188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1201 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1201  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 183 aa  361  3e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.564024  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1693  tetratricopeptide TPR_2  50.31 
 
 		 203 aa  144  9e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.521297  normal  0.655187 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4676  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.17 
 
 		 220 aa  88.6  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2028  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 205 aa  88.2  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.287446  normal  0.576518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1419  TPR repeat-containing protein  34.33 
 
 		 221 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1399  tetratricopeptide TPR_2  32.09 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0086  TPR repeat-containing protein  34.93 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0782  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.06 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0782775  normal  0.104271 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3988  tetratricopeptide TPR_2  33.78 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1657  hypothetical protein  29.85 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2056  tetratricopeptide TPR_2  34.51 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134429  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3257  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841733  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2421  hypothetical protein  34.87 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.416486  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1025  TPR repeat-containing protein  36.28 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1215  tetratricopeptide TPR_2  30.6 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1561  TPR repeat-containing protein  35.25 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.707304  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_004310  BR1747  TPR domain-containing protein  29.73 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1687  TPR domain-containing protein  29.73 
 
 		 209 aa  71.2  0.000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3312  TPR protein  38.84 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000995394  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1787  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_8734  predicted protein  33.06 
 
 		 124 aa  70.5  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.662786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1084  TPR repeat-containing protein  33.55 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0984  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.815768 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2063  TPR repeat-containing protein  29.58 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0141  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.15 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0138  TPR repeat-containing protein  30.15 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000611488 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1166  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2675  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 203 aa  62  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.679716  normal  0.152424 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  37.04 
 
 		 560 aa  60.8  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0572  tetratricopeptide TPR_2  39.02 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00850831  hitchhiker  0.0000040032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5960  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.2 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0718627  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4966  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.14 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3576  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316735  normal  0.110411 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3277  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 279 aa  58.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4894  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964612 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 1421 aa  56.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  28 
 
 		 820 aa  56.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 301 aa  55.5  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 		 428 aa  55.5  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 446 aa  54.7  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 		 1276 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2742  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5209  TPR repeat-containing protein  34.51 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.221692  normal  0.106965 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2969  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.06 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.742122 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2864  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.37 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0793  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  38.1 
 
 		 739 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 649 aa  52.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.57 
 
 		 292 aa  52  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 		 3560 aa  52  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 284 aa  51.6  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1852  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 		 318 aa  51.6  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.776683 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 1827 aa  51.2  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0130  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 		 203 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 4079 aa  50.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.84 
 
 		 528 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0175  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.5 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.723088 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 219 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0992  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 		 232 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.999896  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0887  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.28 
 
 		 504 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.389457  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 391 aa  49.7  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  31.63 
 
 		 706 aa  49.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0965  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.23 
 
 		 232 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3687  hypothetical protein  29.67 
 
 		 261 aa  48.9  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145402  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.26 
 
 		 522 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.78 
 
 		 471 aa  48.9  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 3035 aa  48.9  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  29.59 
 
 		 706 aa  48.9  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.93 
 
 		 286 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 1276 aa  48.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2994  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 		 317 aa  48.1  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0204  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 212 aa  48.1  0.00007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  36.47 
 
 		 699 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  24.44 
 
 		 1979 aa  47.8  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 162 aa  47.8  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  24.51 
 
 		 462 aa  47.8  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1991  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.66 
 
 		 367 aa  47.8  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.0147414 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 		 515 aa  47.8  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 747 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1288  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 		 329 aa  47  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.130508  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3022  TPR repeat-containing protein  24.03 
 
 		 161 aa  47.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246943 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.15 
 
 		 542 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2141  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 268 aa  47  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.82 
 
 		 541 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 543 aa  45.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.25 
 
 		 343 aa  45.8  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 562 aa  45.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 		 375 aa  46.2  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1829  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 245 aa  45.4  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0594  tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 		 601 aa  45.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2626  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 169 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 		 523 aa  45.4  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0554  caspase-like domain- and TPR repeat-containing peptidase  32.97 
 
 		 518 aa  45.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  32.53 
 
 		 398 aa  45.1  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  26 
 
 		 1192 aa  45.4  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 414 aa  45.1  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 648 aa  45.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 503 aa  45.4  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>