More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1004 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1004  ABC transporter related  100 
 
 
271 aa  553  1e-157  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.675227  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0921  ABC transporter-related protein  66.03 
 
 
269 aa  359  3e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.293388  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1157  ABC transporter related  62.79 
 
 
271 aa  336  2.9999999999999997e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0357  ABC transporter related  58.85 
 
 
262 aa  322  6e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211468  normal  0.0882999 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0297  ABC transporter, ATP-binding protein  58.69 
 
 
275 aa  318  7e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_721  ABC-type molybdenum transport system ATPase component  44.96 
 
 
263 aa  238  8e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.743216  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0737  ABC transporter related  43.8 
 
 
263 aa  235  6e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0491193  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0817  ABC transporter, ATP-binding protein  44.27 
 
 
263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1605  ABC transporter, ATPase subunit  45.06 
 
 
261 aa  223  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1451  ABC transporter, ATP-binding protein  39.45 
 
 
267 aa  208  7e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0946  ABC transporter related  38.11 
 
 
272 aa  207  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1526  ABC transporter related protein  39.22 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.212645  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0015  ABC transporter related  40.48 
 
 
336 aa  198  9e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0396331 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11450  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  38.85 
 
 
269 aa  187  2e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.259846  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1016  ATPase  36.86 
 
 
265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.701449  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03594  ABC transporter ATP-binding protein  40.93 
 
 
290 aa  181  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1483  ATPase  37.16 
 
 
262 aa  180  2e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0958108  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15661  ABC transporter ATP-binding protein  36.19 
 
 
263 aa  178  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.478539 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0729  ATPase  38.58 
 
 
262 aa  176  3e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0041  ABC transporter related  41.09 
 
 
283 aa  175  8e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.202842  hitchhiker  0.00435471 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0217  ATPase  31.23 
 
 
270 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.175867  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08491  ABC transporter ATPase  29.64 
 
 
270 aa  156  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.467855  hitchhiker  0.00165058 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09491  ABC transporter ATPase  32.03 
 
 
262 aa  149  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000017292 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1875  ABC transporter related  33.2 
 
 
261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0360852 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08681  ABC transporter ATPase  29.57 
 
 
262 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.334635  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08711  ABC transporter ATPase  29.3 
 
 
262 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13560  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  33.07 
 
 
264 aa  142  4e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.90103 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0816  ATPase  27.63 
 
 
262 aa  142  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.236174  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0860  ABC transporter related  35 
 
 
280 aa  142  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21710  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  33.85 
 
 
272 aa  141  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0916485  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15830  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  34.4 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.196565  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07731  ABC transporter ATPase  28.08 
 
 
268 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2576  ABC transporter related  31.62 
 
 
264 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.486227  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2053  ABC transporter related protein  32.02 
 
 
265 aa  139  6e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3446  ABC transporter related  35.84 
 
 
620 aa  138  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.055391  normal  0.816611 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0941  ABC transporter related  35.39 
 
 
562 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.613771 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2512  ABC transporter related protein  32.66 
 
 
260 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0753  ABC transporter related  35.84 
 
 
636 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1746  ABC transporter related  31.89 
 
 
275 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.586524  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1179  ABC transporter related  31.82 
 
 
265 aa  135  9.999999999999999e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3281  ABC transporter related  31.52 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121617  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2124  ABC transporter related  31.23 
 
 
261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.196157  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1177  ABC transporter related  29.41 
 
 
270 aa  128  8.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421399 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2313  ABC transporter related  30.93 
 
 
276 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28470  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  31.4 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.211213  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1736  ABC transporter related  35.65 
 
 
483 aa  127  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0510749 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1607  ABC transporter ATP-binding protein  30.56 
 
 
260 aa  125  5e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.469845  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2897  ABC transporter related  31.23 
 
 
268 aa  125  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.372349  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0139  ABC transporter, ATP-binding protein  31.09 
 
 
261 aa  123  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0017  ABC transporter related  31.6 
 
 
275 aa  122  7e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.930557  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1427  ABC transporter related protein  31.1 
 
 
271 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11610  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  29.25 
 
 
274 aa  121  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1570  ABC transporter related protein  34.88 
 
 
485 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.536559  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2971  ABC transporter related  31.25 
 
 
500 aa  121  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6066  ABC transporter related  28.63 
 
 
273 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192503  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0653  ABC transporter related protein  29.65 
 
 
494 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2315  ABC transporter related  31.27 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2643  ABC transporter related  33.8 
 
 
489 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.031019 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3500  ABC transporter related  29.92 
 
 
274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.473481  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0229  ABC transporter-like protein  30.47 
 
 
262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1242  ABC transporter related  30.31 
 
 
306 aa  119  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151722  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2812  ABC transporter-related protein  30.23 
 
 
264 aa  118  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.618148  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3468  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 
479 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.206358  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3443  ABC transporter related protein  30.97 
 
 
271 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218097  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4852  ABC transporter related protein  29.5 
 
 
286 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3532  ABC transporter related  32.91 
 
 
479 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0781763  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1154  ABC transporter related  29.92 
 
 
286 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.312325  normal  0.608729 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3088  ABC transporter related  31.25 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000602664  hitchhiker  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5340  ABC transporter related protein  30.16 
 
 
261 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.279807 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4096  ABC transporter related protein  29.07 
 
 
266 aa  116  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.838726  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3604  ABC transporter related  30.74 
 
 
264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221446  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0510  ABC transporter related protein  29.23 
 
 
264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  31.05 
 
 
260 aa  115  7.999999999999999e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2087  ABC transporter-related protein  27.63 
 
 
278 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  31.75 
 
 
254 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2704  ATP-binding component of molybdate transport system  32.43 
 
 
497 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00357864  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3385  ABC transporter, ATPase subunit  32.89 
 
 
478 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.238617  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0639  ABC transporter related protein  30.92 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1749  ABC transporter related  30.9 
 
 
253 aa  113  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1562  ABC transporter related  29.96 
 
 
259 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1532  ABC transporter related  30.35 
 
 
259 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19640  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  33.73 
 
 
264 aa  113  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0874856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1586  ABC transporter related  29.96 
 
 
259 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1055  ATPase  30.4 
 
 
514 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1936  ABC transporter related  34.02 
 
 
287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.681734  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1786  ABC transporter related protein  32.82 
 
 
270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222315  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7034  ABC transporter related  34.98 
 
 
286 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  31.05 
 
 
264 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13057  ATP-binding protein ABC transporter  29.34 
 
 
287 aa  112  9e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.172418 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2191  ABC transporter related  31.56 
 
 
249 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000419302  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0404  ABC transporter related  34.3 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1960  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  26.89 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0561  molybdenum ABC transporter ATPase  28.1 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.278332  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0988  ABC transporter related  32.27 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4272  ABC transporter related  27.24 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  29.18 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  30.08 
 
 
418 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  29.57 
 
 
266 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1201  ABC transporter related  29.13 
 
 
291 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1313  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  29.62 
 
 
260 aa  110  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.292353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>