89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2027 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2027  hypothetical protein  100 
 
 		 693 aa  1417    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0487  hypothetical protein  29.16 
 
 		 425 aa  123  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.681739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4258  hypothetical protein  26.56 
 
 		 518 aa  99.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.24252  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0503  hypothetical protein  27.64 
 
 		 467 aa  99  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4993  hypothetical protein  27.55 
 
 		 425 aa  97.8  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000545579 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  30.65 
 
 		 1437 aa  96.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  31.02 
 
 		 1215 aa  92.4  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2655  Spore coat protein CotH  31.58 
 
 		 1174 aa  88.6  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  30.73 
 
 		 665 aa  88.6  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4118  hypothetical protein  29.89 
 
 		 755 aa  87.4  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0537  hypothetical protein  31.09 
 
 		 1029 aa  87.4  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4867  hypothetical protein  30 
 
 		 657 aa  87  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.863369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  28.08 
 
 		 491 aa  86.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  29.51 
 
 		 1668 aa  86.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  36.67 
 
 		 2588 aa  86.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2120  hypothetical protein  30.84 
 
 		 362 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  29.49 
 
 		 1147 aa  86.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1747  hypothetical protein  29.83 
 
 		 495 aa  84.3  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3748  hypothetical protein  28.33 
 
 		 371 aa  84.3  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.012971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  31.18 
 
 		 543 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  31.71 
 
 		 933 aa  82  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.43 
 
 		 570 aa  80.5  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29 
 
 		 1783 aa  80.5  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.281324  normal  0.533675 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  33.07 
 
 		 2487 aa  79.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5291  hypothetical protein  29.32 
 
 		 736 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.775862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  28.49 
 
 		 1003 aa  79.7  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2179  hypothetical protein  30.46 
 
 		 541 aa  77  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1942  hypothetical protein  29.8 
 
 		 501 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3347  hypothetical protein  30.81 
 
 		 477 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.702063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  30.4 
 
 		 3191 aa  76.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5663  hypothetical protein  28.88 
 
 		 324 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  26.88 
 
 		 757 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5728  Ig family protein  27.57 
 
 		 646 aa  75.5  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.972475  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0617  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.07 
 
 		 1773 aa  75.5  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  28.43 
 
 		 803 aa  74.7  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0455  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  39.66 
 
 		 171 aa  74.3  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.013285 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  25.87 
 
 		 1433 aa  74.3  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0546  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  23.58 
 
 		 458 aa  74.3  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38 
 
 		 900 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2409  hypothetical protein  25.38 
 
 		 336 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00135262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  29.65 
 
 		 558 aa  72.4  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5604  hypothetical protein  28.19 
 
 		 1294 aa  71.2  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1757  hypothetical protein  27.93 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  23.66 
 
 		 1055 aa  70.5  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  33.5 
 
 		 996 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.49 
 
 		 1015 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00134837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4535  hypothetical protein  27.91 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3308  hypothetical protein  28.34 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  34.92 
 
 		 1575 aa  66.6  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2139  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  24.36 
 
 		 688 aa  66.2  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.534536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2528  hypothetical protein  30.19 
 
 		 221 aa  65.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00180911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4322  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.11 
 
 		 1797 aa  65.1  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000460936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  30.22 
 
 		 571 aa  64.3  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  29.79 
 
 		 1296 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0770  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  33.33 
 
 		 231 aa  63.5  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2437  hypothetical protein  25.11 
 
 		 846 aa  62  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3327  hypothetical protein  26.98 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.802157  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  30 
 
 		 686 aa  61.6  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3021  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  34.96 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2794  hypothetical protein  28.87 
 
 		 725 aa  60.8  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.423654 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  27.03 
 
 		 634 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2483  hypothetical protein  22.47 
 
 		 637 aa  60.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000855708  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0384  hypothetical protein  25.14 
 
 		 700 aa  58.5  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171472  normal  0.22141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2349  hypothetical protein  25.98 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0736668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2183  hypothetical protein  25.27 
 
 		 571 aa  58.5  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  31.03 
 
 		 701 aa  58.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12818  hypothetical protein  37.5 
 
 		 192 aa  55.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.562782  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  26.56 
 
 		 601 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0572  hypothetical protein  25.52 
 
 		 347 aa  55.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1579  hypothetical protein  27.46 
 
 		 394 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.039353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  25.54 
 
 		 1263 aa  52  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24760  conserved repeat protein  27.15 
 
 		 1516 aa  51.6  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.216781 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  32.89 
 
 		 461 aa  50.1  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6006  hypothetical protein  25.41 
 
 		 366 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3849  Parallel beta-helix repeat protein  29.33 
 
 		 526 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  35.53 
 
 		 1348 aa  48.9  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1906  lipoprotein  24.31 
 
 		 647 aa  48.5  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  25.45 
 
 		 874 aa  48.5  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0295  Laminin G sub domain 2  24.55 
 
 		 545 aa  47.8  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.252604  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  31.71 
 
 		 1236 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6753  hypothetical protein  25 
 
 		 876 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.21551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5606  hypothetical protein  28.87 
 
 		 408 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4401  lipolytic protein G-D-S-L family  28.71 
 
 		 728 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1598  hypothetical protein  38.28 
 
 		 675 aa  46.6  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000695683  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4214  hypothetical protein  28.23 
 
 		 376 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2067  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.45 
 
 		 687 aa  45.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  29.13 
 
 		 398 aa  44.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  32.88 
 
 		 1337 aa  45.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6114  hypothetical protein  32 
 
 		 367 aa  44.3  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513941  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>