More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0013 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0013  methylmalonyl-CoA mutase  100 
 
 		 453 aa  934    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.431519  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07140  methylmalonyl-COA mutase small subunit  57.05 
 
 		 448 aa  512  1e-144  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1656  methylmalonyl-CoA mutase, small subunit  31.19 
 
 		 618 aa  211  2e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.50388 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1168  Methylmalonyl-CoA mutase  30.95 
 
 		 591 aa  192  7e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.648096  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6641  Methylmalonyl-CoA mutase  28.33 
 
 		 448 aa  173  6.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2295  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  30.69 
 
 		 681 aa  172  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0869  Methylmalonyl-CoA mutase  29.29 
 
 		 604 aa  168  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0278  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  28.51 
 
 		 682 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1984  Methylmalonyl-CoA mutase  27.72 
 
 		 684 aa  164  3e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611894  normal  0.0597183 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1165  methylmalonyl-CoA mutase  27.83 
 
 		 589 aa  160  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1348  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  25.53 
 
 		 713 aa  156  9e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000457861  unclonable  0.00000004793 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1291  methylmalonyl-CoA mutase  25.53 
 
 		 588 aa  154  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.788589 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0544  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  25.48 
 
 		 723 aa  153  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1222  methylmalonyl-CoA mutase N-terminal domain-containing protein  27.93 
 
 		 597 aa  152  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5687  methylmalonyl-CoA mutase  36.71 
 
 		 712 aa  151  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1762  methylmalonyl-CoA mutase  26.93 
 
 		 621 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223035 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4237  methylmalonyl-CoA mutase  36.29 
 
 		 712 aa  150  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2192  methylmalonyl-CoA mutase  37.04 
 
 		 709 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172259  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0867  methylmalonyl-CoA mutase  37.04 
 
 		 709 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1702  methylmalonyl-CoA mutase  38.53 
 
 		 718 aa  148  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321557 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1929  methylmalonyl-CoA mutase  26.73 
 
 		 623 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.102484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0726  methylmalonyl-CoA mutase  37.45 
 
 		 712 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.999011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3681  methylmalonyl-CoA mutase  36.61 
 
 		 714 aa  147  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2236  methylmalonyl-CoA mutase  26.51 
 
 		 639 aa  146  6e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2636  methylmalonyl-CoA mutase  26.43 
 
 		 629 aa  146  6e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.668897  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2300  methylmalonyl-CoA mutase  36.71 
 
 		 709 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3871  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  25.27 
 
 		 720 aa  146  8.000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.949138  normal  0.194963 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2480  methylmalonyl-CoA mutase  25.11 
 
 		 698 aa  146  9e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2041  Methylmalonyl-CoA mutase  27.03 
 
 		 623 aa  146  9e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3023  methylmalonyl-CoA mutase small subunit (MCM-beta)  27.54 
 
 		 621 aa  146  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_004310  BR1190  methylmalonyl-CoA mutase  37.08 
 
 		 712 aa  145  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.942727  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6136  methylmalonyl-CoA mutase  35.44 
 
 		 717 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0179109  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2665  Methylmalonyl-CoA mutase  27.23 
 
 		 605 aa  143  8e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6098  methylmalonyl-CoA mutase  36.71 
 
 		 712 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.23929  normal  0.554736 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2001  methylmalonyl-CoA mutase  36.71 
 
 		 714 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2388  methylmalonyl-CoA mutase  28.41 
 
 		 605 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.55342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1865  methylmalonyl-CoA mutase  34.23 
 
 		 661 aa  140  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6511  methylmalonyl-CoA mutase  36.29 
 
 		 712 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1285  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  25.42 
 
 		 727 aa  139  8.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.238431  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3367  methylmalonyl-CoA mutase  34.02 
 
 		 709 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1943  methylmalonyl-CoA mutase  26.9 
 
 		 653 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133903 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1014  methylmalonyl-CoA mutase  35.08 
 
 		 719 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.856859 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0388  methylmalonyl-CoA mutase  35.06 
 
 		 714 aa  135  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3260  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  35.17 
 
 		 713 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3006  methylmalonyl-CoA mutase  27.76 
 
 		 660 aa  134  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.84067  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0079  methylmalonyl-CoA mutase  34.53 
 
 		 706 aa  133  5e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.373309  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5544  Methylmalonyl-CoA mutase  29.5 
 
 		 644 aa  133  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.11647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2891  methylmalonyl-CoA mutase  25.99 
 
 		 716 aa  131  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1320  methylmalonyl-CoA mutase  34.03 
 
 		 722 aa  131  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2127  methylmalonyl-CoA mutase  33.47 
 
 		 720 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.063815  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1223  methylmalonyl-CoA mutase  34.8 
 
 		 712 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5804  methylmalonyl-CoA mutase  33.47 
 
 		 972 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.256305  normal  0.17905 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3305  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  29.36 
 
 		 706 aa  130  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.457427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2345  Methylmalonyl-CoA mutase  25.96 
 
 		 605 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.418628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3398  methylmalonyl-CoA mutase  33.6 
 
 		 731 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.526303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1173  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  33.86 
 
 		 1106 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00593374 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3536  methylmalonyl-CoA mutase  26.89 
 
 		 623 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0287465  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3486  methylmalonyl-CoA mutase  34.3 
 
 		 721 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2506  Methylmalonyl-CoA mutase  31.16 
 
 		 614 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000082079  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3135  methylmalonyl-CoA mutase  26.06 
 
 		 629 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6640  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  34.52 
 
 		 724 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.70273 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2805  methylmalonyl-CoA mutase  32.08 
 
 		 719 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3785  Methylmalonyl-CoA mutase  32.12 
 
 		 621 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.546238 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4006  methylmalonyl-CoA mutase  34.02 
 
 		 716 aa  126  6e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2161  methylmalonyl-CoA mutase  32.5 
 
 		 723 aa  127  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385791  normal  0.481947 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2383  methylmalonyl-CoA mutase  33.33 
 
 		 718 aa  126  8.000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51830  methylmalonyl-coa mutase  30.77 
 
 		 719 aa  126  8.000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4374  Methylmalonyl-CoA mutase  28.34 
 
 		 640 aa  125  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2040  methylmalonyl-CoA mutase  33.33 
 
 		 720 aa  125  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07125  methylmalonyl-CoA mutase  33.74 
 
 		 707 aa  125  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3753  methylmalonyl-CoA mutase  32.93 
 
 		 738 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801598  normal  0.879758 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1849  methylmalonyl-CoA mutase  33.33 
 
 		 720 aa  124  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2510  methylmalonyl-CoA mutase  32.5 
 
 		 722 aa  124  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0811  methylmalonyl-CoA mutase  25.55 
 
 		 714 aa  124  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251875  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3649  methylmalonyl-CoA mutase  30.74 
 
 		 752 aa  123  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2697  methylmalonyl-CoA mutase  31.33 
 
 		 720 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.20812 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1921  methylmalonyl-CoA mutase  24.15 
 
 		 601 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00796016  normal  0.671948 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0857  methylmalonyl-CoA mutase  26.91 
 
 		 479 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315986  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02748  methylmalonyl-CoA mutase  31.82 
 
 		 714 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3075  methylmalonyl-CoA mutase  31.82 
 
 		 714 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4213  methylmalonyl-CoA mutase  31.82 
 
 		 714 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1292  methylmalonyl-CoA mutase  32.43 
 
 		 714 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1927  methylmalonyl-CoA mutase  32.11 
 
 		 719 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.273596  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3244  methylmalonyl-CoA mutase  31.82 
 
 		 714 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98625  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02711  hypothetical protein  31.82 
 
 		 714 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0793  methylmalonyl-CoA mutase  31.82 
 
 		 714 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1760  methylmalonyl-CoA mutase  32 
 
 		 718 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.226069 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3053  methylmalonyl-CoA mutase  31.4 
 
 		 714 aa  121  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0776  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  31.82 
 
 		 714 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3630  methylmalonyl-CoA mutase  33.76 
 
 		 717 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5425  methylmalonyl-CoA mutase  23.76 
 
 		 612 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.559772  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0910  methylmalonyl-CoA mutase  33.33 
 
 		 739 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.736612  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4573  methylmalonyl-CoA mutase  30.58 
 
 		 720 aa  120  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3538  methylmalonyl-CoA mutase  32 
 
 		 736 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.162308  normal  0.256268 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1920  methylmalonyl-CoA mutase large subunit  31.54 
 
 		 720 aa  119  9e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0552222  normal  0.617547 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0545  methylmalonyl-CoA mutase  34.32 
 
 		 740 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3005  methylmalonyl-CoA mutase  31.78 
 
 		 754 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.598546  normal  0.356991 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3629  methylmalonyl-CoA mutase  24.22 
 
 		 489 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0932  methylmalonyl-CoA mutase  33.61 
 
 		 724 aa  119  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3872  methylmalonyl-CoA mutase  33.47 
 
 		 740 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.231489  normal  0.125312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>