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2086  Beta-glucuronidase  27.21 
 
 
512 aa  173  5.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000473091  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  29.03 
 
 
738 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  29.26 
 
 
972 aa  169  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  25.08 
 
 
598 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  27.6 
 
 
897 aa  164  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  26.25 
 
 
848 aa  163  9e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  26.86 
 
 
889 aa  159  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  27.51 
 
 
686 aa  158  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  26.9 
 
 
750 aa  158  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  29.57 
 
 
743 aa  157  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.23 
 
 
892 aa  152  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  27 
 
 
707 aa  148  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  24.34 
 
 
888 aa  147  8.000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  24.73 
 
 
923 aa  145  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  26.61 
 
 
704 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  24.31 
 
 
717 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.2 
 
 
747 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.9 
 
 
748 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0951  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.2 
 
 
741 aa  137  5e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.87628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  28.19 
 
 
763 aa  136  9e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.93 
 
 
858 aa  135  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  26.12 
 
 
754 aa  133  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3719  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.83 
 
 
1004 aa  133  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  26.52 
 
 
815 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  28.16 
 
 
785 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  26.85 
 
 
894 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  28.92 
 
 
804 aa  130  6e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3917  glycoside hydrolase family protein  27.46 
 
 
1020 aa  130  8.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  25.09 
 
 
1129 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.98 
 
 
986 aa  129  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  26.03 
 
 
1045 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1366  beta-galactosidase  27.2 
 
 
1026 aa  128  3e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2447  Beta-galactosidase  21.21 
 
 
677 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  28.19 
 
 
804 aa  127  7e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  25.94 
 
 
1084 aa  127  7e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5411  beta-galactosidase  26.36 
 
 
1008 aa  126  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111624  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2734  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.48 
 
 
920 aa  126  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  26.84 
 
 
1043 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  25.94 
 
 
1084 aa  124  5e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  25.7 
 
 
1059 aa  124  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3160  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 
1185 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  28.89 
 
 
1108 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.73 
 
 
1026 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.79 
 
 
1041 aa  121  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.55 
 
 
781 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  27.55 
 
 
781 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  25.16 
 
 
1455 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  29.45 
 
 
1046 aa  120  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.34 
 
 
805 aa  120  9e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02463  beta-galactosidase (Eurofung)  26.51 
 
 
1023 aa  120  9e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.220978 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.43 
 
 
794 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  28.06 
 
 
827 aa  119  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.82 
 
 
920 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  26.86 
 
 
1079 aa  118  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  28.4 
 
 
1035 aa  117  6e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0998  Beta-galactosidase  26.45 
 
 
1012 aa  117  7.999999999999999e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00145387  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.75 
 
 
884 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3379  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.23 
 
 
992 aa  115  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.74 
 
 
1424 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  28.17 
 
 
951 aa  114  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2021  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25 
 
 
640 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  26.46 
 
 
1077 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3466  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.87 
 
 
968 aa  114  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.52907  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  25.94 
 
 
1019 aa  114  5e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4911  Beta-galactosidase  24.71 
 
 
1003 aa  114  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114803  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  27.25 
 
 
806 aa  114  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>