More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2751 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2751  RND efflux system outer membrane lipoprotein  100 
 
 
480 aa  951    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124285  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5328  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin ZneC  42.59 
 
 
511 aa  351  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.998587  normal  0.685908 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4987  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  43.19 
 
 
505 aa  320  5e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00867259 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5321  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin ZniC  43.18 
 
 
518 aa  317  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.944742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2531  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  42.98 
 
 
484 aa  316  7e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.396658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1670  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  42.95 
 
 
505 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.714759  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2946  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  42.95 
 
 
505 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02376  putative outer membrane channel lipoprotein transmembrane  42.55 
 
 
485 aa  306  8.000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664691  normal  0.0665572 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  44.83 
 
 
502 aa  290  4e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3688  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.54 
 
 
511 aa  288  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.595948  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1990  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.49 
 
 
513 aa  285  2.0000000000000002e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3299  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.63 
 
 
509 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5958  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  40.79 
 
 
506 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3468  putative outer membrane lipoprotein (NodT-like), RND efflux system  39.74 
 
 
523 aa  280  5e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0852484  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0526  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.52 
 
 
510 aa  277  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7713  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.76 
 
 
532 aa  274  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00707  cation efflux system protein  42.41 
 
 
482 aa  272  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.135104  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1544  putative outer membrane lipoprotein (NodT-like), RND efflux system  38.64 
 
 
543 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280658  normal  0.243033 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2409  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.6 
 
 
483 aa  269  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0688  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.71 
 
 
505 aa  267  4e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.13024 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1356  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  41.45 
 
 
501 aa  259  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1058  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.34 
 
 
511 aa  258  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.712242  normal  0.943186 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0092  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.5 
 
 
557 aa  255  9e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.602772  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0347  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  38.19 
 
 
488 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0447  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.2 
 
 
494 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0433676  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1297  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.08 
 
 
523 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0766  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.91 
 
 
480 aa  251  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000618276  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2910  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.82 
 
 
522 aa  252  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2297  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.46 
 
 
634 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0952  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.25 
 
 
634 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2164  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  38.25 
 
 
634 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2739  putative outer membrane efflux protein  35.23 
 
 
520 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1244  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.01 
 
 
478 aa  240  4e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0055  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.21 
 
 
579 aa  240  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2105  Outer membrane protein  38.38 
 
 
574 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275801  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1438  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.22 
 
 
514 aa  239  5.999999999999999e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0115018  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3370  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.85 
 
 
551 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0755058  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2623  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  38.51 
 
 
494 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0166  outer membrane channel lipoprotein  37.95 
 
 
480 aa  234  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00297145  normal  0.496674 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0058  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.53 
 
 
579 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1031  ABC-type export system, outer membrane channel protein  38.3 
 
 
494 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5889  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.34 
 
 
496 aa  230  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781684  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2766  outer membrane lipoprotein  38.72 
 
 
494 aa  229  7e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.219926  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4555  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.23 
 
 
491 aa  229  8e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.163677  normal  0.0686042 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4422  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.23 
 
 
491 aa  229  8e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.800929  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2287  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.15 
 
 
535 aa  226  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469139  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1722  ABC efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.32 
 
 
421 aa  226  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248885  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6338  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.34 
 
 
522 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1741  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.34 
 
 
522 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1662  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.93 
 
 
532 aa  223  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49733  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1754  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.34 
 
 
522 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4326  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.54 
 
 
484 aa  223  8e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5589  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.51 
 
 
498 aa  222  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0406  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.05 
 
 
500 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5037  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.59 
 
 
521 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.622101 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2874  putative outer membrane protein  35.71 
 
 
504 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.130089  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1662  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.19 
 
 
536 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.569362  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1518  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.23 
 
 
515 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.25718 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1502  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.63 
 
 
503 aa  217  4e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.707138  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3847  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.04 
 
 
495 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1915  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.04 
 
 
495 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3830  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.04 
 
 
495 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1255  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.63 
 
 
495 aa  214  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0685984  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7008  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.56 
 
 
493 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130004  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1320  ABC-type export system, outer membrane channel protein  38.69 
 
 
779 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2681  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.35 
 
 
491 aa  210  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1747  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.47 
 
 
496 aa  209  7e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319328  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1225  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.99 
 
 
487 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.422386  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1231  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.06 
 
 
486 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0812696  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1966  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.73 
 
 
498 aa  200  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.391464  decreased coverage  0.00633944 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2294  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.7 
 
 
511 aa  199  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.703327  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2485  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.16 
 
 
487 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.072827  normal  0.13209 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.21 
 
 
496 aa  196  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130053  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0649  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.21 
 
 
496 aa  196  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.814679  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3537  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.79 
 
 
487 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.944145  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1267  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.21 
 
 
497 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0196651  normal  0.750838 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2756  outer membrane efflux protein  32.4 
 
 
490 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6520  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.39 
 
 
500 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.128206 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5800  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.23 
 
 
488 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583861 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3688  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.05 
 
 
501 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.235267  normal  0.483752 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2070  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.39 
 
 
498 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0633642  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4161  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.05 
 
 
498 aa  187  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.309156 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2524  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.55 
 
 
489 aa  186  9e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.670028  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0943  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.57 
 
 
506 aa  186  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352161  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1393  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.7 
 
 
461 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1555  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.3 
 
 
515 aa  183  7e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000678777  hitchhiker  0.0000000215879 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1880  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.3 
 
 
515 aa  183  7e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3709  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.75 
 
 
500 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4187  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.75 
 
 
504 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.164619  normal  0.718277 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0412  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.63 
 
 
477 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2799  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.97 
 
 
495 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1099  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.84 
 
 
460 aa  179  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4072  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.4 
 
 
464 aa  179  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4150  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.51 
 
 
472 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4314  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.1 
 
 
502 aa  178  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3486  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.91 
 
 
500 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0233233 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1077  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.65 
 
 
496 aa  177  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512437  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2663  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.63 
 
 
496 aa  176  8e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3783  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.77 
 
 
471 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1728  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.11 
 
 
509 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141114  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>