183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1206 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1206  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 309 aa  627  1e-178  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2840  transcriptional regulator, GntR family  73.91 
 
 		 298 aa  460  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1381  transcriptional regulator, GntR family  54.52 
 
 		 297 aa  317  2e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0364  GntR domain-containing protein  36.06 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.225657  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05438  transcription regulator protein  34.58 
 
 		 311 aa  159  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.185679  normal  0.066253 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3072  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 290 aa  140  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3872  GntR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.600353  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_003296  RS00705  putative transcription regulator protein  30.82 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0312291  normal  0.40859 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1000  transcriptional regulator, GntR family  31.18 
 
 		 313 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.801369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6879  GntR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0423677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4554  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.189938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6189  transcriptional regulator, GntR family  33.57 
 
 		 298 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.35302  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04697  putative transcription regulator protein  30.99 
 
 		 298 aa  119  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.650808  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4258  GntR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1033  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 341 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000187092  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5826  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000644703 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5539  regulatory protein GntR HTH  27.23 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0453  GntR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  28.44 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  25.27 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2360  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 247 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68775 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1281  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1603  GntR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 338 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1607  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170501  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  28.64 
 
 		 227 aa  54.7  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0285  GntR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 300 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  30.26 
 
 		 255 aa  53.5  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0261  GntR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 300 aa  52.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 238 aa  52.8  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  26.42 
 
 		 233 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  22.63 
 
 		 215 aa  52  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1402  GntR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 341 aa  52.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0037  GntR domain protein  28.92 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  21.62 
 
 		 252 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 217 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5871  transcriptional regulator GntR family  24.02 
 
 		 332 aa  50.8  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5798  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 234 aa  50.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  27.23 
 
 		 239 aa  50.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4672  GntR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 343 aa  50.1  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.626925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  25.79 
 
 		 228 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 393 aa  49.7  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  28.08 
 
 		 223 aa  49.7  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 223 aa  49.7  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5017  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 231 aa  49.3  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.488746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  27.62 
 
 		 242 aa  49.3  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3756  GntR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 243 aa  49.3  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  26.32 
 
 		 228 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0031  GntR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 230 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  26.8 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5236  transcriptional regulator, GntR family  21.62 
 
 		 252 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3649  GntR family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 216 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0460435 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3029  GntR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 233 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0530  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710712  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  27.42 
 
 		 227 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2569  GntR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1229  GntR domain-containing protein  28.72 
 
 		 249 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0882  GntR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 235 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20136  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1099  GntR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.322979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 253 aa  48.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0185  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 222 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.27943  normal  0.15963 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  29.38 
 
 		 235 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2161  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 237 aa  47.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.131694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 217 aa  47.8  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 227 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4461  GntR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 230 aa  47.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2731  GntR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 261 aa  47.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000186795  normal  0.0139063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7701  transcriptional regulator, GntR family  31.63 
 
 		 212 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788387  normal  0.631599 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 214 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2675  transcriptional regulator GntR  25 
 
 		 245 aa  47  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 237 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5768  GntR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 221 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 265 aa  47  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  28.65 
 
 		 293 aa  47  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  28.5 
 
 		 264 aa  46.6  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  31.86 
 
 		 222 aa  46.6  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2539  transcriptional regulator  25.93 
 
 		 229 aa  46.2  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.824223  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1255  GntR domain-containing protein  28.19 
 
 		 234 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3939  regulatory protein, GntR  27.27 
 
 		 359 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1888  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 257 aa  45.8  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 255 aa  45.8  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1746  transcriptional regulator, GntR family  25.84 
 
 		 257 aa  45.8  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4205  transcriptional regulator, GntR family  27.81 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5785  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 231 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.827146  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1653  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 238 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 241 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2728  transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.246809  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4143  GntR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 230 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 226 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  44.68 
 
 		 227 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3189  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 268 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4111  regulatory protein GntR HTH  27.32 
 
 		 231 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2036  transcriptional regulator, GntR family  33.77 
 
 		 213 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00223971  normal  0.0618137 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7368  GntR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 250 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6551  transcriptional regulator, GntR family  28.06 
 
 		 250 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0264715  normal  0.779527 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1419  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 231 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.17694 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0735  transcriptional regulator, GntR family  28.12 
 
 		 228 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000113476  decreased coverage  0.0012324 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  25.74 
 
 		 233 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>