More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3162 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  82.75 
 
 		 458 aa  801    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 455 aa  953    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  58.81 
 
 		 462 aa  538  9.999999999999999e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  44.62 
 
 		 451 aa  392  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  36.06 
 
 		 434 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  35.46 
 
 		 435 aa  271  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  33.25 
 
 		 448 aa  214  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  32.52 
 
 		 448 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  31.02 
 
 		 434 aa  204  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  32.65 
 
 		 440 aa  200  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  31 
 
 		 436 aa  195  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  31.26 
 
 		 435 aa  192  9e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 		 457 aa  192  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  30.67 
 
 		 451 aa  189  9e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  27.37 
 
 		 436 aa  185  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  29.42 
 
 		 421 aa  182  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  29.4 
 
 		 476 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  31.62 
 
 		 445 aa  178  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  29.35 
 
 		 428 aa  176  8e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  30.37 
 
 		 437 aa  173  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  28.02 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  27.96 
 
 		 439 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  27.51 
 
 		 427 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 447 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  28.27 
 
 		 471 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  27.07 
 
 		 424 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  29.81 
 
 		 483 aa  157  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  27.54 
 
 		 450 aa  157  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  27.19 
 
 		 449 aa  155  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  26.02 
 
 		 462 aa  154  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  30.46 
 
 		 480 aa  152  8.999999999999999e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  26.44 
 
 		 501 aa  152  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  32.26 
 
 		 485 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  27.52 
 
 		 477 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  27.1 
 
 		 478 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  29.85 
 
 		 462 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  25.22 
 
 		 458 aa  144  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  27.31 
 
 		 460 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  26.55 
 
 		 421 aa  143  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  31.02 
 
 		 459 aa  142  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  25.71 
 
 		 423 aa  141  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  27.8 
 
 		 464 aa  140  6e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  26.01 
 
 		 451 aa  137  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  25.68 
 
 		 469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  33.12 
 
 		 481 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  26.11 
 
 		 441 aa  133  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  31.82 
 
 		 490 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  26.51 
 
 		 447 aa  130  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  26.94 
 
 		 446 aa  130  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  32.42 
 
 		 499 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  24.57 
 
 		 435 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  31 
 
 		 484 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  24.03 
 
 		 452 aa  122  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  25.21 
 
 		 444 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  30.67 
 
 		 473 aa  120  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  30.1 
 
 		 483 aa  116  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  25.64 
 
 		 403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2203  oxidoreductase domain protein  24.18 
 
 		 452 aa  112  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  30.41 
 
 		 476 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2227  oxidoreductase domain protein  24.24 
 
 		 451 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103386  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  24.78 
 
 		 406 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  23.93 
 
 		 468 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  23.81 
 
 		 432 aa  108  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1399  oxidoreductase domain protein  29.76 
 
 		 487 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313156  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2196  oxidoreductase domain-containing protein  29.97 
 
 		 444 aa  99.4  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  25.68 
 
 		 356 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  29.15 
 
 		 463 aa  97.8  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  23.46 
 
 		 444 aa  97.1  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  29.76 
 
 		 353 aa  94  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3462  oxidoreductase domain-containing protein  27.4 
 
 		 459 aa  94  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  25.53 
 
 		 358 aa  93.6  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  24.52 
 
 		 364 aa  92  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  26.55 
 
 		 347 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.65 
 
 		 349 aa  89  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.13 
 
 		 350 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  26.24 
 
 		 349 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  28.69 
 
 		 355 aa  87.8  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  24.83 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  29.13 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  26.59 
 
 		 359 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  24.82 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  36.6 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  24.91 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  26.44 
 
 		 368 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 359 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3765  oxidoreductase domain protein  24.59 
 
 		 518 aa  80.9  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36959  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.75 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  24.04 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1850  inositol 2-dehydrogenase  29.09 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  23.78 
 
 		 366 aa  79.3  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  26.67 
 
 		 342 aa  78.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  29.03 
 
 		 456 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  23.99 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2364  oxidoreductase domain protein  29.86 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  25 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  30.86 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  27.8 
 
 		 459 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.35 
 
 		 459 aa  77  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  27.6 
 
 		 459 aa  77  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1749  oxidoreductase domain-containing protein  28.96 
 
 		 467 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.143051  normal  0.0151703 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>