271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4773 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  631  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  75.59 
 
 		 303 aa  489  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  55.48 
 
 		 322 aa  348  6e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  51.51 
 
 		 298 aa  332  4e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04945  hypothetical protein  49.01 
 
 		 309 aa  321  9.000000000000001e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1349  hypothetical protein  47.99 
 
 		 308 aa  303  2.0000000000000002e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  45.57 
 
 		 310 aa  290  3e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  37.28 
 
 		 303 aa  199  6e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  34.33 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  34.35 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  36.11 
 
 		 299 aa  181  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  34.45 
 
 		 302 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  35.12 
 
 		 302 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  35.12 
 
 		 302 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  32.21 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  31.89 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  30.46 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  29.63 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  31.28 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  29.45 
 
 		 291 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  32.11 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  25.9 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  29.28 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  26.07 
 
 		 293 aa  102  7e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  26.58 
 
 		 290 aa  102  7e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1737  protein of unknown function DUF58  28.1 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  30.95 
 
 		 295 aa  99  9e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3819  hypothetical protein  25.41 
 
 		 296 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1889  hypothetical protein  25.25 
 
 		 302 aa  95.5  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.231187  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  23.96 
 
 		 298 aa  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1089  hypothetical protein  28.11 
 
 		 284 aa  90.1  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  25.08 
 
 		 340 aa  89.7  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  24.16 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  21.93 
 
 		 291 aa  87.4  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  27.38 
 
 		 287 aa  87  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  23.39 
 
 		 294 aa  86.3  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  30.57 
 
 		 295 aa  85.5  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  27.76 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1718  hypothetical protein  25.44 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1974  hypothetical protein  26.16 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  27.59 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  26.83 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  27.31 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  27.54 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  29.06 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  27.83 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  27.2 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  26.47 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  24.63 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  25.57 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  25.93 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  25 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  26.94 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3262  von Willebrand factor type A  27.03 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  22.3 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  28.65 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  25.18 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  27.67 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2702  hypothetical protein  24.47 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  26.41 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  29 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  24.75 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  26.01 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  28.51 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  27.91 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  23.71 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  27.93 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0298  hypothetical protein  23.55 
 
 		 306 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  29.23 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  25.67 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  23.68 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  28.72 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  25 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  27.73 
 
 		 469 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  25.94 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2180  hypothetical protein  24.59 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.468845  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  24.58 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  24.25 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  28.65 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  26.74 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  25.88 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  22.9 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  22.53 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  25 
 
 		 443 aa  67  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  23.86 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1008  hypothetical protein  26.62 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.842733  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  23.64 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  28.19 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  23.89 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  21.33 
 
 		 428 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  23.35 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  23.47 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2270  hypothetical protein  25.56 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  26.92 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0485  hypothetical protein  22 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1136  hypothetical protein  26.47 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231211  hitchhiker  0.0000385837 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2276  hypothetical protein  25.41 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227684  normal  0.998635 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3231  hypothetical protein  25.31 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2627  hypothetical protein  22.61 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3057  hypothetical protein  25.1 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.023452 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>