99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3955 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  100 
 
 		 642 aa  1323    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  31.02 
 
 		 773 aa  74.3  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  28.27 
 
 		 688 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  28.42 
 
 		 780 aa  67.4  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.51 
 
 		 595 aa  65.5  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  31.46 
 
 		 807 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.38 
 
 		 669 aa  64.7  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  25 
 
 		 728 aa  61.6  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  28.26 
 
 		 762 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.67 
 
 		 573 aa  59.7  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  26.4 
 
 		 564 aa  58.9  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  20.7 
 
 		 685 aa  58.2  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.25 
 
 		 677 aa  57.8  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.25 
 
 		 677 aa  57.8  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.33 
 
 		 793 aa  57.8  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5469  hypothetical protein  27.94 
 
 		 763 aa  57.4  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  29.44 
 
 		 553 aa  56.6  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3887  hypothetical protein  26.23 
 
 		 546 aa  56.6  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  25.32 
 
 		 428 aa  56.6  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  27.17 
 
 		 598 aa  57  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1800  ATP-dependent endonuclease  27.51 
 
 		 782 aa  55.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  25.41 
 
 		 707 aa  55.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  24.72 
 
 		 682 aa  55.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  28.81 
 
 		 596 aa  54.3  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  27.32 
 
 		 594 aa  54.3  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  22.67 
 
 		 659 aa  53.5  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  27.42 
 
 		 564 aa  53.5  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  24.83 
 
 		 674 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0297  ABC transporter, ATP-binding protein  25.89 
 
 		 275 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  27.98 
 
 		 681 aa  52.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  26.4 
 
 		 603 aa  52.4  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  26.13 
 
 		 691 aa  52.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  44.64 
 
 		 457 aa  52.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2116  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  22.54 
 
 		 333 aa  52  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0492101  normal  0.0207459 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.54 
 
 		 589 aa  51.6  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  27.17 
 
 		 596 aa  51.2  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  25.53 
 
 		 663 aa  51.2  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  29.24 
 
 		 650 aa  50.8  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1094  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  22.95 
 
 		 332 aa  50.4  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00802536  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  30.65 
 
 		 695 aa  50.4  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  27.78 
 
 		 595 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.14 
 
 		 626 aa  50.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  24.48 
 
 		 714 aa  49.3  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  28.17 
 
 		 669 aa  49.7  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2720  hypothetical protein  26.77 
 
 		 784 aa  49.3  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  25.13 
 
 		 758 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  41.07 
 
 		 176 aa  49.7  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  25 
 
 		 529 aa  49.7  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1535  RloH  23.21 
 
 		 588 aa  49.7  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000290266  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2392  hypothetical protein  30.93 
 
 		 486 aa  48.5  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0546417  hitchhiker  0.00518189 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0578  hypothetical protein  28.57 
 
 		 660 aa  48.5  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.21 
 
 		 708 aa  48.5  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  24.55 
 
 		 661 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1718  AAA ATPase  44.23 
 
 		 285 aa  48.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000684443  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.15 
 
 		 689 aa  48.5  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.06 
 
 		 548 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  45.83 
 
 		 597 aa  48.1  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  24.89 
 
 		 242 aa  47.8  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0046  GTP-binding protein LepA  28 
 
 		 276 aa  47.8  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0304076  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  43.55 
 
 		 452 aa  47.8  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.56 
 
 		 674 aa  47.8  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  30 
 
 		 623 aa  47.8  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  25.71 
 
 		 613 aa  47.4  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  23.5 
 
 		 628 aa  47  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003897  hypothetical protein  24.55 
 
 		 643 aa  47  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  28.93 
 
 		 579 aa  46.6  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3567  OLD family ATP-dependent endonuclease-like protein  29.27 
 
 		 604 aa  46.6  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  23.15 
 
 		 241 aa  47.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  40.51 
 
 		 461 aa  47  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1439  hypothetical protein  28.02 
 
 		 744 aa  47.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0880018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  25.71 
 
 		 648 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0618  hypothetical protein  26.24 
 
 		 578 aa  46.6  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.508373  normal  0.13002 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1004  ABC transporter related  26.01 
 
 		 271 aa  46.2  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.675227  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  26.76 
 
 		 634 aa  46.6  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0225  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.75 
 
 		 578 aa  46.2  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000140656 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2540  hypothetical protein  28.03 
 
 		 593 aa  45.8  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3120  AAA ATPase  36.54 
 
 		 284 aa  46.2  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000341201  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1639  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  25.91 
 
 		 799 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.84 
 
 		 637 aa  45.8  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  25.68 
 
 		 696 aa  45.4  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  30.77 
 
 		 429 aa  45.8  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3102  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.71 
 
 		 582 aa  45.4  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  35.09 
 
 		 532 aa  44.7  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1387  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.49 
 
 		 550 aa  44.7  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.398618  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4896  hypothetical protein  25.76 
 
 		 264 aa  44.7  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1666  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  25.91 
 
 		 799 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1872  hypothetical protein  27.27 
 
 		 585 aa  44.7  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1057  ABC transporter related  24.51 
 
 		 312 aa  44.7  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0454  AAA ATPase  24.18 
 
 		 606 aa  45.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0597  hypothetical protein  24.32 
 
 		 773 aa  44.7  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0622  bacteriocin-processing peptidase  29.47 
 
 		 722 aa  44.3  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44571  normal  0.575885 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.07 
 
 		 613 aa  44.3  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0196  ATPase  27.27 
 
 		 666 aa  44.3  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0945  ATPase  40 
 
 		 448 aa  44.3  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  25 
 
 		 645 aa  44.3  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0629  AAA ATPase  36.36 
 
 		 446 aa  43.9  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2417  hypothetical protein  25.27 
 
 		 748 aa  43.9  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295746  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  24.52 
 
 		 1152 aa  43.9  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  24.86 
 
 		 298 aa  43.9  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>