More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0457 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
206 aa  431  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 
194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0331  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 
209 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3459  putative transcriptional regulator  31.89 
 
 
193 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3522  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 
204 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40790  putative transcriptional regulator  31.89 
 
 
193 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2551  regulatory protein TetR  34.04 
 
 
190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1600  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
213 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1771  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 
204 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0658  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
232 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2387  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
232 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0807  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 
204 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9297  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
198 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2712  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
206 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1100  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 
204 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1176  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 
204 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5376  putative transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 
207 aa  98.2  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3536  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 
208 aa  94  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2310  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 
198 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.145827  normal  0.0377448 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1702  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  23.21 
 
 
201 aa  68.2  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 
194 aa  67  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 
190 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2337  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.784236 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 
228 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 
218 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 
192 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  24.83 
 
 
196 aa  62.8  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  24.19 
 
 
191 aa  63.2  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 
217 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 
190 aa  62  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 
222 aa  61.6  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  25.33 
 
 
217 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  26.81 
 
 
193 aa  60.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
198 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 
286 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
198 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 
217 aa  61.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
197 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 
211 aa  60.1  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 
310 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  24.05 
 
 
206 aa  60.5  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
201 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 
202 aa  60.1  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 
203 aa  60.1  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 
216 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0736  transcriptional regulator  26.57 
 
 
219 aa  59.7  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0112088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 
216 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 
216 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2214  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 
219 aa  59.3  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.411668  normal  0.665917 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  25.33 
 
 
217 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  25.33 
 
 
217 aa  59.3  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 
201 aa  59.3  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 
196 aa  59.3  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  25.33 
 
 
217 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
201 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
196 aa  58.9  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 
227 aa  58.5  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
201 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 
190 aa  58.5  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  24.67 
 
 
217 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
190 aa  58.2  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1179  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 
290 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  32.76 
 
 
198 aa  58.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 
217 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 
193 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 
189 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
191 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 
217 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
190 aa  57.4  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3254  transcriptional regulator, TetR family  21.82 
 
 
195 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 
204 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  21.94 
 
 
188 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  45.71 
 
 
194 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 
198 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
206 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1439  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.187037  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 
248 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  28.4 
 
 
224 aa  57  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 
222 aa  56.6  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 
216 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  21.94 
 
 
188 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
195 aa  56.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
193 aa  56.2  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  21.76 
 
 
188 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  21.76 
 
 
188 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  21.76 
 
 
188 aa  56.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 
208 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  21.76 
 
 
188 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  21.94 
 
 
188 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  26 
 
 
220 aa  56.6  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  21.76 
 
 
188 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 
201 aa  56.2  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
190 aa  56.6  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3621  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  21.61 
 
 
192 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  21.94 
 
 
188 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>