89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0535 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  100 
 
 		 1003 aa  2028    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5728  Ig family protein  45.62 
 
 		 646 aa  176  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.972475  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0537  hypothetical protein  42.86 
 
 		 1029 aa  156  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1757  hypothetical protein  43.72 
 
 		 341 aa  144  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  34.89 
 
 		 1668 aa  139  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  42.39 
 
 		 1147 aa  138  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1747  hypothetical protein  43.78 
 
 		 495 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0384  hypothetical protein  41.99 
 
 		 700 aa  128  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171472  normal  0.22141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4535  hypothetical protein  36.44 
 
 		 333 aa  125  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1942  hypothetical protein  39.55 
 
 		 501 aa  124  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  40.61 
 
 		 1296 aa  124  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4118  hypothetical protein  34.46 
 
 		 755 aa  123  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4867  hypothetical protein  39.13 
 
 		 657 aa  122  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.863369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  37.62 
 
 		 757 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2409  hypothetical protein  37.29 
 
 		 336 aa  119  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00135262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  34.86 
 
 		 1437 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  38.42 
 
 		 491 aa  115  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5663  hypothetical protein  38.15 
 
 		 324 aa  115  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5291  hypothetical protein  35.03 
 
 		 736 aa  115  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.775862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3748  hypothetical protein  36.16 
 
 		 371 aa  113  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.012971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3308  hypothetical protein  33.7 
 
 		 340 aa  112  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2120  hypothetical protein  36.31 
 
 		 362 aa  111  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  37.65 
 
 		 1433 aa  108  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1579  hypothetical protein  36.36 
 
 		 394 aa  106  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.039353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1237  hypothetical protein  29.55 
 
 		 719 aa  105  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5606  hypothetical protein  35.14 
 
 		 408 aa  103  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0249  hypothetical protein  32.42 
 
 		 621 aa  103  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.216419  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06004  hypothetical protein  32.51 
 
 		 702 aa  102  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3347  hypothetical protein  31.79 
 
 		 477 aa  101  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.702063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  37.43 
 
 		 543 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2179  hypothetical protein  35 
 
 		 541 aa  100  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  35.8 
 
 		 1055 aa  99  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2183  hypothetical protein  35.98 
 
 		 571 aa  99  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2655  Spore coat protein CotH  30.09 
 
 		 1174 aa  98.2  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.54 
 
 		 1015 aa  97.8  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00134837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  33.68 
 
 		 900 aa  97.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000485  hypothetical protein  30.92 
 
 		 667 aa  95.9  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.889431  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  34.76 
 
 		 665 aa  94  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0617  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.71 
 
 		 1773 aa  93.2  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0313  hypothetical protein  32.38 
 
 		 703 aa  93.6  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2437  hypothetical protein  32.79 
 
 		 846 aa  92.8  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3363  hypothetical protein  28.46 
 
 		 702 aa  90.9  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  30.51 
 
 		 803 aa  90.9  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1509  hypothetical protein  29.54 
 
 		 714 aa  89.7  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.748736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  34.87 
 
 		 1215 aa  88.6  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  32.63 
 
 		 933 aa  88.6  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1368  hypothetical protein  32.21 
 
 		 713 aa  88.2  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1919  hypothetical protein  49.43 
 
 		 308 aa  86.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.96 
 
 		 570 aa  84  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2139  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  29.05 
 
 		 688 aa  84  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.534536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  35.48 
 
 		 601 aa  83.2  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  33.93 
 
 		 1575 aa  83.2  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  28.04 
 
 		 686 aa  82.4  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5604  hypothetical protein  32.95 
 
 		 1294 aa  82.4  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  30.81 
 
 		 558 aa  81.3  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  28.14 
 
 		 634 aa  80.9  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  29.41 
 
 		 996 aa  80.1  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4322  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.16 
 
 		 1797 aa  79.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000460936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4214  hypothetical protein  30.94 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6006  hypothetical protein  28.89 
 
 		 366 aa  76.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2067  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  34.86 
 
 		 687 aa  75.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.17 
 
 		 1783 aa  75.5  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.281324  normal  0.533675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  30.18 
 
 		 1263 aa  74.3  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2528  hypothetical protein  29.63 
 
 		 221 aa  74.3  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00180911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  29.65 
 
 		 571 aa  73.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1906  lipoprotein  33.33 
 
 		 647 aa  72  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2027  hypothetical protein  27.53 
 
 		 693 aa  69.7  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  29.43 
 
 		 1441 aa  68.9  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2349  hypothetical protein  29.17 
 
 		 230 aa  67.4  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0736668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6627  hypothetical protein  29.12 
 
 		 523 aa  67.4  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.665855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4401  lipolytic protein G-D-S-L family  25.65 
 
 		 728 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6114  hypothetical protein  37.3 
 
 		 367 aa  64.3  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3327  hypothetical protein  29.41 
 
 		 428 aa  63.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.802157  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0572  hypothetical protein  31.45 
 
 		 347 aa  62.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6092  hypothetical protein  29.95 
 
 		 254 aa  62.4  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  31.11 
 
 		 1898 aa  62  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6992  hypothetical protein  25.54 
 
 		 1087 aa  61.2  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160611  normal  0.0433397 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  26.98 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0048  hypothetical protein  27.9 
 
 		 1946 aa  58.9  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1669  hypothetical protein  28.5 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.435445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6753  hypothetical protein  27.37 
 
 		 876 aa  55.8  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.21551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  27.08 
 
 		 701 aa  53.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26340  hypothetical protein  39.84 
 
 		 654 aa  53.5  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2794  hypothetical protein  26.56 
 
 		 725 aa  51.6  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.423654 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  26.06 
 
 		 1318 aa  51.2  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  33.66 
 
 		 9867 aa  51.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  30.12 
 
 		 461 aa  47.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01825  hypothetical protein  32.88 
 
 		 654 aa  46.6  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5097  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  27.17 
 
 		 727 aa  45.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>