185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1995 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1995  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  100 
 
 		 549 aa  1143    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1407  type II secretory pathway ATPase ExeA  48.16 
 
 		 430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1803  phage tail X family protein  32.31 
 
 		 586 aa  253  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.411442 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  29.52 
 
 		 584 aa  140  8.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  25.81 
 
 		 422 aa  136  9e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  32.97 
 
 		 549 aa  134  6e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0765  type II secretory pathway component ATPase  33.21 
 
 		 323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00521912  normal  0.0426164 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  29.55 
 
 		 563 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3273  MSHA biogenesis protein MshM  33.7 
 
 		 300 aa  128  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1039  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  47.41 
 
 		 680 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.978997 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  26.04 
 
 		 498 aa  125  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  30.96 
 
 		 271 aa  124  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.72 
 
 		 562 aa  123  7e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.7 
 
 		 564 aa  123  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  27.75 
 
 		 554 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.46 
 
 		 577 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.07 
 
 		 557 aa  121  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.39 
 
 		 558 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.67 
 
 		 580 aa  120  7.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.32 
 
 		 562 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.34 
 
 		 587 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.34 
 
 		 562 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.21 
 
 		 613 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.36 
 
 		 562 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  31.05 
 
 		 308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0687  general secretion pathway protein-related protein  29.86 
 
 		 306 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.18 
 
 		 536 aa  118  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0686  general secretion pathway protein-related protein  29.86 
 
 		 306 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.731417  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.82 
 
 		 557 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  28.47 
 
 		 540 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.56 
 
 		 557 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0652  general secretion pathway protein-related protein  29.86 
 
 		 305 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.116587  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  26.56 
 
 		 557 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.56 
 
 		 557 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  27.62 
 
 		 563 aa  115  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  29.29 
 
 		 388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  32.59 
 
 		 303 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.04 
 
 		 559 aa  114  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.52 
 
 		 572 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.2 
 
 		 541 aa  113  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0697  general secretion pathway protein-related protein  29.14 
 
 		 298 aa  113  9e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  29.41 
 
 		 388 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  28.76 
 
 		 459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  32.41 
 
 		 563 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.15 
 
 		 532 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.68 
 
 		 536 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.07 
 
 		 536 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.36 
 
 		 538 aa  111  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0833  ATPase  29.29 
 
 		 387 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  31.25 
 
 		 393 aa  110  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.32 
 
 		 568 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  31.52 
 
 		 302 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0467  MSHA biogenesis protein MshM  30.55 
 
 		 309 aa  109  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  31.33 
 
 		 538 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.47 
 
 		 562 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  30.18 
 
 		 310 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  31.52 
 
 		 302 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3834  MSHA biogenesis protein MshM  31.52 
 
 		 302 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.319406  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  31.52 
 
 		 302 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4111  MSHA biogenesis protein MshM  31.44 
 
 		 310 aa  107  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3662  MSHA biogenesis protein MshM  30.55 
 
 		 309 aa  107  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  31.73 
 
 		 541 aa  107  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.42 
 
 		 589 aa  107  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  32.14 
 
 		 529 aa  107  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  30.85 
 
 		 427 aa  106  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  29.87 
 
 		 364 aa  106  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3750  MSHA biogenesis protein MshM  31.97 
 
 		 314 aa  105  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.995764  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  28.78 
 
 		 334 aa  105  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  29.89 
 
 		 519 aa  105  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  28.88 
 
 		 831 aa  105  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4035  AAA ATPase  29.78 
 
 		 532 aa  104  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267259  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0545  MSHA biogenesis protein MshM  30.77 
 
 		 302 aa  103  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  30.97 
 
 		 302 aa  103  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  30.5 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.72 
 
 		 562 aa  103  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0144  AAA ATPase  26.71 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  27.68 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0894  general secretion pathway protein, ATPase  28.14 
 
 		 275 aa  102  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0075  general secretion pathway protein, ATPase  28.09 
 
 		 447 aa  102  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.897971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3594  putative general secretion pathway protein A  30.74 
 
 		 357 aa  102  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  28.06 
 
 		 395 aa  102  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0754  AAA ATPase  30.63 
 
 		 279 aa  102  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.14 
 
 		 556 aa  101  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  29.29 
 
 		 371 aa  101  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2967  AAA ATPase  28.57 
 
 		 308 aa  101  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0390  MSHA biogenesis protein MshM  30.71 
 
 		 301 aa  100  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5029  putative general secretion pathway protein A  29.76 
 
 		 346 aa  100  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0386  type II secretory pathway ATPase ExeA  28.73 
 
 		 281 aa  99.8  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0184909  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0930  sporulation domain-containing protein  26.03 
 
 		 740 aa  99.8  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0247822 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0550  ATPase, Type II secretory pathway component  26.98 
 
 		 437 aa  99  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03091  putative ATPase and membrane protein  35.43 
 
 		 257 aa  99  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3346  MSHA biogenesis protein MshM  30.11 
 
 		 304 aa  99  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158291  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2821  MSHA biogenesis protein MshM  28.42 
 
 		 281 aa  98.6  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  28.32 
 
 		 385 aa  98.2  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1136  MSHA biogenesis protein MshM  29.81 
 
 		 296 aa  98.6  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1924  hypothetical protein  26.52 
 
 		 414 aa  98.2  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.42704  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4575  MSHA biogenesis protein MshM  26.35 
 
 		 300 aa  97.4  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  30.62 
 
 		 341 aa  97.4  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4416  MSHA biogenesis protein MshM  29.49 
 
 		 302 aa  97.1  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.620402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2016  ATPase  27.8 
 
 		 338 aa  97.1  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>