260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4096 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  100 
 
 		 190 aa  385  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  98.42 
 
 		 190 aa  380  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  98.42 
 
 		 190 aa  380  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  55.22 
 
 		 200 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  41.44 
 
 		 176 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  39.06 
 
 		 181 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  37.3 
 
 		 174 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  35.64 
 
 		 185 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  37.3 
 
 		 174 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  37.3 
 
 		 174 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  39.2 
 
 		 193 aa  89.4  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  37.35 
 
 		 174 aa  85.1  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  34.65 
 
 		 185 aa  84.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  37.1 
 
 		 174 aa  84.3  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  35.39 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  35.39 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  35.39 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  35.64 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  31.52 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  35.15 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  34.65 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  35.45 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  35.12 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1273  fimbrial protein  35.14 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  0.399124 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  35.12 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  35.12 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  30 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  36.11 
 
 		 175 aa  77.4  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  35.26 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  35.26 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  35.26 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  29.47 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  29.47 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  29.47 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  29.47 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1051  fimbrial protein  33.73 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0357059 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5933  fimbrial protein  32.11 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0571  type-1 fimbrial protein  32.95 
 
 		 180 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004539  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0593  putative fimbrial protein  32.63 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.394086  normal  0.0160572 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00480  predicted fimbrial-like adhesin protein  32.37 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  31.31 
 
 		 179 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3083  Fimbrial protein  32.37 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0205144  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  31.31 
 
 		 179 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0597  fimbrial protein internal segment  28.09 
 
 		 164 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0916045 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3092  fimbrial protein  32.37 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.124321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0589  fimbrial protein internal segment  27.53 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0147243 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0590  fimbrial protein internal segment  27.53 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0238251  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0631  type-1 fimbrial protein homolog  32.37 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168996  normal  0.298976 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00485  hypothetical protein  32.37 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  31.31 
 
 		 179 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0604  type-1 fimbrial protein  32.37 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000140279  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0575  type-1 fimbrial protein  32.37 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  31.31 
 
 		 179 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0654  fimbrial protein internal segment  28.09 
 
 		 164 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.781355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0594  putative fimbrial protein  32.42 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0597  putative fimbrial protein  32.42 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.167394 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0601  putative fimbrial protein  32.42 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176424  normal  0.0654863 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0658  putative fimbrial protein  32.42 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  32 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  31.29 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  31.29 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  31.29 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  31.29 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0024  fimbrial subunit  31.29 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  35.15 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  34.55 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  34.55 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  32.47 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  32.47 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  30.72 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  32.47 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  32.53 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0563  Fimbrial protein  31.09 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  30.12 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  32.47 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0150  fimbrial protein  31.47 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  31.66 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  31.47 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  30.12 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1598  frimbrial protein  31.47 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3624  fimbrial protein  31.09 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03009  predicted fimbrial-like adhesin protein  31.09 
 
 		 194 aa  64.3  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0556  fimbrial protein  31.09 
 
 		 194 aa  64.3  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.710135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  31.16 
 
 		 179 aa  64.3  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02960  hypothetical protein  31.09 
 
 		 194 aa  64.3  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04793  P pilus assembly protein  31.38 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3334  putative type 1 fimbrial protein  31.09 
 
 		 194 aa  64.3  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.370999  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4460  putative type 1 fimbrial protein  31.09 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  32.35 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00484  predicted fimbrial-like adhesin protein  29.32 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  28.73 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3079  Fimbrial protein  31.48 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  28.73 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  28.73 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3088  putative fimbrial protein  29.32 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  39.36 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  28.73 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00489  hypothetical protein  29.32 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0609  putative fimbrial protein  29.32 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.87429  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  28.73 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>