More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2800 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 235 aa  487  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  52.15 
 
 		 215 aa  211  7e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  41.67 
 
 		 190 aa  153  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  41.8 
 
 		 188 aa  152  5.9999999999999996e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  37.84 
 
 		 195 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  41.85 
 
 		 191 aa  145  5e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  39.04 
 
 		 189 aa  145  6e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  37.93 
 
 		 204 aa  138  7e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  39.34 
 
 		 193 aa  132  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2022  isochorismatase hydrolase  35.42 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.85317  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  28.81 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  26.01 
 
 		 241 aa  85.9  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  30.68 
 
 		 213 aa  85.9  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  29.73 
 
 		 189 aa  85.5  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  30.36 
 
 		 196 aa  85.1  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  29.63 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  32.75 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  28.72 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  30.37 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  28.9 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  27.66 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1828  isochorismatase hydrolase  29.56 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0120591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  28.42 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  29.34 
 
 		 189 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  25.46 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  25.46 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  25.46 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  31.18 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  25.46 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  25.46 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  25.46 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  32.3 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  27.69 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  28.32 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  25 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  25 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  30.18 
 
 		 189 aa  78.2  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1846  isochorismatase hydrolase  27.47 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1893  isochorismatase hydrolase  27.47 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  26.17 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1827  isochorismatase hydrolase  27.47 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  25.26 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  26.42 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2142  isochorismatase hydrolase  28.74 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  27.86 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  28.93 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  28.5 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  27.75 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  26.4 
 
 		 389 aa  75.1  0.0000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  28.93 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  31.4 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  27.32 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  31.4 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  28.93 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  29.34 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  28.16 
 
 		 214 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  28.87 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  29.51 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0016  isochorismatase hydrolase  30.25 
 
 		 185 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1793  isochorismatase hydrolase  26.87 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  27.17 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1908  isochorismatase hydrolase  29.24 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.460102 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  34.13 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  28.16 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  27.33 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  27.33 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  28.3 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0028  isochorismatase hydrolase  27.42 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  25.52 
 
 		 213 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  28.9 
 
 		 192 aa  72  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  29.95 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  29.95 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1059  isochorismatase hydrolase  27.4 
 
 		 251 aa  71.6  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0989042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  29.95 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  31.13 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  27.43 
 
 		 187 aa  71.2  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  27.14 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  25.68 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  25 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  29.08 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  28.41 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  32.11 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  28.02 
 
 		 172 aa  70.9  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  27.43 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  28.07 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  28.07 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  28.07 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  27.91 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  30.63 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  25.28 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4359  isochorismatase hydrolase  27.33 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222954  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  25.63 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>