More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ecaj_0032 on replicon NC_007354
Organism: Ehrlichia canis str. Jake



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007354  Ecaj_0032  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 441 aa  904    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0060  tRNA modification GTPase TrmE  86.33 
 
 		 439 aa  797    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.646746  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0981  tRNA modification GTPase TrmE  47.32 
 
 		 508 aa  436  1e-121  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1272  tRNA modification GTPase TrmE  42.28 
 
 		 438 aa  326  5e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.803467 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2964  tRNA modification GTPase TrmE  41.7 
 
 		 438 aa  322  8e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3624  tRNA modification GTPase TrmE  38.26 
 
 		 455 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.473452  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1029  tRNA modification GTPase TrmE  38.53 
 
 		 434 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.111023  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0717  tRNA modification GTPase TrmE  52.72 
 
 		 550 aa  306  5.0000000000000004e-82  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1284  tRNA modification GTPase TrmE  40.36 
 
 		 451 aa  298  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1580  tRNA modification GTPase TrmE  38.12 
 
 		 444 aa  298  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1411  tRNA modification GTPase TrmE  36.56 
 
 		 437 aa  290  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0098  tRNA modification GTPase TrmE  38.73 
 
 		 456 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0727899 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1833  tRNA modification GTPase TrmE  38.14 
 
 		 431 aa  286  4e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0890064  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1658  tRNA modification GTPase TrmE  37.08 
 
 		 444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.844134  normal  0.296272 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2587  tRNA modification GTPase TrmE  38.15 
 
 		 448 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1859  tRNA modification GTPase TrmE  35.96 
 
 		 444 aa  282  9e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3454  tRNA modification GTPase TrmE  38.17 
 
 		 429 aa  281  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4390  tRNA modification GTPase TrmE  38.63 
 
 		 436 aa  280  5e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0291  tRNA modification GTPase TrmE  37.36 
 
 		 449 aa  279  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1940  tRNA modification GTPase TrmE  37.25 
 
 		 435 aa  278  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.704243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0164  tRNA modification GTPase TrmE  40.22 
 
 		 445 aa  277  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.364073  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2929  tRNA modification GTPase TrmE  36.7 
 
 		 446 aa  276  4e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0392  tRNA modification GTPase TrmE  38.12 
 
 		 460 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2864  tRNA modification GTPase TrmE  38.39 
 
 		 428 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0429  tRNA modification GTPase TrmE  37.74 
 
 		 462 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0106  tRNA modification GTPase TrmE  38.78 
 
 		 457 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.446893  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3073  tRNA modification GTPase TrmE  36.34 
 
 		 446 aa  273  3e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  37.58 
 
 		 452 aa  270  4e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  37.58 
 
 		 473 aa  270  5.9999999999999995e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1982  tRNA modification GTPase TrmE  38.31 
 
 		 442 aa  269  7e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.535641  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4081  tRNA modification GTPase TrmE  36.83 
 
 		 441 aa  269  7e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0162579 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0297  tRNA modification GTPase TrmE  38.31 
 
 		 441 aa  269  8e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2667  tRNA modification GTPase TrmE  36.83 
 
 		 428 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0398705  normal  0.380735 
 
 
-
 
NC_004310  BR2062  tRNA modification GTPase TrmE  38.08 
 
 		 442 aa  267  2.9999999999999995e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00847213  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1230  tRNA modification GTPase TrmE  35.49 
 
 		 428 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2891  tRNA modification GTPase TrmE  36.64 
 
 		 428 aa  262  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0858  tRNA modification GTPase TrmE  36.89 
 
 		 442 aa  261  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3472  tRNA modification GTPase TrmE  39.11 
 
 		 442 aa  261  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0132  tRNA modification GTPase TrmE  35.81 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.849325  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  38.1 
 
 		 447 aa  259  1e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5133  tRNA modification GTPase TrmE  36.92 
 
 		 456 aa  257  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5023  tRNA modification GTPase TrmE  37.67 
 
 		 447 aa  257  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4013  tRNA modification GTPase TrmE  36.52 
 
 		 456 aa  257  4e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.205295  normal  0.289015 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4263  tRNA modification GTPase TrmE  34.49 
 
 		 454 aa  256  7e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226045  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4148  tRNA modification GTPase TrmE  35.45 
 
 		 454 aa  254  3e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.421634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4904  tRNA modification GTPase TrmE  33.83 
 
 		 478 aa  254  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4245  tRNA modification GTPase TrmE  35.81 
 
 		 454 aa  253  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00411948  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4183  tRNA modification GTPase TrmE  35.81 
 
 		 454 aa  253  3e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000380111  normal  0.0649437 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3038  tRNA modification GTPase TrmE  35.29 
 
 		 448 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.38062  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4158  tRNA modification GTPase TrmE  35.81 
 
 		 454 aa  253  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000196641  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4055  tRNA modification GTPase TrmE  35.22 
 
 		 454 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.765231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4127  tRNA modification GTPase TrmE  35.22 
 
 		 454 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4177  tRNA modification GTPase TrmE  35.22 
 
 		 467 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4234  tRNA modification GTPase TrmE  35.22 
 
 		 467 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4070  tRNA modification GTPase TrmE  35.22 
 
 		 467 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125734  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  32.53 
 
 		 458 aa  250  3e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5611  tRNA modification GTPase TrmE  35.45 
 
 		 456 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4615  tRNA modification GTPase TrmE  34.28 
 
 		 454 aa  250  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3894  tRNA modification GTPase TrmE  35.96 
 
 		 456 aa  250  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002017  GTPase and tRNA-U34 5-formylation enzyme TrmE  35.57 
 
 		 453 aa  250  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0189213  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5742  tRNA modification GTPase TrmE  35.6 
 
 		 456 aa  249  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0027  tRNA modification GTPase TrmE  34.71 
 
 		 454 aa  249  5e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03590  tRNA modification GTPase  33.92 
 
 		 454 aa  249  6e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03534  hypothetical protein  33.92 
 
 		 454 aa  249  6e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3920  tRNA modification GTPase TrmE  33.92 
 
 		 454 aa  249  6e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189642  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3205  tRNA modification GTPase TrmE  35.68 
 
 		 440 aa  249  9e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4292  tRNA modification GTPase TrmE  34.06 
 
 		 454 aa  248  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5136  tRNA modification GTPase TrmE  33.7 
 
 		 454 aa  248  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.041745  normal  0.0619684 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4073  tRNA modification GTPase TrmE  33.7 
 
 		 454 aa  248  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420944  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4260  tRNA modification GTPase TrmE  33.7 
 
 		 454 aa  248  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4288  tRNA modification GTPase TrmE  33.7 
 
 		 454 aa  248  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4219  tRNA modification GTPase TrmE  33.7 
 
 		 454 aa  248  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.99545  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00435  tRNA modification GTPase TrmE  35.22 
 
 		 453 aa  248  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  33.41 
 
 		 456 aa  248  2e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4034  tRNA modification GTPase TrmE  34.35 
 
 		 453 aa  247  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.461545  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4241  tRNA modification GTPase TrmE  34.76 
 
 		 469 aa  247  3e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207719  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04098  tRNA modification GTPase  34.84 
 
 		 462 aa  246  4e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4216  tRNA modification GTPase TrmE  33.7 
 
 		 454 aa  246  6e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.021791  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2515  tRNA modification GTPase TrmE  34.65 
 
 		 464 aa  246  6e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310293  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4310  tRNA modification GTPase TrmE  36.24 
 
 		 460 aa  246  8e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671502  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  34.06 
 
 		 460 aa  245  9e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0005  tRNA modification GTPase TrmE  34.28 
 
 		 456 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273487  hitchhiker  0.00022418 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5443  tRNA modification GTPase TrmE  33.99 
 
 		 456 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03489  tRNA modification GTPase TrmE  34.68 
 
 		 446 aa  245  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  33.91 
 
 		 455 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5308  tRNA modification GTPase TrmE  34.28 
 
 		 456 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.832252  normal  0.0803697 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0001  tRNA modification GTPase TrmE  34.99 
 
 		 453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.201746  hitchhiker  0.00000000323985 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  35.45 
 
 		 458 aa  244  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3931  tRNA modification GTPase TrmE  34.07 
 
 		 437 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4031  tRNA modification GTPase TrmE  34.87 
 
 		 453 aa  244  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.608873  hitchhiker  0.001302 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33876  predicted protein  35.8 
 
 		 489 aa  243  5e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.242987 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  34.79 
 
 		 455 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6368  tRNA modification GTPase TrmE  35.2 
 
 		 455 aa  243  6e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4378  tRNA modification GTPase TrmE  34.14 
 
 		 453 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0292979  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3086  tRNA modification GTPase TrmE  34.06 
 
 		 458 aa  242  9e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.924716  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4324  tRNA modification GTPase TrmE  34.14 
 
 		 453 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0616134  unclonable  0.00000000000430527 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4520  tRNA modification GTPase TrmE  34.14 
 
 		 453 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.30842  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  33.48 
 
 		 475 aa  242  1e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  35.08 
 
 		 455 aa  241  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4062  tRNA modification GTPase TrmE  35.79 
 
 		 453 aa  241  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.112278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>