More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0340 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  100 
 
 
165 aa  345  2e-94  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52.73 
 
 
163 aa  105  4e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.21 
 
 
169 aa  103  8e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.83 
 
 
165 aa  103  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.76 
 
 
156 aa  102  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  63.41 
 
 
170 aa  101  4e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  65.79 
 
 
156 aa  101  5e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.44 
 
 
158 aa  100  7e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  61.9 
 
 
151 aa  100  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  62.96 
 
 
163 aa  97.4  7e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.62 
 
 
175 aa  96.7  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  38.82 
 
 
172 aa  96.7  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  61.84 
 
 
167 aa  96.7  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  64.86 
 
 
169 aa  97.1  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53 
 
 
157 aa  95.5  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  63.16 
 
 
152 aa  94.7  5e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  66.2 
 
 
155 aa  94  8e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  63.89 
 
 
155 aa  93.2  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  65.28 
 
 
171 aa  92.8  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  64 
 
 
147 aa  92.4  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  60 
 
 
168 aa  91.7  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  58.44 
 
 
163 aa  91.7  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.55 
 
 
171 aa  91.3  5e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60 
 
 
161 aa  90.5  9e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.53 
 
 
167 aa  90.5  9e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.97 
 
 
172 aa  89.7  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  50.5 
 
 
182 aa  89.4  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  38.82 
 
 
171 aa  89.4  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  60.27 
 
 
174 aa  89.7  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.25 
 
 
171 aa  89.7  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  67.57 
 
 
159 aa  88.6  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.04 
 
 
167 aa  89  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0788  putative pilus assembly protein major pilin PilA  60.53 
 
 
79 aa  88.2  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0173637  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  36.05 
 
 
158 aa  88.6  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.81 
 
 
168 aa  88.2  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.46 
 
 
154 aa  87.8  6e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.05 
 
 
157 aa  87.8  7e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60 
 
 
163 aa  85.9  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.75 
 
 
193 aa  85.1  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  39.24 
 
 
172 aa  84.7  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  51.69 
 
 
136 aa  84.7  6e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  46.32 
 
 
155 aa  84.7  6e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  62.86 
 
 
175 aa  84.3  7e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  56.67 
 
 
151 aa  83.2  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.64 
 
 
161 aa  82.4  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.89 
 
 
166 aa  82  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.34 
 
 
167 aa  80.5  0.000000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  56.25 
 
 
169 aa  79.3  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.56 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  34.55 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.97 
 
 
157 aa  79  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  66.07 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0669  fimbrial protein EcpC precursor  81.25 
 
 
48 aa  78.2  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  56.41 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  51.39 
 
 
169 aa  73.9  0.0000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  60.29 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0535  hypothetical protein  60.71 
 
 
634 aa  69.3  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000025366  normal  0.911782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  34.62 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  60.71 
 
 
527 aa  68.9  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.62 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  58.93 
 
 
567 aa  67  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1230  hypothetical protein  57.89 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.38 
 
 
174 aa  64.7  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0526  hypothetical protein  42.68 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000137512  normal  0.350549 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0692  hypothetical protein  57.41 
 
 
548 aa  62.8  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000140435  unclonable  7.26108e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  55.17 
 
 
174 aa  62.4  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  63.83 
 
 
170 aa  61.2  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  43.42 
 
 
142 aa  60.8  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  37.5 
 
 
176 aa  60.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0936  general secretion pathway protein  39.73 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  42.11 
 
 
186 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  47.95 
 
 
176 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  42.11 
 
 
186 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  47.95 
 
 
176 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  44.16 
 
 
160 aa  58.9  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3385  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  49.02 
 
 
199 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  62.79 
 
 
167 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  55.32 
 
 
196 aa  58.5  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  56.52 
 
 
174 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  57.45 
 
 
166 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  47.76 
 
 
179 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  37.35 
 
 
168 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1201  Tfp pilus assembly protein PilE-like  46.27 
 
 
189 aa  57.8  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  63.41 
 
 
141 aa  57.4  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3944  fimbrial protein pilin  53.19 
 
 
166 aa  57.4  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.736158  hitchhiker  0.00123211 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  57.45 
 
 
169 aa  57.4  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  51.92 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  56.52 
 
 
170 aa  57  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  57.14 
 
 
169 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  50.85 
 
 
187 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  58.14 
 
 
179 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  60.98 
 
 
169 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  57.14 
 
 
167 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  58.14 
 
 
163 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  63.41 
 
 
162 aa  55.5  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  34.69 
 
 
136 aa  55.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  60.98 
 
 
173 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  60.42 
 
 
138 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  53.49 
 
 
182 aa  55.1  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  49.09 
 
 
168 aa  55.1  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>