More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2774 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2774  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 205 aa  420  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0349028  normal  0.98242 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2600  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 185 aa  89.4  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2654  regulatory protein TetR  36.11 
 
 		 185 aa  89.4  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  41.49 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  48.57 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  35.58 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2038  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12440  AcrR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1135  putative transcriptional regulator  28.31 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3293  regulatory protein TetR  43.33 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147599  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13072  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.483288 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  35.42 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  35.42 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  35.42 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1692  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 335 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3809  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 188 aa  54.7  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.38 
 
 		 217 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.38 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.38 
 
 		 217 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.38 
 
 		 217 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27910  transcriptional regulator, tetR family  36.71 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.794272 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.84 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.38 
 
 		 217 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5237  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 233 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4309  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1926  transcriptional regulator EefR  32.69 
 
 		 188 aa  52  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0902915  hitchhiker  0.0000000455593 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1837  transcriptional regulator EefR  32.69 
 
 		 188 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000033131 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3406  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 188 aa  52.4  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.122321  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2735  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 242 aa  52.4  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.329672  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 245 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 208 aa  52  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.84 
 
 		 213 aa  52  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6030  transcriptional regulator TetR family  31.53 
 
 		 222 aa  52  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 261 aa  51.6  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 196 aa  51.6  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 196 aa  51.2  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 218 aa  51.2  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  36.11 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.11 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36980  transcriptional regulator  46.27 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34410  transcriptional regulator  33.82 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38267  normal  0.633613 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  36.11 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.11 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.11 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.11 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.11 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.11 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.65 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 241 aa  50.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0803  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 174 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4018  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4802  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.386552  normal  0.120275 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  29.73 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 266 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 307 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5615  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328639  normal  0.169387 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 191 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1442  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 167 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3240  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.84 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.501766  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  35.8 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>