More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0532 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0532  outer membrane efflux protein  100 
 
 
578 aa  1161    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52231  normal  0.0114882 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0515  outer membrane efflux protein  100 
 
 
578 aa  1161    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  52.98 
 
 
565 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  43.28 
 
 
731 aa  347  4e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  42.38 
 
 
635 aa  343  4e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  39.4 
 
 
972 aa  324  3e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  39.04 
 
 
525 aa  306  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  47.26 
 
 
627 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  35.42 
 
 
576 aa  228  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2330  RND family outer membrane efflux protein  33.07 
 
 
594 aa  207  3e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02231  RND family outer membrane efflux protein  36.78 
 
 
577 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0360  RND family outer membrane efflux protein  34.2 
 
 
574 aa  192  1e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1465  outer membrane efflux protein  28.51 
 
 
526 aa  153  7e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.505044  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01671  RND family outer membrane efflux protein  27.51 
 
 
526 aa  150  7e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01101  RND family outer membrane efflux protein  26.13 
 
 
505 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1181  Outer membrane protein-like  25 
 
 
606 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01091  RND family outer membrane efflux protein  26.27 
 
 
476 aa  111  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01121  RND family outer membrane efflux protein  25.61 
 
 
475 aa  106  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01131  RND family outer membrane efflux protein  25.3 
 
 
475 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245379  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0101  RND family outer membrane efflux protein-like  25.17 
 
 
477 aa  99.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.87226  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  25.19 
 
 
435 aa  93.6  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  26.65 
 
 
491 aa  93.6  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  27.07 
 
 
461 aa  87  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  25.43 
 
 
453 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  24.31 
 
 
467 aa  85.9  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  22.15 
 
 
458 aa  84.7  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  24.41 
 
 
435 aa  84.3  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  24.12 
 
 
427 aa  83.6  0.000000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  28.88 
 
 
482 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  25.66 
 
 
433 aa  80.9  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  26.11 
 
 
497 aa  80.5  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  26.77 
 
 
535 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  26.7 
 
 
471 aa  79.3  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  26.11 
 
 
1496 aa  77.8  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  22.02 
 
 
470 aa  77  0.0000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  26.74 
 
 
439 aa  75.5  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  22.93 
 
 
496 aa  74.3  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  21.82 
 
 
441 aa  73.9  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1773  outer membrane efflux protein  20.05 
 
 
435 aa  73.6  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  22.55 
 
 
417 aa  72.4  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  25.8 
 
 
431 aa  71.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  25.4 
 
 
431 aa  71.2  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  23.7 
 
 
515 aa  69.7  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  24.05 
 
 
446 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  24.6 
 
 
472 aa  68.6  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  23.99 
 
 
455 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  24.89 
 
 
419 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  21 
 
 
418 aa  68.2  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  23.75 
 
 
443 aa  67.8  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  24.31 
 
 
460 aa  67.4  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.99 
 
 
463 aa  67.4  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  26.65 
 
 
459 aa  67.4  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  23.09 
 
 
1470 aa  67  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  22.69 
 
 
453 aa  67  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5239  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.93 
 
 
488 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1746  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.25 
 
 
446 aa  65.5  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0453  Outer membrane efflux protein  21.54 
 
 
470 aa  65.5  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  23.08 
 
 
446 aa  65.1  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  27.11 
 
 
449 aa  64.3  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.54 
 
 
497 aa  64.3  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 
426 aa  63.9  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  22.4 
 
 
425 aa  63.9  0.000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0699  hypothetical protein  24.94 
 
 
489 aa  63.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.19 
 
 
488 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.19 
 
 
497 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  25.57 
 
 
447 aa  62.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  22.96 
 
 
503 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.64 
 
 
495 aa  62.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1941  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.75 
 
 
497 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.211357  normal  0.0401761 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  21.14 
 
 
463 aa  61.6  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0785  Outer membrane efflux protein  25.8 
 
 
453 aa  61.6  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0455  outer membrane efflux protein  26.54 
 
 
463 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0456  outer membrane efflux protein  26.54 
 
 
456 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2035  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.74 
 
 
486 aa  61.6  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152355  normal  0.152355 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  24.1 
 
 
462 aa  60.8  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  24.44 
 
 
419 aa  60.8  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1475  outer membrane efflux protein  20.91 
 
 
449 aa  60.8  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.236212  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0719  hypothetical protein  24.7 
 
 
479 aa  59.7  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  26.23 
 
 
455 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3558  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.79 
 
 
472 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5432  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.95 
 
 
553 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199925  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0836  outer membrane efflux protein  25.66 
 
 
446 aa  60.1  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  23.1 
 
 
421 aa  58.9  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2924  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.16 
 
 
511 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2560  outer membrane efflux protein  24.07 
 
 
438 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5578  outer membrane efflux protein  24 
 
 
451 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.46516 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2098  putative outer membrane protein tolC  27.67 
 
 
456 aa  58.5  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  24.18 
 
 
435 aa  58.2  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1994  outer membrane efflux protein  23.12 
 
 
495 aa  58.2  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.184092  normal  0.0261874 
 
 
-
 
NC_003296  RS01780  outer membrane CHANEL lipoprotein  23.98 
 
 
522 aa  57.8  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  24.78 
 
 
441 aa  57.8  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  22.56 
 
 
471 aa  57.8  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  25 
 
 
463 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4508  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.3 
 
 
505 aa  57.4  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0567962 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  24.4 
 
 
421 aa  57.4  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  34.58 
 
 
464 aa  57.4  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2819  outer membrane efflux protein  21.39 
 
 
438 aa  57.4  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  25.41 
 
 
447 aa  57.4  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4072  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.52 
 
 
464 aa  57.4  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2832  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.2 
 
 
520 aa  57  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>