18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0578 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0578  hypothetical protein  100 
 
 
660 aa  1308    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2611  hypothetical protein  33.24 
 
 
668 aa  263  1e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747487  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  27.41 
 
 
670 aa  74.7  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0674  hypothetical protein  30.72 
 
 
591 aa  68.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787225  normal  0.308405 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0901  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.95 
 
 
672 aa  68.6  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  24.16 
 
 
708 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0571  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.29 
 
 
614 aa  65.1  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4055  hypothetical protein  18.1 
 
 
494 aa  61.2  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.945685  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1796  hypothetical protein  24.77 
 
 
676 aa  60.8  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0143  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.22 
 
 
681 aa  58.5  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128728  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3314  hypothetical protein  28.02 
 
 
654 aa  57  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.949501  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0196  hypothetical protein  27.32 
 
 
654 aa  56.2  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515468  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  28.57 
 
 
642 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1872  hypothetical protein  25 
 
 
585 aa  47  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3405  ATP-binding protein  28.41 
 
 
454 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00177365  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  23.79 
 
 
580 aa  44.3  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3922  hypothetical protein  33.33 
 
 
440 aa  44.3  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0932  hypothetical protein  28.78 
 
 
638 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>