97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_4031 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_4031  HipA N-terminal domain protein  100 
 
 
222 aa  453  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  67.8 
 
 
439 aa  178  4.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  63.25 
 
 
438 aa  169  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  64.1 
 
 
435 aa  168  5e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  64.1 
 
 
439 aa  167  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  46.31 
 
 
439 aa  132  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0568  hypothetical protein  53.7 
 
 
116 aa  125  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116615  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  50 
 
 
440 aa  125  8.000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  49.14 
 
 
441 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  49.06 
 
 
440 aa  119  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  49.06 
 
 
440 aa  119  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  49.06 
 
 
440 aa  119  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  49.06 
 
 
440 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  49.06 
 
 
440 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  49.06 
 
 
434 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  50.44 
 
 
441 aa  114  8.999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1366  hypothetical protein  48.7 
 
 
444 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1623  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  46.55 
 
 
446 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00823603  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  42.74 
 
 
442 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4225  HipA domain-containing protein  46.22 
 
 
444 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  44.44 
 
 
444 aa  102  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4275  HipA domain-containing protein  45.69 
 
 
444 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3807  HipA domain-containing protein  45.69 
 
 
444 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5959  HipA domain-containing protein  44.83 
 
 
446 aa  101  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428756  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  45.95 
 
 
440 aa  101  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  46.73 
 
 
435 aa  101  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  41.38 
 
 
433 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6086  HipA N-terminal domain protein  42.61 
 
 
446 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  41.74 
 
 
450 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  43.22 
 
 
437 aa  97.8  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4396  HipA domain-containing protein  43.1 
 
 
446 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3971  HipA-like  43.1 
 
 
446 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  45.05 
 
 
435 aa  96.7  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  45.05 
 
 
435 aa  96.7  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  43.86 
 
 
435 aa  96.3  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0635  hipA protein  45.22 
 
 
622 aa  95.5  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0680  putative regulatory protein HipA  45.22 
 
 
450 aa  95.5  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2152  putative regulatory protein HipA  45.22 
 
 
450 aa  95.5  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2237  putative regulatory protein HipA  45.22 
 
 
450 aa  95.5  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2002  hipA protein  45.22 
 
 
450 aa  95.5  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1593  hipA protein  45.22 
 
 
450 aa  95.5  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4225  hypothetical protein  43.86 
 
 
443 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.43643 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1506  putative HipA-like protein  40.52 
 
 
449 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265752  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5635  HipA domain-containing protein  41.38 
 
 
447 aa  92.8  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.525846  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  46.85 
 
 
440 aa  92.4  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  39.83 
 
 
440 aa  89.7  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  39.32 
 
 
445 aa  87  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4901  HipA N-terminal domain protein  37.93 
 
 
446 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.069886  normal  0.125288 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2121  protein HipA  41 
 
 
351 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.218209 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  38.18 
 
 
446 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1765  protein HipA  40 
 
 
176 aa  81.3  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  35.96 
 
 
426 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5917  HipA N-terminal domain protein  35.78 
 
 
445 aa  78.6  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  36.45 
 
 
422 aa  73.2  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  37.04 
 
 
450 aa  71.6  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5532  HipA domain-containing protein  59.65 
 
 
380 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0132432 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  39.09 
 
 
461 aa  68.6  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0366  HipA-like protein  57.41 
 
 
59 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0379  HipA-like protein  57.41 
 
 
59 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  35.2 
 
 
449 aa  65.9  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  37.84 
 
 
427 aa  64.3  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  30.13 
 
 
480 aa  63.2  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  34.55 
 
 
422 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  35.29 
 
 
430 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  32.35 
 
 
435 aa  57.8  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  32.14 
 
 
451 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0152  HipA N-terminal domain protein  32.69 
 
 
109 aa  56.6  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  34.02 
 
 
435 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1775  HipA N-terminal domain protein  28.69 
 
 
404 aa  53.9  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.474256  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0858  hypothetical protein  27.93 
 
 
111 aa  52.8  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000215175 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03630  HipA domain-containing protein  28.85 
 
 
427 aa  52.8  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  27.43 
 
 
416 aa  52.4  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  35.51 
 
 
418 aa  51.2  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  27.17 
 
 
425 aa  48.9  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  34.45 
 
 
413 aa  49.3  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0495  hypothetical protein  28 
 
 
109 aa  48.9  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  36.61 
 
 
413 aa  48.5  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0248  hypothetical protein  31.25 
 
 
107 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  34.69 
 
 
382 aa  48.1  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2291  hypothetical protein  30.21 
 
 
102 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0211  HipA N-terminal domain protein  31.25 
 
 
107 aa  47  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  31.9 
 
 
408 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4614  HipA protein  52.94 
 
 
47 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224245  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  31.15 
 
 
430 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0687  HipA-like protein  33.05 
 
 
413 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  33.93 
 
 
430 aa  46.2  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  32.14 
 
 
418 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  29.82 
 
 
434 aa  45.4  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  29.82 
 
 
434 aa  45.1  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  29.25 
 
 
433 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2873  HipA N-terminal domain protein  34.23 
 
 
396 aa  44.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  31.07 
 
 
434 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  31.07 
 
 
434 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27630  HipA domain-containing protein  27.68 
 
 
411 aa  43.5  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180686  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  32.69 
 
 
454 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  29.36 
 
 
460 aa  42.4  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2167  HipA N-terminal domain protein  27.08 
 
 
107 aa  41.6  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0107029  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>