More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1448 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1448  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 257 aa  529  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55730  AraC family transcriptional regulator  60 
 
 		 267 aa  321  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4855  putative transcriptional regulator  59.2 
 
 		 264 aa  318  7e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0573  AraC family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 264 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4644  AraC family transcriptional regulator  55.95 
 
 		 262 aa  275  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422657  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4909  AraC family transcriptional regulator  55.16 
 
 		 262 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033682 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4730  AraC family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 262 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390984 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4852  AraC family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 262 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0644466 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3337  AraC family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 257 aa  230  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0516036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1526  AraC family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 261 aa  229  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1417  AraC family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 261 aa  229  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17982  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0365  AraC family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 261 aa  226  3e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0791032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0401  putative transcriptional regulator, AraC family  36.51 
 
 		 264 aa  211  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001334  transcriptional regulator AraC family  39.58 
 
 		 240 aa  205  6e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128083  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05224  hypothetical protein  37.2 
 
 		 276 aa  205  7e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0303  AraC/XylS family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 263 aa  198  7e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0409  AraC family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3843  transcriptional regulator, AraC family  41.32 
 
 		 265 aa  195  7e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.419049 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4920  transcriptional regulator, AraC family  41.32 
 
 		 265 aa  195  7e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.94136 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1092  AraC/XylS family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 259 aa  192  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0925  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 259 aa  192  6e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0926  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 259 aa  189  5e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0961  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 259 aa  189  5e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.634145 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3387  AraC/XylS family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 277 aa  186  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0927  helix-turn-helix domain-containing protein  36.51 
 
 		 259 aa  185  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0696  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 276 aa  182  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1611  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  35.89 
 
 		 275 aa  179  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.269856  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0910  helix-turn-helix domain-containing protein  35.8 
 
 		 258 aa  178  7e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3380  transcriptional regulator, AraC family  35.39 
 
 		 258 aa  178  8e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3453  helix-turn-helix domain-containing protein  35.39 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3577  AraC family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 258 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.186564 
 
 
-
 
NC_003296  RS02197  transcriptional regulator transcription regulator protein  38.59 
 
 		 271 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3559  transcriptional regulator, AraC family  37.35 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1909  AraC family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 263 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6500  AraC family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 294 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  34.36 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4158  putative transcriptional regulator  35.65 
 
 		 295 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  35.24 
 
 		 264 aa  151  8e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3244  AraC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 325 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4919  AraC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 325 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  34.75 
 
 		 264 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.112276 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3853  transcriptional regulator, AraC family protein  29.88 
 
 		 262 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  30.99 
 
 		 258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 278 aa  144  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3128  AraC family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.030776  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  33.86 
 
 		 292 aa  143  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4912  AraC family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  31.78 
 
 		 265 aa  142  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  29 
 
 		 268 aa  141  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 247 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1171  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 268 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0384814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  33.85 
 
 		 260 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0415  transcriptional regulator, AraC family  31.93 
 
 		 269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  33.99 
 
 		 267 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  32.89 
 
 		 273 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 275 aa  139  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 284 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  33.33 
 
 		 278 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3997  AraC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.415557 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5836  transcriptional regulator, AraC family  32.37 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248139  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0583  AraC family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  33.19 
 
 		 267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 257 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 277 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 279 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1876  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0622  helix-turn-helix domain-containing protein  32.53 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0628  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458217  hitchhiker  0.000431435 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 277 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 277 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1402  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4581  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0126281 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1853  transcriptional regulator, AraC family  31.84 
 
 		 272 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0722482  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0610  helix-turn-helix, AraC type  30.67 
 
 		 259 aa  132  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  33.93 
 
 		 278 aa  132  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0820  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01759  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.29 
 
 		 273 aa  132  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 278 aa  132  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01747  hypothetical protein  32.29 
 
 		 273 aa  132  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1843  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 273 aa  132  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.34721  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 265 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4106  AraC family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.302836  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  31.47 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>